| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-12页 |
| 插图或附表清单 | 第12-13页 |
| 引言 | 第13-14页 |
| 1 绪论 | 第14-18页 |
| ·蛋白质折叠的研究概况 | 第14-16页 |
| ·研究意义和主要内容 | 第16-17页 |
| ·研究意义 | 第16页 |
| ·主要内容 | 第16-17页 |
| ·论文的组织 | 第17-18页 |
| 2 蛋白质模型 | 第18-22页 |
| ·蛋白质系统建模概述 | 第18页 |
| ·分子仿真软件包SMMP | 第18-19页 |
| ·能量函数和分割能量力场 | 第19-22页 |
| ·能量函数 | 第19-20页 |
| ·分割能量力场 | 第20-22页 |
| 3 并行模拟退火算法 | 第22-38页 |
| ·模拟退火算法概述 | 第22-23页 |
| ·并行群体模拟退火算法(PGSA) | 第23-25页 |
| ·PGSA算法思想 | 第23-24页 |
| ·PGSA执行步骤 | 第24-25页 |
| ·新并行模拟退火算法(NPSA) | 第25-28页 |
| ·仿真试验结果 | 第28-38页 |
| ·PGSA试验结果 | 第29-34页 |
| ·NPSA试验结果 | 第34-38页 |
| 4 并行Wang-Landau算法 | 第38-59页 |
| ·Wang-Landau算法介绍 | 第38-40页 |
| ·Wang-Landau算法理论基础 | 第40-45页 |
| ·并行Wang-Landau算法的几个改进型 | 第45-55页 |
| ·并行Wang-Landau-Annealing算法 | 第45-48页 |
| ·并行Wang-Landau-logT算法 | 第48-52页 |
| ·混合并行Wang-Landau算法 | 第52-55页 |
| ·仿真试验结果 | 第55-59页 |
| 5 总结与展望 | 第59-60页 |
| ·总结 | 第59页 |
| ·展望 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |
| 作者简介及读研期间主要科研成果 | 第65-66页 |