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仿刺参Apostichopus japonicus基因组BAC文库的构建研究

摘要第1-6页
Abstract第6-12页
前言第12-13页
第一章 文献综述第13-30页
 0 引言第13页
 1 大片段基因组文库的产生和发展第13-21页
   ·基因组文库概述第13页
   ·第一代克隆载体第13-15页
     ·λ噬菌体载体第13-14页
     ·粘粒(Cosmid)载体第14页
     ·Fosmid 载体第14-15页
   ·第二代克隆载体第15-19页
     ·酵母人工染色体第15页
     ·细菌人工染色体第15-19页
     ·P1 噬菌体人工染色体第19页
   ·第三代克隆载体第19-21页
 2 大片段基因组文库的构建第21-24页
   ·高分子量(HMW)DNA 的制备第21-22页
   ·载体的制备第22页
   ·HMW DNA 的部分酶切第22页
   ·大片段 DNA 的选择及回收第22页
   ·大片段 DNA 的连接和转化第22-23页
   ·阳性克隆的挑取、保存及筛选第23页
   ·文库的质量鉴定第23页
   ·脉冲场凝胶电泳第23-24页
 3 大片段基因组文库的应用第24-28页
   ·绘制基因图谱第24-27页
     ·绘制物理图谱第24-26页
       ·细胞遗传学图谱第24-25页
       ·限制酶切图谱第25页
       ·叠连群图谱第25-26页
     ·绘制遗传连锁图谱第26-27页
   ·基因的图位克隆第27页
   ·BAC 文库在全基因组序列测定中的应用第27页
   ·BAC 在转基因中的应用第27-28页
 4 本研究立题依据和意义第28-30页
第二章 仿刺参基因组大小的测定第30-40页
 0 引言第30-31页
 1 材料与方法第31-32页
   ·材料第31页
   ·试剂与仪器第31页
   ·方法第31-32页
     ·刺参单细胞悬液的制备第31页
     ·细胞的固定和染色第31-32页
     ·流式细胞仪检测第32页
 2 结果第32-36页
   ·样品测定第32-35页
     ·单独样品测定第32页
     ·混合样品测定第32-33页
     ·样品 PI 染色后荧光显微检测第33-34页
     ·刺参基因组大小测定第34-35页
   ·不同海参分类单元的 C-值大小比较第35-36页
 3 讨论第36-40页
   ·基因组含量测定发展历程及方法比较第36-37页
   ·基因组大小与生理因子和环境因子的关系第37-38页
   ·海参基因组大小的测定第38-40页
第三章 仿刺参基因组 BAC 文库的构建第40-62页
 0 引言第40页
 1 材料与方法第40-54页
   ·材料第40页
   ·菌株和载体质粒第40页
   ·试剂、耗材及主要仪器设备第40-45页
   ·方法第45-54页
     ·高分子量(HMW)DNA 提取第45-47页
     ·预电泳第47-48页
     ·大片段基因组 DNA 部分酶切最佳酶切用量的确定第48-49页
     ·HMW DNA 的大量酶切第49-50页
     ·大片段 DNA 的第一次片段选择第50-51页
     ·大片段 DNA 的第二次片段选择第51-52页
     ·插入大片段 DNA 与载体 DNA 的连接第52-53页
     ·连接产物的电转化第53页
     ·文库的保存第53-54页
 2 结果第54-58页
   ·大片段 DNA 的提取第54-55页
   ·最佳酶切用量的确定第55页
   ·大片段 DNA 两次片段选择第55-56页
   ·连接和转化第56-57页
   ·文库保存第57-58页
 3 讨论第58-61页
   ·琼脂糖包埋法制备 DNA第58页
   ·大片段 DNA 的酶切第58页
   ·电洗脱第58-59页
   ·连接与电转化第59-61页
 附第61-62页
第四章 仿刺参基因组 BAC 文库的质量鉴定第62-68页
 0 引言第62页
 1 材料与方法第62-64页
   ·插入片段大小检测第62-63页
   ·插入片段稳定性检测第63-64页
 2 结果与分析第64-67页
   ·平均插入片段大小、空载率和基因组覆盖率第64-66页
   ·BAC 克隆插入片段稳定性第66-67页
 3 讨论第67-68页
展望第68-69页
参考文献第69-77页
致谢第77-79页
个人简历第79页
发表的学术论文第79页

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