| 致谢 | 第1-7页 |
| 摘要 | 第7-8页 |
| 英文缩略表 | 第8-9页 |
| 1 文献综述 | 第9-21页 |
| ·神经损伤 | 第9-10页 |
| ·神经元的变化 | 第9-10页 |
| ·神经胶质细胞的变化 | 第10页 |
| ·神经再生 | 第10-13页 |
| ·轴突和突触损伤后的反应性 | 第11页 |
| ·生长锥的形成与再生 | 第11-12页 |
| ·受损轴突的再生方式 | 第12页 |
| ·其他与再生相关的因素 | 第12-13页 |
| ·视神经的损伤与再生 | 第13-15页 |
| ·斑马鱼在再生研究中的优势 | 第13-14页 |
| ·斑马鱼的视网膜结构 | 第14页 |
| ·斑马鱼视神经损伤与再生 | 第14-15页 |
| ·miRNA的发现历程 | 第15页 |
| ·动物miRNA的加工过程 | 第15-17页 |
| ·miRNA的特征与命名 | 第17页 |
| ·miRNA表达分析方法 | 第17-18页 |
| ·基因芯片(microarray) | 第17-18页 |
| ·PAGE/Northern Blot | 第18页 |
| ·原位杂交 | 第18页 |
| ·PCR技术 | 第18页 |
| ·miRNA与神经发育与再生 | 第18-19页 |
| ·斑马鱼眼中和视网膜中表达的miRNA | 第19-21页 |
| 2 引言 | 第21-22页 |
| 3 材料与方法 | 第22-26页 |
| ·材料 | 第22页 |
| ·试验动物 | 第22页 |
| ·试验仪器和试剂 | 第22页 |
| ·方法 | 第22-26页 |
| ·视神经损伤 | 第22-23页 |
| ·取材 | 第23页 |
| ·总RNA的提取 | 第23-24页 |
| ·斑马鱼sRNA cDNA文库的构建及测序 | 第24页 |
| ·测序结果的初步分析 | 第24页 |
| ·已知miRNAs的表达 | 第24-25页 |
| ·新miRNAs的鉴定 | 第25-26页 |
| 4 结果与分析 | 第26-43页 |
| ·总RNA样品检测结果 | 第26页 |
| ·测序结果 | 第26-43页 |
| ·原始数据质量分析 | 第26-29页 |
| ·两个文库中共有和特有序列统计分析 | 第29页 |
| ·基因组的比对 | 第29-31页 |
| ·sRNA的分类与注释 | 第31-32页 |
| ·已知miRNAs的鉴定与表达 | 第32-35页 |
| ·已知miRNAs的差异表达分析 | 第35-37页 |
| ·新miRNAs的鉴定 | 第37-40页 |
| ·高丰度及差异表达miRNA靶基因预测、KEGG通路分析和GO term富集 | 第40-43页 |
| 5 讨论 | 第43-47页 |
| ·高通量测序结果的可行性 | 第43页 |
| ·已知miRNAs的鉴定 | 第43-44页 |
| ·新miRNAs的鉴定 | 第44页 |
| ·已知高丰度及差异显著miRNAs的表达分析 | 第44-45页 |
| ·已知高丰度及差异表达miRNAs的靶基因及其功能预测 | 第45-47页 |
| 参考文献 | 第47-52页 |
| ABSTRACT | 第52-54页 |
| 附录 | 第54-55页 |