| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-25页 |
| ·薏苡属的研究进展 | 第10-14页 |
| ·薏苡属的种质及分类学 | 第10-12页 |
| ·薏苡的医药应用研究 | 第12-13页 |
| ·薏苡属的基因组研究 | 第13页 |
| ·薏苡属的细胞遗传学研究 | 第13-14页 |
| ·薏苡属的组织培养研究 | 第14页 |
| ·生物信息学研究进展 | 第14-18页 |
| ·第二代测序技术流程 | 第14-15页 |
| ·第二代测序技术的应用 | 第15-18页 |
| ·基因组内的重复序列 | 第18-23页 |
| ·卫星重复序列及其作用 | 第18-19页 |
| ·转座元件(Transposable elements,TE)及其作用 | 第19-22页 |
| ·重复序列对基因组的影响 | 第22-23页 |
| ·植物多倍化 | 第23-24页 |
| ·多倍化的发生 | 第23页 |
| ·多倍化的后果 | 第23-24页 |
| ·本课题研究意义 | 第24-25页 |
| 第二章 材料和方法 | 第25-42页 |
| ·技术路线 | 第25页 |
| ·材料 | 第25页 |
| ·方法 | 第25-42页 |
| ·北京薏苡及水生薏苡基因组大小估算 | 第25-26页 |
| ·基因组DNA提取 | 第26-27页 |
| ·测序数据获得 | 第27页 |
| ·北京薏苡及水生薏苡基因组结构分析,基因组结构比较分析及近缘种之间基因组结构比较 | 第27-28页 |
| ·分子克隆与测序 | 第28-32页 |
| ·荧光原位杂交(Fluorescent in situ hybridization,FISH) | 第32-35页 |
| ·免疫染色(Immunostaining) | 第35-36页 |
| ·染色质免疫沉淀测序及数据分析 | 第36-41页 |
| ·花粉育性观察 | 第41-42页 |
| 第三章 结果与分析 | 第42-67页 |
| ·北京薏苡及水生薏苡的基因组大小估算 | 第42-43页 |
| ·北京薏苡及水生薏苡的基因组结构 | 第43-45页 |
| ·北京薏苡和水生薏苡重复序列比较 | 第45-50页 |
| ·北京薏苡和水生薏苡卫星重复序列验证 | 第50-51页 |
| ·北京薏苡核型分析 | 第51-54页 |
| ·水生薏苡核型分析 | 第54-60页 |
| ·北京薏苡和水生薏苡的倍性分析 | 第60-61页 |
| ·水生薏苡着丝粒序列分析 | 第61-63页 |
| ·薏苡属、玉米属和高粱属基因组重复序列比较 | 第63-65页 |
| ·北京薏苡和水生薏苡中LTR还原转座子的分类 | 第65-67页 |
| 第四章 讨论 | 第67-70页 |
| ·薏苡属及禾本科中重复序列的动态 | 第67页 |
| ·玉米属、高粱属及薏苡属之间的进化关系 | 第67-68页 |
| ·北京薏苡和水生薏苡的倍性 | 第68-70页 |
| 参考文献 | 第70-76页 |
| 附录 | 第76-96页 |
| 附录Ⅰ 实验所用引物 | 第76-77页 |
| 附录Ⅱ 北京薏苡重复序列及其基因组含量 | 第77-88页 |
| 附录Ⅲ 水生薏苡重复序列及其基因组含量 | 第88-96页 |
| 致谢 | 第96-97页 |
| 个人简介 | 第97页 |
