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不结球白菜分蘖性状的发生机理及其候选基因挖掘

摘要第7-10页
ABSTRACT第10-13页
缩略词表第14-16页
前言第16-18页
第一章 文献综述第18-36页
    1 植物茎分枝的研究进展第18-28页
        1.1 植物茎分枝的定义和分类第18-20页
        1.2 植物茎分枝的生物学意义第20页
        1.3 植物茎分枝的发生机制第20-22页
        1.4 影响植物茎分枝的主要因素第22-28页
    2 植物数量性状基因效应的遗传研究方法第28-30页
        2.1 世代均数法和遗传方差法第28页
        2.2 混合模型法第28-29页
        2.3 主基因+多基因混合遗传模型的应用第29-30页
    3 高通量测序技术(high-throughput sequencing,HTS)的发展及应用第30-34页
        3.1 高通量测序技术(HTS)在基因组学中的应用第30-31页
        3.2 高通量测序技术(HTS)在转录组学中的应用第31-33页
        3.3 高通量测序技术(HTS)在表观基因组学研究中的应用第33-34页
    4 本研究的依据、目的意义和研究内容第34-36页
        4.1 本研究的依据第34-35页
        4.2 本研究的目的和意义第35页
        4.3 本研究的主要内容第35-36页
第二章 不结球白菜分蘖性状的特点和品质测定第36-46页
    1 材料与方法第37-39页
        1.1 试验材料第37页
        1.2 不结球白菜分蘖性状营养生长期形态学观察第37页
        1.3 不结球白菜分蘖性状发育时期组织切片观察第37页
        1.4 硝态氮含量测定第37-38页
        1.5 可溶性糖含量测定第38页
        1.6 可溶性蛋白含量测定第38-39页
        1.7 V_c含量测定第39页
    2 结果与分析第39-43页
        2.1 不结球白菜分蘖性状表型特点第39-41页
        2.2 不结球白菜分蘖性状组织细胞学特点第41-43页
        2.3 不结球白菜分蘖菜与不分蘖菜品质相关的生理指标比较分析第43页
    3 讨论第43-46页
第三章 激素对不结球白菜分蘖性状的影响第46-60页
    1 材料和方法第47-52页
        1.1 试验材料第47-48页
        1.2 试验方法第48-52页
    2 结果与分析第52-57页
        2.1 '苏州青'和'马耳头'茎分生组织中内源激素含量动态分析第52-53页
        2.2 独脚金内酯和细胞分裂素对'马耳头'侧芽的互作关系第53-54页
        2.3 独脚金内酯响应基因和细胞分裂素响应基因的表达差异第54-57页
    3 讨论第57-60页
第四章 不结球白菜分蘖数和叶片数的遗传模型分析第60-74页
    1 材料与方法第61-62页
        1.1 试验材料与田间试验设计第61页
        1.2 统计分析方法第61-62页
    2 结果与分析第62-72页
        2.1 六世代遗传群体分蘖数和叶片数的统计分析第62-65页
        2.2 F_2群体的次数分布第65-66页
        2.3 遗传模型的选择及适合性检验第66页
        2.4 遗传参数估计第66-72页
        2.5 分蘖数与叶片数的相关性分析第72页
    3 讨论第72-74页
第五章 不结球白菜分蘖性状BSA-简化基因组测序分析及候选基因筛选第74-94页
    1 材料和方法第75-79页
        1.1 试验材料第75-76页
        1.2 样品DNA的提取第76-77页
        1.3 简化基因组测序实验流程第77页
        1.4 简化基因组信息分析方法第77页
        1.5 RNA的提取第77-78页
        1.6 cDNA合成及定量实验第78-79页
    2 结果与分析第79-91页
        2.1 测序数据评估及SLAF标记开发第79-81页
        2.2 群体差异分析及关联性分析第81-84页
        2.3 A级区域中292个基因的转录水平分析第84-86页
        2.4 不同发育时期Bra011210基因和Bra011149基因的定量表达分析第86-91页
    3 讨论第91-94页
第六章 不结球白菜分蘖性状SSR分子标记的开发第94-102页
    1 材料和方法第95-98页
        1.1 试验材料第95页
        1.2 试验方法第95-98页
    2 结果与分析第98-100页
        2.1 基于SLAF测序结果的SSR引物的筛选第98-99页
        2.2 SSR分析第99-100页
    3 讨论第100-102页
第七章 不结球白菜分蘖性状转录组学分析第102-122页
    1 材料和方法第103-105页
        1.1 试验材料第103-104页
        1.2 RNA提取第104页
        1.3 cDNA文库的构建和测序第104页
        1.4 无参转录组(De novo transcriptome)数据的从头组装第104-105页
        1.5 数据处理及拼接转录本的功能注释第105页
    2 结果与分析第105-121页
        2.1 转录组测序数据评估及组装第105-106页
        2.2 转录组数据库基因的功能注释及分类第106-109页
        2.3 SSR分析第109-110页
        2.4 基于样本间基因表达的整体分析第110-113页
        2.5 组织特异性基因表达和功能分析第113-117页
        2.6 细胞分裂素合成及信号途径的关键基因的表达分析第117-120页
        2.7 Q-PCR定量验证第120-121页
    3 讨论第121-122页
全文结论第122-124页
本文创新之处第124-126页
参考文献第126-140页
附录第140-150页
在读期间发表的学术论文第150-152页
致谢第152页

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