| 致谢 | 第1-4页 |
| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5-6页 |
| 目录 | 第6-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-12页 |
| ·选题意义 | 第8-9页 |
| ·研究现状 | 第9-11页 |
| ·癌症分型的常规方法 | 第9页 |
| ·基因芯片在癌症分型上应用的可行性，必要性和发展前景 | 第9-10页 |
| ·应用基因芯片的癌症分型方法研究现状 | 第10-11页 |
| ·目标和内容 | 第11-12页 |
| 第二章 基因芯片与癌症分型 | 第12-21页 |
| ·基因芯片概述 | 第12-18页 |
| ·基因芯片的原理 | 第13页 |
| ·基因芯片的制备 | 第13-14页 |
| ·样本制备 | 第14-15页 |
| ·基因芯片的检测 | 第15-16页 |
| ·基因芯片数据库 | 第16-18页 |
| ·癌症分型 | 第18-21页 |
| ·急性白血病 | 第18-19页 |
| ·弥漫性大 B细胞淋巴癌 | 第19-21页 |
| 第三章 基因芯片分析方法 | 第21-35页 |
| ·基因芯片的图像处理方法 | 第21-24页 |
| ·平滑滤波 | 第21-22页 |
| ·阵列分割 | 第22-23页 |
| ·靶点分割 | 第23-24页 |
| ·基因芯片的数据分析方法 | 第24-28页 |
| ·数据提取 | 第24-26页 |
| ·数据表达分析 | 第26-28页 |
| ·常用的聚类方法 | 第28-35页 |
| ·模式近似度定义 | 第29-30页 |
| ·非监督聚类算法 | 第30-32页 |
| ·监督聚类算法 | 第32-33页 |
| ·一维聚类的局限性 | 第33-35页 |
| 第四章 基因表达数据的双向聚类方法 | 第35-48页 |
| ·双向聚类的概念和意义 | 第35-36页 |
| ·双向聚类的概念 | 第35-36页 |
| ·双向聚类的意义 | 第36页 |
| ·双向聚类的种类和算法 | 第36-43页 |
| ·“贪婪递归”搜索法 | 第37-39页 |
| ·耦合双向聚类 | 第39-41页 |
| ·光谱双向聚类 | 第41-43页 |
| ·基于系统树图的耦合双向聚类方法 | 第43-48页 |
| ·不一致性系数 | 第44-45页 |
| ·稳定性子类 | 第45-46页 |
| ·基于系统树图的耦合双向聚类方法(HCTWC)搜索过程 | 第46-48页 |
| 第五章 HCTWC算法的实现与验证 | 第48-63页 |
| ·数据预处理 | 第48-51页 |
| ·原始数据格式 | 第48-49页 |
| ·对数处理 | 第49页 |
| ·归一化及缺失数据处理 | 第49-51页 |
| ·HCTWC算法实现 | 第51-52页 |
| ·系统聚类的参数选择 | 第51页 |
| ·稳定性规则 | 第51-52页 |
| ·递归次数 | 第52页 |
| ·HCTWC算法评价 | 第52-63页 |
| ·DLBCL分型 | 第52-58页 |
| ·ALL/ AML分型 | 第58-63页 |
| 第六章 总结与展望 | 第63-65页 |
| ·总结 | 第63-64页 |
| ·结果分析 | 第63-64页 |
| ·总结讨论 | 第64页 |
| ·展望 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-70页 |
| 附录 作者在攻读硕士学位期间完成的论文 | 第70-71页 |