| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-14页 |
| 第一章 引言 | 第14-26页 |
| ·消落带的形成及甲烷排放 | 第14-16页 |
| ·消落带的形成 | 第14页 |
| ·消落带的污染 | 第14-15页 |
| ·消落带土壤甲烷的排放 | 第15-16页 |
| ·甲烷的厌氧氧化 | 第16-18页 |
| ·甲烷的厌氧氧化类型 | 第16-17页 |
| ·甲烷的厌氧氧化过程中的功能微生物 | 第17-18页 |
| ·铵盐的厌氧氧化 | 第18-20页 |
| ·生物脱氮的原理及在污水处理中的应用 | 第20-23页 |
| ·水污染现状 | 第20页 |
| ·废水生物脱氮的原理和工艺进展 | 第20-21页 |
| ·生物脱氮过程中功能微生物研究 | 第21-23页 |
| ·分子生物学技术在功能微生物研究中的应用 | 第23-24页 |
| ·本研究的目的意义 | 第24-26页 |
| 第二章 三峡库区消落带土壤中M. oxyfera-like和Anammox的生态分布研究 | 第26-54页 |
| ·前言 | 第26页 |
| ·材料与方法 | 第26-35页 |
| ·样品的采集 | 第26-28页 |
| ·样品物理化学性质 | 第28页 |
| ·仪器和试剂 | 第28-29页 |
| ·土壤微生物基因组DNA的提取 | 第29-30页 |
| ·荧光定量PCR基因的选择 | 第30-31页 |
| ·目的基因的荧光定量分析 | 第31-33页 |
| ·多样性分析功能基因选择 | 第33-35页 |
| ·克隆测序 | 第35页 |
| ·统计分析 | 第35页 |
| ·结果分析 | 第35-51页 |
| ·三峡库区消落带描述 | 第35-36页 |
| ·消落带土壤理化性质的测定 | 第36-38页 |
| ·功能微生物丰度研究 | 第38-42页 |
| ·M. oxyfera-like细菌的 16S rRNA基因多样性研究 | 第42-46页 |
| ·M. oxyfera-like细菌的pmoA基因多样性研究 | 第46-49页 |
| ·Anammox细菌的hzsB基因多样性分析 | 第49-50页 |
| ·M. oxyfera-like细菌、Anammox的空间分布和环境因子之间的相关性研究 | 第50-51页 |
| ·小结 | 第51-54页 |
| 第三章 序批式硝化反应器的构建、运行以及联氨对硝化过程的调控作用 | 第54-66页 |
| ·前言 | 第54-55页 |
| ·材料和方法 | 第55-58页 |
| ·反应器构建及运行 | 第55-56页 |
| ·样品来源 | 第56页 |
| ·活性污泥DNA的提取 | 第56页 |
| ·功能基因的选择 | 第56-57页 |
| ·功能微生物荧光定量分析 | 第57-58页 |
| ·微生物功能基因多样性分析 | 第58页 |
| ·结果和讨论 | 第58-65页 |
| ·SBR硝化反应器的运行及联氨对其调控 | 第58-60页 |
| ·联氨对硝化过程中和氮转化有关的主要功能微生物的调控作用 | 第60-62页 |
| ·SBR硝化反应器中氨单加氧酶基因（amoA）多样性研究 | 第62-64页 |
| ·SBR硝化反应器中亚硝酸盐氧化还原酶基因（nxrB）的多样性研究 | 第64-65页 |
| ·小结 | 第65-66页 |
| 第四章 全自养脱氮反应器的构建、运行和联氨的调控作用 | 第66-82页 |
| ·前言 | 第66-67页 |
| ·材料和方法 | 第67-69页 |
| ·反应器的运行 | 第67页 |
| ·样品来源 | 第67页 |
| ·活性污泥基因组DNA的提取 | 第67页 |
| ·功能基因的选择 | 第67-69页 |
| ·功能微生物荧光定量研究 | 第69页 |
| ·微生物功能基因多样性研究 | 第69页 |
| ·基于Illumina高通量测序的微生物群落进化研究 | 第69页 |
| ·结果和讨论 | 第69-79页 |
| ·CANON反应器的运行效果 | 第69-71页 |
| ·联氨对CANON反应器的运行和主要功能微生物的调控作用 | 第71-73页 |
| ·CANON反应器中氨单加氧酶（amoA）基因多样性研究 | 第73-74页 |
| ·CANON反应器中亚硝酸盐氧化还原酶（nxrB）基因多样性研究 | 第74-75页 |
| ·CANON反应器中联氨合酶（hzsA）基因多样性研究 | 第75-76页 |
| ·CANON反应器中微生物群落结构进化研究 | 第76-79页 |
| ·小结 | 第79-82页 |
| 第五章 结论与展望 | 第82-86页 |
| ·结论 | 第82-84页 |
| ·研究展望 | 第84-86页 |
| 参考文献 | 第86-96页 |
| 致谢 | 第96-98页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第98-99页 |
