| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-12页 |
| 1 绪论 | 第12-45页 |
| ·问题提出 | 第12-14页 |
| ·蛋白质与运动 | 第12页 |
| ·神经元钙传感蛋白与运动 | 第12-14页 |
| ·研究目的 | 第14页 |
| ·神经元钙传感蛋白综述 | 第14-32页 |
| ·神经元钙传感蛋白家族概述 | 第14-16页 |
| ·神经元钙传感蛋白的分布 | 第16-17页 |
| ·神经元钙传感蛋白的结构 | 第17-20页 |
| ·神经元钙传感蛋白的生理功能 | 第20-22页 |
| ·神经元钙传感蛋白功能发挥的生理学机制 | 第22-32页 |
| ·小结 | 第32-33页 |
| 参考文献 | 第33-45页 |
| 2 研究方法与设计 | 第45-56页 |
| ·分子动力学模拟方法 | 第45-46页 |
| ·自变量数值的确定 | 第46-47页 |
| ·温度的确定 | 第46页 |
| ·NaCl浓度的确定 | 第46-47页 |
| ·参数设置 | 第47-49页 |
| ·系统内部的相互作用 | 第47页 |
| ·系统与外界的相互作用 | 第47-48页 |
| ·周期性边界条件 | 第48-49页 |
| ·操作步骤 | 第49-54页 |
| 参考文献 | 第54-56页 |
| 3 神经元钙传感蛋白抑制运动的分子机制研究——基于温度改变的视角 | 第56-71页 |
| ·引言 | 第56-57页 |
| ·模型和方法 | 第57-58页 |
| ·人类神经元钙传感蛋白的来源 | 第57页 |
| ·分子动力学模拟的参数设置 | 第57-58页 |
| ·分析方法 | 第58页 |
| ·结果与讨论 | 第58-67页 |
| ·神经元钙传感蛋白三个钙离子周围的结构保持稳定 | 第58-59页 |
| ·温度升高时，神经元钙传感蛋白的二级结构保持完整 | 第59-62页 |
| ·温度升高导致蛋白整体结构膨胀 | 第62-64页 |
| ·温度升高使L3更加舒展，更多地占据疏水口袋 | 第64页 |
| ·温度升高削弱了L3首尾氨基酸D176和V190之间的联系 | 第64-65页 |
| ·温度升高削弱了N段和C段之间氨基酸的关联，加强了段内氨基酸的联系 | 第65-66页 |
| ·温度升高明显减少了C段盐桥的数量和百分比 | 第66-67页 |
| ·结论与建议 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-71页 |
| 4 NaCl浓度的微小改变对人类神经元钙传感蛋白构象动力学的影响 | 第71-83页 |
| ·引言 | 第71-72页 |
| ·模型和方法 | 第72-73页 |
| ·人类神经元钙传感蛋白的来源 | 第72页 |
| ·分子动力学模拟的参数设置 | 第72页 |
| ·分析方法 | 第72-73页 |
| ·结果与讨论 | 第73-80页 |
| ·NaCl浓度升高，神经元钙传感蛋白的二级结构保持完整 | 第73-76页 |
| ·NaCl浓度升高导致蛋白整体结构和疏水口袋同时膨胀 | 第76-77页 |
| ·NaCl浓度升高，L3更倾向于蜷缩在疏水口袋中 | 第77页 |
| ·NaCl浓度升高明显削弱了L3首尾氨基酸D176和V190之间的联系 | 第77-78页 |
| ·NaCl浓度升高减弱了N段和C段之间氨基酸的关联，但段内氨基酸的联系加强 | 第78-79页 |
| ·NaCl浓度升高明显减少了盐桥的数量和百分比，尤其是C段 | 第79-80页 |
| ·结论与建议 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-83页 |
| 5 C端尾部对人类神经元钙传感蛋白构象动力学的影响 | 第83-97页 |
| ·引言 | 第83-84页 |
| ·模型和方法 | 第84-85页 |
| ·人类神经元钙传感蛋白及截去L3突变体的来源 | 第84页 |
| ·分子动力学模拟的参数设置 | 第84-85页 |
| ·分析方法 | 第85页 |
| ·结果与讨论 | 第85-94页 |
| ·NCS-1~(Δ176-190)突变体保持了二级结构，但改变了C段和远端N段的动力学 | 第85-89页 |
| ·NCS-1~(Δ176-190)突变体蛋白整体结构和疏水口袋同时膨胀 | 第89-92页 |
| ·截去L3明显改变了C段的盐桥网络 | 第92-93页 |
| ·截去L3明显削弱了N段和C段之间氨基酸的联系，加强了两段内部氨基酸的联系 | 第93-94页 |
| ·结论 | 第94页 |
| 参考文献 | 第94-97页 |
| 6 R102Q突变对人类神经元钙传感蛋白构象动力学的影响 | 第97-112页 |
| ·引言 | 第97-98页 |
| ·模型和方法 | 第98-99页 |
| ·人类神经元钙传感蛋白及R102Q突变体的来源 | 第98页 |
| ·分子动力学模拟的参数设置 | 第98页 |
| ·分析方法 | 第98-99页 |
| ·结果与讨论 | 第99-108页 |
| ·野生型神经元钙传感蛋白二级结构保持完整 | 第99-102页 |
| ·R102Q突变体与野生型神经元钙传感蛋白有类似的整体构象动力学和结构稳定性 | 第102页 |
| ·R102Q突变导致L2和L3柔性降低 | 第102-103页 |
| ·R102Q突变使L3处于伸展状态，更多地占据疏水口袋 | 第103-104页 |
| ·R102Q突变明显影响了N段和C段的盐桥，改变了人类NCS-1 蛋白的表面自由能 | 第104-108页 |
| ·结论 | 第108-109页 |
| 参考文献 | 第109-112页 |
| 7 总结与展望 | 第112-114页 |
| 致谢 | 第114-115页 |
| 博士在读期间的科研工作 | 第115-116页 |
