| 中文摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 1 前言 | 第10-30页 |
| ·玉米根的形态及研究 | 第10-15页 |
| ·玉米根系 | 第10-11页 |
| ·玉米茎生根的形成过程 | 第11-13页 |
| ·玉米根的研究现状 | 第13-15页 |
| ·玉米根系发育研究现状 | 第13-14页 |
| ·气生根的研究现状 | 第14页 |
| ·生长素对玉米根的影响 | 第14-15页 |
| ·miRNA（microRNA）的研究进展 | 第15-26页 |
| ·miRNA 的概念及特点 | 第15-16页 |
| ·miRNA的发现 | 第16-17页 |
| ·miRNA的生物合成及加工 | 第17-18页 |
| ·miRNA 的作用机制 | 第18-19页 |
| ·靶基因mRNA的剪切降解 | 第18-19页 |
| ·靶基因转录后翻译水平的抑制 | 第19页 |
| ·miRNA 对植物生长发育的调控 | 第19-23页 |
| ·miRNA与根发育 | 第20页 |
| ·miRNA 对植物响应逆境胁迫的调控 | 第20-23页 |
| ·新miRNA的鉴定 | 第23-24页 |
| ·miRNA靶基因的预测以及验证 | 第24-25页 |
| ·miRNA家族 | 第25-26页 |
| ·miRNA家族成员的保守性 | 第25-26页 |
| ·miRNA家族的起源 | 第26页 |
| ·高通量测序技术 | 第26-29页 |
| ·高通量测序技术的产生 | 第26-27页 |
| ·Illumina公司的Solexa测序技术 | 第27-28页 |
| ·高通量测序技术的应用 | 第28-29页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第29-30页 |
| 2 材料与方法 | 第30-40页 |
| ·实验材料 | 第30-32页 |
| ·植物材料 | 第30页 |
| ·酶与各种生化试剂 | 第30页 |
| ·引物 | 第30-32页 |
| ·实验方法 | 第32-40页 |
| ·玉米植株的培养 | 第32页 |
| ·植物 RNA 的提取 | 第32-33页 |
| ·RNA 中基因组 DNA 的去除 | 第33页 |
| ·反转录合成一链cDNA | 第33页 |
| ·Real-Time PCR 体系及反应条件 | 第33-34页 |
| ·小分子 RNA 提取 | 第34-35页 |
| ·miRcute miRNA cDNA 第一链合成 | 第35-36页 |
| ·miRNA 3′末端进行 Poly（A）处理 | 第35页 |
| ·Poly（A）修饰的 miRNA 进行逆转录反应 | 第35-36页 |
| ·成熟 miRNA Real-Time PCR 体系及反应条件 | 第36页 |
| ·MiRNA forward Primer 设计原则： | 第36页 |
| ·成熟 MiRNA 实时定量荧光 PCR 反应体系： | 第36页 |
| ·Solexa 高通量测序技术 | 第36-37页 |
| ·测序结果分析流程 | 第37-38页 |
| ·数据处理及长度分布 | 第38页 |
| ·标签的差异表达分析 | 第38页 |
| ·novel miRNA鉴定 | 第38-39页 |
| ·miRNA靶基因鉴定 | 第39-40页 |
| 3 结果与分析 | 第40-61页 |
| ·Solexa测序的分析 | 第40-43页 |
| ·Solexa测序的表达丰度分析 | 第40-42页 |
| ·序列的基因定位 | 第42-43页 |
| ·保守miRNA的鉴定 | 第43-46页 |
| ·保守miRNA差异表达分析 | 第46-48页 |
| ·差异miRNA的RT验证 | 第48页 |
| ·保守miRNA靶基因的预测 | 第48-50页 |
| ·差异miRNA靶基因的RT验证 | 第50-54页 |
| ·新 miRNA 的鉴定 | 第54-58页 |
| ·新miRNA差异表达分析及qRT-PCR验证 | 第58-61页 |
| 4 讨论 | 第61-63页 |
| 5 结论 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-76页 |
| 致谢 | 第76页 |
