麻栎的谱系地理学和遗传多样性研究
| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 第一章 绪论 | 第12-20页 |
| 1.1 栎属物种及麻栎概况 | 第12-14页 |
| 1.1.1 栎属简介及研究现状 | 第12-13页 |
| 1.1.2 麻栎简介及其研究现状 | 第13-14页 |
| 1.2 谱系地理学概况 | 第14-16页 |
| 1.2.1 谱系地理学简介和应用 | 第14页 |
| 1.2.2 谱系地理学相关理论 | 第14-16页 |
| 1.3 遗传多样性 | 第16页 |
| 1.4 分子标记技术及其应用 | 第16-17页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第17-20页 |
| 第二章 基于叶绿体DNA片段的麻栎谱系地理学研究 | 第20-48页 |
| 2.1 实验材料和仪器试剂 | 第20-22页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第20页 |
| 2.1.2 实验仪器和试剂 | 第20-22页 |
| 2.2 实验方法 | 第22-25页 |
| 2.2.1 麻栎总DNA的提取 | 第22-23页 |
| 2.2.2 基因组DNA的纯度检测 | 第23-24页 |
| 2.2.3 PCR扩增和产物测序 | 第24-25页 |
| 2.3 数据处理和分析 | 第25-29页 |
| 2.3.1 序列处理和相关指数计算 | 第25页 |
| 2.3.2 遗传结构分析 | 第25-26页 |
| 2.3.3 单倍型亲缘关系 | 第26-27页 |
| 2.3.4 居群动态历史 | 第27页 |
| 2.3.5 分化时间估算 | 第27-28页 |
| 2.3.6 生态位构建模拟 | 第28-29页 |
| 2.4 实验结果 | 第29-42页 |
| 2.4.1 麻栎的序列特征和单倍型分布特点 | 第29-33页 |
| 2.4.2 麻栎居群的遗传结构 | 第33-34页 |
| 2.4.3 麻栎单倍型间的亲缘关系 | 第34-38页 |
| 2.4.4 麻栎居群的动态历史 | 第38-40页 |
| 2.4.5 基于系统发育的分化时间估计 | 第40页 |
| 2.4.6 生态位模拟 | 第40-42页 |
| 2.5 讨论 | 第42-48页 |
| 2.5.1 麻栎居群的遗传多样性和遗传分化 | 第42-43页 |
| 2.5.2 麻栎的系统发育和种内分化 | 第43-44页 |
| 2.5.3 麻栎单倍型分布特征和亲缘关系 | 第44-45页 |
| 2.5.4 冰期避难所推测和冰期后扩张 | 第45-48页 |
| 第三章 基于核SSR的麻栎遗传多样性研究 | 第48-80页 |
| 3.1 实验材料和仪器试剂 | 第48-49页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第48页 |
| 3.1.2 实验仪器和试剂 | 第48-49页 |
| 3.2 实验方法 | 第49-52页 |
| 3.2.1 麻栎样品DNA提取和检测 | 第49页 |
| 3.2.2 PCR扩增和测序 | 第49-51页 |
| 3.2.3 检测扩增产物条带 | 第51页 |
| 3.2.4 数据统计 | 第51-52页 |
| 3.3 实验分析 | 第52-54页 |
| 3.3.1 遗传变异分析 | 第52-53页 |
| 3.3.2 遗传多样性分析 | 第53页 |
| 3.3.3 遗传分化和遗传结构分析 | 第53-54页 |
| 3.3.4 瓶颈效应检测 | 第54页 |
| 3.4 结果分析 | 第54-75页 |
| 3.4.1 麻栎的遗传变异 | 第54-60页 |
| 3.4.2 麻栎的遗传多样性 | 第60-61页 |
| 3.4.3 麻栎的遗传分化 | 第61-69页 |
| 3.4.4 麻栎居群的遗传结构 | 第69-72页 |
| 3.4.5 瓶颈效应检测 | 第72-75页 |
| 3.5 讨论 | 第75-80页 |
| 3.5.1 麻栎居群的遗传多样性 | 第75-76页 |
| 3.5.2 麻栎居群的遗传结构和遗传分化 | 第76-77页 |
| 3.5.3 冰期避难所推测 | 第77-80页 |
| 结论 | 第80-82页 |
| 参考文献 | 第82-92页 |
| 攻读硕士学位期间取得的科研成果 | 第92-93页 |
| 致谢 | 第93-94页 |
