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能降解纤维素的富集培养物的宏基因组文库的构建及其新的木聚糖酶基因的克隆、鉴定及表达

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-12页
第一章 前言第12-43页
 1 半纤维素第12-17页
   ·半纤维素的结构第12-14页
   ·半纤维素的水解第14-17页
     ·半纤维素的预处理第15页
     ·半纤维素的酶解第15-17页
 2 木聚糖及木聚糖酶第17-34页
   ·木聚糖及其化学结构第17-18页
   ·木聚糖酶第18-20页
   ·木聚糖酶的分类第20-24页
   ·木聚糖酶的理化特性第24页
   ·木聚糖酶的分子结构第24-28页
   ·木聚糖酶的作用机制第28-30页
   ·极端木聚糖酶第30-33页
   ·木聚糖酶基因的克隆和表达第33-34页
 3 木聚糖酶的应用第34-36页
   ·木聚糖酶在食品、医药行业中的应用第34-35页
   ·木聚糖酶在饲料工业中的应用第35页
   ·木聚糖酶在造纸工业中的应用第35页
   ·木聚糖酶在其它领域中的应用第35-36页
 4 富集培养物第36-37页
 5 宏基因组及宏基因组文库第37-42页
   ·环境微生物宏基因组DNA的提取和纯化第37-38页
   ·宏基因组文库的构建第38页
   ·宏基因组文库的筛选第38-40页
     ·基于功能基因表达的筛选方法第39页
     ·基于化合物结构水平的筛选方法第39页
     ·基于序列特异性的筛选方法第39-40页
   ·宏基因组文库的测序第40-42页
 6 本研究的目的与意义第42-43页
第二章 材料与方法第43-65页
   ·材料第43-47页
     ·环境样品第43页
     ·富集培养物的构建第43页
     ·菌株和质粒第43-44页
     ·菌种保存第44-45页
     ·培养基、培养条件和抗生素第45-46页
       ·培养基第45-46页
       ·培养条件第46页
       ·抗生素第46页
     ·常规试剂、溶液和缓冲液第46-47页
   ·方法第47-65页
     ·质粒提取第47页
     ·DNA的酶切、连接和电泳第47页
     ·电透析洗脱法回收DNA片段第47-48页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备和质粒的转化第48-50页
       ·氯化钙法制备大肠杆菌感受态细胞第48-49页
       ·氯化铷法制备大肠杆菌感受态细胞第49页
       ·转化反应第49-50页
     ·富集培养物宏基因组DNA的提取第50-51页
       ·直接提取法第50页
       ·间接提取法第50-51页
     ·富集培养物的宏基因组DNA的纯化第51页
     ·能降解稻草和滤纸的富集培养物宏基因组文库的构建第51-53页
     ·文库中表达纤维素酶活性克隆的筛选第53页
     ·文库中木聚糖酶基因的克隆第53-54页
     ·GenBank索引号第54页
     ·木聚糖酶Umxyn10A的序列分析第54页
     ·木聚糖酶Umxyn10A的系统发育分析第54-56页
     ·木聚糖酶Umxyn10A的分子建模第56页
     ·木聚糖酶Umxyn10A的能量预测分析第56-57页
     ·PCR引物设计与基因扩增第57页
     ·基因的表达与检测第57页
     ·SDS-PAGE蛋白质电泳第57-59页
       ·SDS-PAGE蛋白质电泳所需的溶液和试剂第57-58页
       ·SDS-PAGE电泳过程第58-59页
     ·蛋白质浓度测定第59-60页
     ·重组蛋白的纯化第60-61页
     ·活性亚克隆表达外切葡聚糖酶的酶谱分析第61页
     ·木聚糖酶的酶活测定第61-64页
       ·木聚糖酶酶活测定第62-63页
       ·木聚糖酶Umxyn10A对p-NPC的酶活力测定第63-64页
     ·糖类的薄层层析第64-65页
第三章 结果与分析第65-97页
   ·能降解稻草和滤纸的富集培养物的宏基因组DNA的提取和纯化第65-67页
     ·能降解稻草和滤纸的富集培养物的构建第65页
     ·能降解稻草和滤纸的富集培养物宏基因组DNA的提取和纯化第65-67页
   ·宏基因组文库的构建第67-68页
   ·富集培养物EC709宏基因组文库的筛选第68-71页
     ·内切葡聚糖酶活性克隆的筛选及转化验证第68-70页
     ·对4-MUC有活性的阳性克隆的筛选及转化验证第70-71页
     ·β-葡萄糖苷酶活性克隆的筛选第71页
   ·活性克隆11210的纤维素酶基因的克隆及序列分析第71-74页
   ·对4-MUC有活性的克隆70981的基因的克隆及序列分析第74-76页
   ·木聚糖酶基因的克隆及序列分析第76-84页
     ·对4-MUC有活性的克隆3621的基因的克隆及序列分析第76-78页
     ·木聚糖酶Umxyn10A与糖苷水解酶家族10的其它木聚糖酶的序列比对分析第78-79页
     ·木聚糖酶Umxyn10A的系统发育分析第79-81页
     ·木聚糖酶Umxyn10A的结构功能域预测第81-82页
     ·木聚糖酶Umxyn10A的分子建模第82-83页
     ·木聚糖酶Umxyn10A的结构能量预测第83-84页
   ·木聚糖酶基因umxyn10A的表达第84-87页
   ·重组木聚糖酶Umxyn10A的酶谱分析第87-88页
   ·木聚糖酶Umxyn10A的纯化第88-89页
   ·重组木聚糖酶Umxyn10A的酶学特性分析第89-97页
     ·pH值对木聚糖酶Umxyn10A酶活力的影响第89-90页
     ·温度对木聚糖酶Umxyn10A酶活力的影响第90-91页
     ·木聚糖酶Umxyn10A的pH耐受性实验第91-92页
     ·木聚糖酶Umxyn10A的热稳定性第92-93页
     ·木聚糖酶Umxyn10A的酶反应动力学常数Km和Vmax测定第93-94页
     ·金属离子、螯合剂、表面活性剂对木聚糖酶Umxyn10A酶活力的影响第94-95页
     ·木聚糖酶Umxyn10A的底物特异性分析第95页
     ·木聚糖酶Umxyn10A对纤维寡糖的作用方式分析第95-97页
第四章 讨论第97-103页
   ·能降解稻草和滤纸的富集培养物的构建第97-98页
   ·宏基因组DNA的提取及其文库的构建、筛选第98页
   ·基因umgs1A、ufncel9E的序列分析第98-99页
   ·木聚糖酶Umxyn10A的序列分析第99-101页
   ·重组木聚糖酶Umxyn10A的酶学特性分析第101-103页
参考文献第103-116页
致谢第116-117页
附录:参与的科研、取得的成果和发表的文章第117-118页

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