| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 缩写表及中英文对照 | 第12-13页 |
| 第一章 综述 | 第13-29页 |
| 0 引言 | 第13-14页 |
| 1 禽流感病毒的研究进展 | 第14-15页 |
| ·禽流感病毒的结构与功能研究 | 第14-15页 |
| ·禽流感病毒的进化模式研究 | 第15页 |
| 2 中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-COV）的研究进展 | 第15-17页 |
| ·中东呼吸综合征冠状病毒的结构与功能的研究 | 第16-17页 |
| ·中东呼吸综合征冠状病毒的进化模式研究 | 第17页 |
| 3 鸟类线粒体基因组的研究进展 | 第17-20页 |
| ·鸟类线粒体基因组的结构及遗传特征研究 | 第17-18页 |
| ·鸟类线粒体基因组的重组模式研究 | 第18-19页 |
| ·雁形目鸟类线粒体基因组的研究进展 | 第19-20页 |
| 4 本研究的目的及其意义 | 第20-21页 |
| 参考文献 | 第21-29页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第29-45页 |
| 1 禽流感病毒 H6N1 与中东呼吸综合征冠状病毒分子进化分析 | 第29-32页 |
| ·禽流感病毒 H6N1 的数据收集与分析 | 第29页 |
| ·中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）的数据收集与分析 | 第29-32页 |
| 2 雁形目线粒体基因组分子进化分析 | 第32-41页 |
| ·实验材料 | 第32-33页 |
| ·实验材料的收集及保存 | 第32页 |
| ·主要的实验仪器 | 第32页 |
| ·数据分析软件的使用 | 第32-33页 |
| ·实验方法 | 第33-37页 |
| ·总基因组 DNA 的提取、检测及保存 | 第33页 |
| ·引物的设计 | 第33-34页 |
| ·PCR 的扩增及产物的纯化 | 第34-35页 |
| ·目的片段的克隆及测序 | 第35-37页 |
| ·实验数据的处理 | 第37-38页 |
| ·测序结果的序列校正及拼接 | 第37-38页 |
| ·线粒体全基因组的分区界定 | 第38页 |
| ·线粒体全基因组的结构特征分析 | 第38页 |
| ·雁形目线粒体基因组的分子进化分析 | 第38-41页 |
| ·雁形目线粒体基因组的选择 | 第38页 |
| ·雁形目线粒体基因组重组分析 | 第38-39页 |
| ·雁形目线粒体基因组系统发育分析 | 第39-41页 |
| 参考文献 | 第41-45页 |
| 第三章 实验结果和讨论 | 第45-88页 |
| 1 禽流感病毒 H6N1 基因组重配现象的分子进化研究 | 第45-57页 |
| ·人感染 H6N1 禽流感病毒的重配起源研究 | 第45-55页 |
| ·人感染 H6N1 禽流感病毒的致病性研究 | 第55-57页 |
| 2 中东冠状病毒（MERS-COV）基因组重组现象的分子进化分析 | 第57-64页 |
| ·中东冠状病毒基因重组研究 | 第57-58页 |
| ·中东冠状病毒（MERS-CoV）系统发育研究 | 第58-59页 |
| ·中东冠状病毒（MERS-CoV）基因分型研究 | 第59-63页 |
| ·中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-COV）进化选择模式研究 | 第63-64页 |
| 3 雁形目线粒体基因组重组现象的分子进化研究 | 第64-77页 |
| ·基因组结构与碱基组成 | 第64-68页 |
| ·蛋白质编码基因 | 第68-70页 |
| ·rRNA 基因 | 第70页 |
| ·tRNA 基因 | 第70页 |
| ·非编码控制区 | 第70-73页 |
| ·雁形目线粒体基因组的重组分析 | 第73-77页 |
| 4 讨论 | 第77-81页 |
| ·H6N1 病毒基因组重配现象的分子进化研究 | 第77-78页 |
| ·中东冠状病毒基因组重组现象的分子进化研究 | 第78-79页 |
| ·雁形目线粒体基因组重组现象的分子进化研究 | 第79-81页 |
| 5 结论 | 第81-83页 |
| 参考文献 | 第83-88页 |
| 附件 | 第88-92页 |
| 致谢 (ACKNOWLEDGEMENT) | 第92-93页 |
| 硕士期间发表论文及获奖情况 | 第93-94页 |
