| 致谢 | 第1-9页 |
| 摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-13页 |
| 第1章 双向转录基因对研究概述 | 第13-52页 |
| ·基因在染色体上分布的非随机性 | 第13-20页 |
| ·原核生物中基因相对位置的保守性 | 第14-15页 |
| ·真核生物中基因相对位置的保守性 | 第15-17页 |
| ·真核生物中基因非随机分布可能的机制 | 第17-20页 |
| ·一级结构调控 | 第17-18页 |
| ·染色体高级结构的调控 | 第18-20页 |
| ·基因非随机分布的成因与维持 | 第20页 |
| ·双向转录基因对的定义 | 第20-22页 |
| ·双向转录基因对在原陔生物中的研究现状 | 第22-26页 |
| ·双向转录基因对在真核生物中的研究现状 | 第26-35页 |
| ·单个实验让实的双向转录基因对 | 第26-27页 |
| ·全基因组范围上的双向转录基因对研究 | 第27-35页 |
| ·双向转录基因对的统计 | 第28-29页 |
| ·双向转录基因对进化的研究进展 | 第29-30页 |
| ·人类基因组中双向转录基因对的共表达情况 | 第30-31页 |
| ·人类基因组中双向转录基因对的功能分析 | 第31-33页 |
| ·人类基因组双向转录启动子的特点 | 第33-35页 |
| ·双向转录基因对的优势 | 第35-36页 |
| ·双向转录基因对在研究中的应用 | 第36-37页 |
| ·人工设计双向转录启动子调控基因的表达 | 第36-37页 |
| ·利用保守的双向转录基因对预测基因的功能 | 第37页 |
| ·双向转录基因对与疾病的关系 | 第37-40页 |
| ·参考文献 | 第40-52页 |
| 第2章果 蝇基因组中双向转录基因对系统研究及与其他真核生物基因组的比较 | 第52-96页 |
| ·摘要 | 第52-53页 |
| ·引言 | 第53-54页 |
| ·材料与方法 | 第54-61页 |
| ·基因组数据 | 第54-55页 |
| ·双向转录基因对的识别 | 第55页 |
| ·双向转录基因对的进化分析 | 第55-58页 |
| ·双向转录基因对的K_a/K_s值 | 第58页 |
| ·双向转录基因对的共表达 | 第58-59页 |
| ·双向转录基因对的功能分析 | 第59-61页 |
| ·显著富集的功能 | 第59-60页 |
| ·基因对之间的功能相似性 | 第60页 |
| ·双向转录基因对之间的调控关系 | 第60-61页 |
| ·双向转录基因对的启动子区域分析 | 第61页 |
| ·结果与分析 | 第61-81页 |
| ·黑腹果蝇基因组中的双向转录基因对的识别 | 第61-63页 |
| ·其他真核生物基因组中的双向转录基因对的识别及比较 | 第63-66页 |
| ·双向转录基因对的进化 | 第66-68页 |
| ·双向转录基因的选择压力 | 第68-69页 |
| ·双向转录基因对之间共表达调控的程度 | 第69-71页 |
| ·双向转录基因对的功能分类及相似性 | 第71-78页 |
| ·双向转录基因对启动子区域的分析 | 第78-81页 |
| ·讨论 | 第81-84页 |
| ·双向转录基因对分布的广泛性 | 第81页 |
| ·双向转录基因对的进化机制 | 第81-83页 |
| ·真核生物基因组中双向转录启动子的特点 | 第83-84页 |
| ·结论 | 第84-85页 |
| ·参考文献 | 第85-96页 |
| 附录1 表格目录 | 第96-97页 |
| 附录2 插图目录 | 第97-98页 |
| 附录3 发表论文清单 | 第98页 |