基于蛋白质相互作用网络及聚类算法的蛋白质功能预测方法研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-17页 |
| ·课题研究背景 | 第9-14页 |
| ·生物信息学的形成与发展 | 第9-10页 |
| ·生物信息数据库建设 | 第10-13页 |
| ·蛋白质相互作用网络 | 第13-14页 |
| ·课题研究意义 | 第14-15页 |
| ·论文的主要研究内容 | 第15-16页 |
| ·论文的结构 | 第16-17页 |
| 第二章 蛋白质功能预测算法相关研究 | 第17-25页 |
| ·蛋白质功能预测计算方法概述 | 第17-19页 |
| ·基于网络的功能预测方法 | 第19-21页 |
| ·基于局部信息的算法 | 第19-20页 |
| ·基于全局优化的算法 | 第20-21页 |
| ·基于模块的算法 | 第21页 |
| ·蛋白质相互作用网络聚类算法 | 第21-23页 |
| ·蛋白质功能分类体系 | 第23页 |
| ·本章小结 | 第23-25页 |
| 第三章 基于蛋白质结构域组合相似性的功能预测 | 第25-37页 |
| ·蛋白质结构域简介 | 第25-26页 |
| ·基于结构域上下文相似性的算法 | 第26-27页 |
| ·结构域组合相似性定义 | 第27-30页 |
| ·实验结果 | 第30-36页 |
| ·评价方法 | 第30-31页 |
| ·测试数据 | 第31-32页 |
| ·结果分析 | 第32-36页 |
| ·本章小结 | 第36-37页 |
| 第四章 基于网络聚类算法的蛋白质功能预测 | 第37-46页 |
| ·直接基于聚类分析的功能预测 | 第37-40页 |
| ·聚类算法实例 | 第37-39页 |
| ·功能预测结果 | 第39-40页 |
| ·基于聚类复合物与结构域组合相似性的功能预测算法 | 第40-41页 |
| ·算法思路 | 第40-41页 |
| ·算法描述 | 第41页 |
| ·实验结果 | 第41-44页 |
| ·本章小结 | 第44-46页 |
| 第五章 总结与展望 | 第46-49页 |
| ·论文研究贡献与创新点 | 第46-47页 |
| ·研究展望 | 第47-49页 |
| 参考文献 | 第49-55页 |
| 致谢 | 第55-56页 |
| 攻读硕士学位期间主要研究成果 | 第56页 |
