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固氮施氏假单胞菌一般氮代谢调控蛋白NtrC的功能鉴定

摘要第1-4页
Abstract第4-10页
图目录第10-12页
表目录第12-13页
主要符号表第13-14页
1 文献综述第14-29页
   ·细菌氮代谢调控系统第14-16页
     ·氮同化途径第14-15页
     ·一般氮代谢调控机制第15-16页
   ·NtrC 蛋白的结构与功能分析第16-17页
   ·NtrC 在代谢调控中的功能第17-21页
     ·NtrC 调节氮源的利用第17-18页
     ·NtrC 在固氮细菌中的调控第18-19页
     ·NtrC 参与多种胞外聚合物合成的调控第19-20页
     ·NtrC 在碳氮偶联调控中的作用第20-21页
   ·NtrC 的全局调控机制第21-24页
     ·基因芯片分析大肠杆菌中受 NtrC 调控的基因第22页
     ·恶臭假单胞菌 ntrC 突变株的转录组研究第22-23页
     ·沼泽红假单胞菌 ntrBC 突变株的转录组分析第23-24页
   ·NtrC 表达与调控第24-29页
     ·NtrC 对靶基因的转录调控第24-27页
     ·NtrC 自身的表达调控第27-29页
2 引言第29-32页
   ·研究的目的及意义第29-30页
   ·主要研究内容第30-31页
     ·ntrC 基因的缺失突变株和功能互补株的构建第30页
     ·ntrC 突变株功能鉴定第30页
     ·表型相关基因表达差异的研究第30页
     ·NtrC 调控机制的初步研究第30-31页
   ·技术路线第31-32页
3 材料与方法第32-55页
   ·实验材料与仪器第32-38页
     ·菌株和质粒第32页
     ·培养基和接种液第32-34页
     ·酶类和生化试剂第34页
     ·主要仪器设备第34-35页
     ·常用溶液第35-38页
   ·方法第38-55页
     ·细菌基因组 DNA 的提取第38页
     ·大肠杆菌质粒 DNA 的提取第38页
     ·PCR 反应第38-43页
     ·高保真 Taq 酶扩增产物末端加 A 方法第43页
     ·DNA 片段的回收与纯化第43页
     ·酶切及连接反应第43-44页
     ·连接产物的转化第44-45页
     ·三亲结合实验第45页
     ·生长曲线的测定第45-46页
     ·PMs 分析野生型与突变株对氮源的利用情况第46页
     ·固氮酶活的测定第46-47页
     ·全细胞蛋白含量的测定第47-48页
     ·反硝化能力的测定第48页
     ·趋化实验第48页
     ·Biolog 分析野生型与突变株的碳源代谢谱第48-49页
     ·氧胁迫耐受实验第49页
     ·RNA 的提取第49-50页
     ·cDNA 链的合成第50页
     ·实时荧光定量 PCR 反应第50-51页
     ·融合蛋白的表达第51-52页
     ·融合蛋白的纯化第52页
     ·聚丙烯酰胺凝胶电泳第52-53页
     ·Western Blot 杂交检测第53-55页
4 结果与分析第55-81页
   ·施氏假单胞菌 A1501 NtrC 与其它菌中同源蛋白的进化分析第55-56页
   ·ntrC 缺失突变株的构建第56-60页
     ·缺失突变株的构建原理第56-57页
     ·ntrC 基因重组载体的构建第57-58页
     ·ntrC 缺失突变株的筛选与验证第58页
     ·ntrC 功能互补菌株的构建第58-60页
   ·ntrC 突变株表型鉴定第60-73页
     ·ntrC 基因突变对 A1501 生长的影响第60-61页
     ·PMs 分析 ntrC 基因突变后对氮源的利用情况第61-62页
     ·不同氮源培养条件下细菌总 RNA 的提取第62-63页
     ·硝酸盐和尿素利用相关基因表达的表达第63-64页
     ·ntrC 突变对固氮酶活性的影响第64-65页
     ·固氮条件下细菌总 RNA 的提取第65页
     ·氮代谢相关基因表达差异分析第65-66页
     ·反硝化能力的测定第66-67页
     ·NtrC 与 CbrB 在固氮酶活上的偶联调节第67-69页
     ·ntrC 突变对细胞趋化能力的影响第69-70页
     ·野生型与突变株的底物代谢谱测定第70-71页
     ·ntrC 基因缺失增强氧胁迫耐受性第71-72页
     ·氧胁迫条件下抗氧胁迫相关基因的表达第72-73页
   ·NtrC 蛋白的表达和纯化第73-78页
     ·NtrC 蛋白表达载体的构建第73-75页
     ·NtrC 蛋白的融合表达第75页
     ·NtrC 蛋白的纯化第75-76页
     ·质谱分析第76-77页
     ·Western Blot 检测 NtrC 的表达第77-78页
   ·NtrC 靶标基因结合位点的分析第78-80页
   ·预测 A1501 中 NtrC 介导的固氮调控机制第80-81页
5 结论与讨论第81-82页
参考文献第82-92页
致谢第92-93页
作者简介第93页

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