| 中文摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-12页 |
| 1 前言 | 第13-19页 |
| 1.1 土壤盐渍化现状 | 第13页 |
| 1.2 盐胁迫对植物的多重伤害 | 第13-14页 |
| 1.2.1 盐胁迫对光合作用的影响 | 第13-14页 |
| 1.2.2 盐胁迫对水分平衡的影响 | 第14页 |
| 1.2.3 盐胁迫对膜透性的影响及其过氧化伤害 | 第14页 |
| 1.2.4 盐胁迫对物质代谢的影响 | 第14页 |
| 1.3 植物的耐盐机制 | 第14-17页 |
| 1.3.1 渗透调节 | 第14-15页 |
| 1.3.2 离子调节 | 第15-16页 |
| 1.3.3 抗氧化调节 | 第16页 |
| 1.3.4 信号转导机制 | 第16页 |
| 1.3.5 转录调控 | 第16-17页 |
| 1.4 转录组研究概况 | 第17-18页 |
| 1.5 研究目的与意义 | 第18-19页 |
| 2 材料与方法 | 第19-26页 |
| 2.1 试验材料与处理 | 第19页 |
| 2.1.1 试验材料培养 | 第19页 |
| 2.1.2 试验处理 | 第19页 |
| 2.2 试验方法 | 第19-25页 |
| 2.2.1 相对电导率的测定 | 第19页 |
| 2.2.2 MDA含量的测定 | 第19页 |
| 2.2.3 叶绿素含量的测定 | 第19-20页 |
| 2.2.4 根系活力的测定 | 第20页 |
| 2.2.5 菊花根系转录组测序 | 第20-21页 |
| 2.2.5.1 cDNA文库的构建和检测 | 第20页 |
| 2.2.5.2 上机测序 | 第20-21页 |
| 2.2.5.3 生物学信息分析 | 第21页 |
| 2.2.6 实时荧光定量PCR | 第21-22页 |
| 2.2.6.1 菊花根系总RNA提取(TRNzol法) | 第21-22页 |
| 2.2.6.2 定量PCR | 第22页 |
| 2.2.7 离子含量的测定 | 第22-23页 |
| 2.2.8 脯氨酸含量的测定 | 第23页 |
| 2.2.9 可溶性糖含量的测定 | 第23-24页 |
| 2.2.10 过氧化酶活性的测定 | 第24-25页 |
| 2.3 数据分析 | 第25-26页 |
| 3 结果与分析 | 第26-48页 |
| 3.1 菊花耐盐性检测 | 第26-27页 |
| 3.2 菊花根系转录组测序数据分析 | 第27-34页 |
| 3.2.1 测序结果统计分析 | 第27-28页 |
| 3.2.2 组装结果统计分析 | 第28-29页 |
| 3.2.3 Unigene功能注释结果分析 | 第29-32页 |
| 3.2.3.1 NR注释结果分析 | 第29页 |
| 3.2.3.2 KOG注释结果分析 | 第29-30页 |
| 3.2.3.3 KOG注释结果分析 | 第30-31页 |
| 3.2.3.4 KEGG注释结果分析 | 第31-32页 |
| 3.2.4 菊花根系响应盐胁迫DEGs的统计分析 | 第32-33页 |
| 3.2.5 GO和 KEGG富集结果分析 | 第33-34页 |
| 3.3 菊花根系响应盐胁迫相关基因的差异表达分析 | 第34-42页 |
| 3.3.1 Ca~(2+)信号转相关基因差异表达分析 | 第34-35页 |
| 3.3.2 植物激素相关基因的差异表达分析 | 第35-37页 |
| 3.3.3 离子转运及渗透调节相关基因的差异表达分析 | 第37-38页 |
| 3.3.4 抗氧化调节相关基因的差异表达分析 | 第38-39页 |
| 3.3.5 编码重要功能蛋白相关基因的差异表达分析 | 第39-40页 |
| 3.3.6 转录因子的差异表达分析 | 第40-42页 |
| 3.4 候选基因的表达分析 | 第42-45页 |
| 3.5 盐胁迫对菊花根系离子含量的影响 | 第45-46页 |
| 3.6 盐胁迫对菊花根系渗透调节物质含量的影响 | 第46-47页 |
| 3.7 盐胁迫对菊花根系抗氧化物酶活性的影响 | 第47-48页 |
| 4 讨论 | 第48-53页 |
| 4.1 生理生化指标检测菊花耐盐性 | 第48页 |
| 4.2 测序数据分析 | 第48-49页 |
| 4.3 离子转运在菊花根系响应盐胁迫过程中的重要作用 | 第49页 |
| 4.4 渗透调节在菊花根系响应盐胁迫过程中的重要作用 | 第49-50页 |
| 4.5 抗氧化调节在菊花根系响应盐胁迫过程中的重要作用 | 第50-51页 |
| 4.6 菊花根系对盐胁迫的调控网络 | 第51-53页 |
| 5 结论 | 第53-54页 |
| 6 创新点 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-64页 |
| 附录 | 第64-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第66页 |
