竹亚科4种竹子NBS类抗病基因类似物的克隆与分子进化分析
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 1 前言 | 第11-18页 |
| ·已克隆抗病基因的结构功能与分类 | 第11-12页 |
| ·RGA在园艺与园林观赏植物中的研究现状 | 第12-15页 |
| ·RGA法克隆抗病基因 | 第12-13页 |
| ·作为一种新型的分子标记，构建遗传图谱 | 第13-14页 |
| ·用于基因定位 | 第14页 |
| ·RGA的进化 | 第14-15页 |
| ·适应性进化与基因转换的研究 | 第15-16页 |
| ·分子钟假说 | 第16页 |
| ·本研究的目的、意义和主要内容 | 第16-18页 |
| 2 材料与方法 | 第18-26页 |
| ·材料与试剂 | 第18页 |
| ·植物材料 | 第18页 |
| ·菌种及载体 | 第18页 |
| ·主要仪器 | 第18页 |
| ·主要生化试剂 | 第18页 |
| ·实验方法 | 第18-23页 |
| ·植物总DNA的提取 | 第18-19页 |
| ·简并引物的设计与退火温度的探索 | 第19-20页 |
| ·PCR扩增与检测 | 第20页 |
| ·PCR产物的回收 | 第20-21页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞的制备（CaCl_2 法） | 第21页 |
| ·PCR产物的连接与转化 | 第21-22页 |
| ·阳性克隆子的鉴定、保存与测序 | 第22-23页 |
| ·数据分析与软件应用 | 第23-26页 |
| ·序列分析 | 第23页 |
| ·构建系统进化树 | 第23页 |
| ·正选择位点的检测 | 第23-25页 |
| ·基因转换的检测 | 第25页 |
| ·分子钟假说的检验 | 第25-26页 |
| 3 结果与分析 | 第26-71页 |
| ·植物总DNA的制备 | 第26页 |
| ·NBS类RGA片段的扩增、克隆和序列分析 | 第26-41页 |
| ·紫竹NBS类RGA片段的扩增、克隆和序列分析 | 第26-32页 |
| ·野龙竹NBS类RGA片段的扩增、克隆和序列分析 | 第32-35页 |
| ·凤尾竹NBS类RGA片段的扩增、克隆和序列分析 | 第35-38页 |
| ·泰竹NBS类RGA片段的扩增、克隆和序列分析 | 第38-40页 |
| ·序列数据总结 | 第40-41页 |
| ·系统进化树的构建与序列分组 | 第41-44页 |
| ·紫竹系统进化树的构建与序列分组 | 第41-42页 |
| ·野龙竹系统进化树的构建与序列分组 | 第42-43页 |
| ·凤尾竹系统进化树的构建与序列分组 | 第43-44页 |
| ·泰竹系统进化树的构建与序列分组 | 第44页 |
| ·核苷酸进化分析 | 第44-61页 |
| ·紫竹核苷酸进化分析 | 第44-56页 |
| ·野龙竹核苷酸进化分析 | 第56-60页 |
| ·凤尾竹核苷酸进化分析 | 第60-61页 |
| ·基因转换的分析 | 第61-63页 |
| ·分子钟假说的检验结果 | 第63-71页 |
| ·紫竹分子钟假说检测结果 | 第63-65页 |
| ·野龙竹分子钟假说检验结果 | 第65-67页 |
| ·凤尾竹分子钟假说检验结果 | 第67-69页 |
| ·泰竹分子钟假说检验结果 | 第69-71页 |
| 4 讨论 | 第71-74页 |
| ·引物的选择与退火温度的探索 | 第71页 |
| ·TIR-NBS | 第71页 |
| ·NBS的功能与假基因 | 第71-72页 |
| ·正选择和强烈清除选择 | 第72-73页 |
| ·基因转换 | 第73-74页 |
| 5 结论 | 第74-76页 |
| 参考文献 | 第76-84页 |
| 个人简介 | 第84-85页 |
| 导师简介 | 第85-86页 |
| 致谢 | 第86-87页 |
| 附录 | 第87-95页 |
| 附录 A | 第87-88页 |
| 附录 B | 第88-89页 |
| 附录 C | 第89-90页 |
| 附录 D | 第90-91页 |
| 附录 E | 第91-92页 |
| 附录 F | 第92-93页 |
| 附录 G | 第93-95页 |
