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黄瓜cDNA芯片和ESTs技术平台的建立及其在逆境研究中的应用

摘要第1-12页
第一章 前言第12-27页
 1 植物抗逆性研究进展第12-16页
   ·植物抗逆性概述第12-13页
   ·胁迫介导的代谢调整第13-15页
   ·胁迫诱导基因的调控与表达第15-16页
 2 基因芯片在研究植物抗逆性上的应用第16-21页
   ·基因芯片技术原理第17页
   ·基因芯片的种类和特点第17-18页
   ·基因芯片在研究植物抗逆性上的应用第18-21页
 3 表达序列标签(EST)在植物抗逆性研究中的应用第21-25页
   ·EST技术的原理和方法第22页
   ·EST在植物抗逆性研究中的应用第22-25页
 4 本项研究工作的目的与意义第25-27页
第二章 黄瓜生物代谢途径中关键酶基因芯片探针的克隆第27-37页
 1 材料和方法第28-32页
   ·材料与实验处理第28页
   ·方法第28-32页
 2 结果与分析第32-35页
   ·总RNA质量检测结果第32-33页
   ·黄瓜目的基因序列的生物信息学分析第33-34页
   ·基因片段长度分布第34-35页
 3 讨论第35-37页
第三章 黄瓜CDNA芯片的制备第37-45页
 1 材料和方法第37-40页
   ·材料与实验处理第37页
   ·方法第37-40页
 2 结果与分析第40-44页
   ·大规模探针质粒PCR扩增效果检测:第40-41页
   ·大规模探针PCR产物纯化方法的优化:第41页
   ·点样载体的优化选择:第41-42页
   ·芯片质量检测评估:第42-44页
 3.讨论第44-45页
第四章 缺镁胁迫下黄瓜基因差异表达的研究第45-55页
 1 材料和方法第45-50页
   ·材料与实验处理第45-46页
   ·方法第46-50页
 2 结果与分析第50-53页
   ·缺镁对黄瓜光合速率的影响第50页
   ·缺镁对黄瓜叶片基因表达的影响第50-52页
   ·黄瓜cDNA芯片杂交质量评估:第52-53页
 3 讨论第53-55页
第五章 高温胁迫早期黄瓜重要功能基因表达和代谢途径响应的研究第55-64页
 1 材料与方法第55-57页
   ·材料培养及处理第55-56页
   ·实验方法第56-57页
 2 结果第57-61页
   ·黄瓜cDNA芯片杂交结果第57-59页
   ·差异表达基因的功能分类第59-61页
 3 讨论第61-64页
   ·高温胁迫从转录水平改变了黄瓜碳、氮代谢第61-62页
   ·高温胁迫引起酶促防御系统相关基因表达发生变化第62页
   ·高温胁迫引起上调表达的基因第62-64页
第六章 侵染CMV胁迫下黄瓜重要功能基因表达和代谢途径响应的研究第64-77页
 1 材料与方法第65-67页
   ·材料培养及处理第65页
   ·实验方法第65-67页
 2 结果与分析第67-73页
   ·CMV侵染对黄瓜植株生长的影响第67页
   ·CMV侵染对黄瓜植株O_2~-产生速率和H_2O_2含量的变化第67-68页
   ·CMV侵染对黄瓜气体交换和叶绿素荧光参数的影响第68-69页
   ·CMV侵染对黄瓜POD和PAL活性的影响第69页
   ·cDNA芯片杂交数值分析第69-71页
   ·CMV侵染下差异表达基因的功能分类第71-73页
 3 讨论第73-77页
   ·CMV侵染使黄瓜光合、碳水化合物代谢途径发生了变化第73-74页
   ·CMV侵染使氮素代谢途径发生了变化第74-75页
   ·CMV浸染引起酶促防御系统相关基因表达发生变化第75页
   ·CMV浸染引起防卫基因的上调表达第75-77页
第七章 NACL胁迫下的黄瓜根CDNA文库构建及质量分析第77-85页
 1 材料与方法第77-82页
   ·材料培养及处理第77-78页
   ·实验方法第78-82页
 2 结果与分析第82-84页
   ·RNA和cDNA第二链质量检测第82-83页
   ·cDNA文库的质量检测第83-84页
 3 讨论第84-85页
第八章 黄瓜根表达序列标签(ESTS)的获取及盐胁迫相关基因的分析第85-94页
 1 材料与方法第85-87页
   ·材料培养及处理第85-86页
   ·实验方法第86-87页
 2.结果第87-91页
   ·黄瓜根ESTs基本特征第87页
   ·EST序列分析第87-89页
   ·高丰度表达EST分析第89页
   ·假定的盐胁迫相关基因第89-91页
 3.讨论第91-94页
   ·盐胁迫处理的黄瓜根ESTs的特征第91页
   ·涉及盐胁迫耐性相关基因的鉴定第91-94页
第九章 大规模质粒测序影响因素研究第94-102页
 1.材料与方法第94-95页
   ·供试材料第94页
   ·测序步骤第94-95页
 2.结果和分析第95-100页
   ·质粒DNA序列分析第95页
   ·质粒DNA的质量第95-97页
   ·测序反应中模板的加样量第97-99页
   ·电泳条件第99-100页
 3.讨论第100-102页
第十章 主要结论及研究展望第102-105页
 1 主要结论第102-103页
 2 本研究的主要创新点第103-104页
 3 研究展望第104-105页
参考文献第105-118页
ABSTRACT第118-120页

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