基于复杂网络理论的高血压相关基因分析
摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-11页 |
第一章 绪论 | 第11-21页 |
§1.1 研究背景 | 第11-19页 |
§1.1.1 复杂网络理论的发展 | 第12-14页 |
§1.1.2 高血压疾病的研究 | 第14-15页 |
§1.1.3 复杂网络在生物医学中的应用 | 第15-19页 |
§1.2 本论文的主要内容和结构 | 第19-21页 |
第二章 复杂网络的基础知识 | 第21-34页 |
§2.1 网络的基本概念 | 第21-22页 |
§2.2 网络的统计性质 | 第22-31页 |
§2.2.1 度与度分布 | 第23-26页 |
§2.2.2 度相关性 | 第26-27页 |
§2.2.3 平均路径长度与直径 | 第27-28页 |
§2.2.4 聚集系数 | 第28-29页 |
§2.2.5 中心性指标 | 第29-31页 |
§2.3 基本网络模型 | 第31-33页 |
§2.3.1 规则网络与随机网络 | 第31-32页 |
§2.3.2 小世界网络 | 第32页 |
§2.3.3 无标度网络 | 第32-33页 |
§2.4 本章小结 | 第33-34页 |
第三章 高血压基因表达网络的构建与分析 | 第34-53页 |
§3.1 高血压基因表达网络模型的构建 | 第34-40页 |
§3.1.1 盐敏感性高血压与Dahl大鼠 | 第34-36页 |
§3.1.2 基因表达网络模型 | 第36-40页 |
§3.2 基因表达网络的统计和拓扑特征 | 第40-43页 |
§3.2.1 稀疏性 | 第41页 |
§3.2.2 度分布 | 第41-42页 |
§3.2.3 平均路径长度和聚集系数 | 第42-43页 |
§3.2.4 度相关性 | 第43页 |
§3.3 高血压关键基因的确定 | 第43-52页 |
§3.3.1 三种中心性分析 | 第43-45页 |
§3.3.2 枢纽基因 | 第45-49页 |
§3.3.3 枢纽基因的生物描述 | 第49-52页 |
§3.4 本章小结 | 第52-53页 |
第四章 高血压相关基因与生物学通路网络分析 | 第53-91页 |
§4.1 生物学通路 | 第53-54页 |
§4.2 数据来源 | 第54-56页 |
§4.3 2-模基因-通路网络 | 第56-67页 |
§4.3.1 2-模网络 | 第56-57页 |
§4.3.2 基因-通路网络的构建 | 第57-58页 |
§4.3.3 基因-通路网络的统计和拓扑特征 | 第58-67页 |
§4.4 基于通路信息的基因网络 | 第67-79页 |
§4.4.1 基因网络的构建 | 第67-69页 |
§4.4.2 基因网络的统计和拓扑特征 | 第69-75页 |
§4.4.3 基因网络的模块化分析 | 第75-79页 |
§4.5 基于基因信息的通路网络 | 第79-89页 |
§4.5.1 通路网络的构建 | 第79-80页 |
§4.5.2 通路网络的统计和拓扑特征 | 第80-85页 |
§4.5.3 通路网络的模块化分析 | 第85-88页 |
§4.5.4 讨论 | 第88-89页 |
§4.6 本章小结 | 第89-91页 |
第五章 高血压相关基因与通路的加权网络分析 | 第91-99页 |
§5.1 加权基因网络 | 第91-94页 |
§5.1.1 边权基因网络 | 第91-92页 |
§5.1.2 点权基因网络 | 第92-94页 |
§5.2 加权通路网络 | 第94-98页 |
§5.2.1 边权通路网络 | 第94-96页 |
§5.2.2 点权通路网络 | 第96-98页 |
§5.3 本章小结 | 第98-99页 |
第六章 总结与展望 | 第99-103页 |
§6.1 总结 | 第99-101页 |
§6.2 展望 | 第101-103页 |
附录A | 第103-120页 |
附录B | 第120-122页 |
参考文献 | 第122-135页 |
攻读博士学位期间完成的论文和研究工作 | 第135-137页 |
致谢 | 第137页 |