| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第15-25页 |
| 1.1 引言 | 第15-16页 |
| 1.2 国内外研究进展 | 第16-23页 |
| 1.2.1 厚壁毛竹研究背景 | 第16-17页 |
| 1.2.2 竹类植物基因组学方面的研究进展 | 第17-21页 |
| 1.2.3 转录组学研究进展 | 第21-23页 |
| 1.3 研究目标与主要研究内容 | 第23-24页 |
| 1.3.1 研究目标 | 第23页 |
| 1.3.2 主要研究内容 | 第23-24页 |
| 1.4 研究技术路线 | 第24-25页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第25-35页 |
| 2.1 实验材料 | 第25-26页 |
| 2.2 测序文库制备 | 第26-35页 |
| 2.2.1 主要仪器设备和实验所用试剂 | 第26-27页 |
| 2.2.2 RNA提取准备工作 | 第27页 |
| 2.2.3 总RNA提取 | 第27-28页 |
| 2.2.4 总RNA质量检测 | 第28-30页 |
| 2.2.5 cDNA文库制备 | 第30-32页 |
| 2.2.6 测序文库构建和上机测序 | 第32-34页 |
| 2.2.7 实时定量PCR验证 | 第34-35页 |
| 第三章 转录组测序数据 | 第35-45页 |
| 3.1 测序数据处理与质量控制 | 第35页 |
| 3.2 测序数据质量评价 | 第35-38页 |
| 3.3 转录组数据比对分析 | 第38-44页 |
| 3.3.1 厚壁毛竹转录组数据比对 | 第38-39页 |
| 3.3.2 毛竹对照转录组数据比对 | 第39-40页 |
| 3.3.3 基因表达注释 | 第40-44页 |
| 3.4 本章小结 | 第44-45页 |
| 第四章 基因表达分析 | 第45-52页 |
| 4.1 基因表达数量分析 | 第45-46页 |
| 4.2 基因表达交并集分析 | 第46-49页 |
| 4.3 基因表达量计算（RPKM） | 第49-50页 |
| 4.4 基因表达聚类 | 第50-51页 |
| 4.5 本章小结 | 第51-52页 |
| 第五章 差异表达基因功能注释 | 第52-74页 |
| 5.1 差异表达基因筛选 | 第52-55页 |
| 5.2 差异基因功能注释 | 第55-73页 |
| 5.2.1 差异基因GO功能富集分析 | 第55-64页 |
| 5.2.2 差异基因KEGG Pathway富集分析 | 第64-73页 |
| 5.3 本章小结 | 第73-74页 |
| 第六章 新转录本及可变剪切预测 | 第74-79页 |
| 6.1 新转录本预测 | 第74-75页 |
| 6.2 可变剪切预测 | 第75-76页 |
| 6.3 本章小结 | 第76-79页 |
| 第七章 结论与讨论 | 第79-82页 |
| 7.1 结论 | 第79-80页 |
| 7.2 讨论 | 第80页 |
| 7.3 展望 | 第80-82页 |
| 参考文献 | 第82-92页 |
| 附录 | 第92-101页 |
| 在读期间的学术研究 | 第101-103页 |
| 致谢 | 第103-104页 |
| 详细摘要 | 第104-106页 |