| 中文摘要 | 第1-7页 |
| 英文摘要 | 第7-10页 |
| 前言 | 第10-12页 |
| 第一部分 广西 HIV-1 重组流行株env 基因 V3-V4 区序列变异分析 | 第12-31页 |
| 一、实验材料 | 第12-14页 |
| 1. 主要仪器和设备 | 第12页 |
| 2. 主要试剂 | 第12-13页 |
| 3. 主要试剂配制 | 第13页 |
| 4. 主要生物软件和分析工具 | 第13页 |
| 5. 样本来源 | 第13-14页 |
| 二、实验方法 | 第14-19页 |
| 1.D NA 提取 | 第14-15页 |
| 2.H IV-1 基因区扩增 | 第15-18页 |
| 3.P CR 扩增产物鉴定 | 第18页 |
| 4. 扩增产物的回收与纯化 | 第18页 |
| 5.P CR 产物的测序 | 第18页 |
| 6. 序列分析 | 第18页 |
| 7. 统计分析 | 第18-19页 |
| 8. 质量控制 | 第19页 |
| 三、实验结果 | 第19-27页 |
| 1.P CR 扩增和序列鉴定 | 第19-22页 |
| 2. 基因序列分析结果 | 第22-27页 |
| 四、讨论 | 第27-31页 |
| 1. 广西 HIV-1 重组毒株系统树分析 | 第27-28页 |
| 2. 广西重组毒株基因序列变异及其与生物表型和辅助受体预测的分析 | 第28-31页 |
| 第二部分 广西 HIV-1 重组流行株快速基因分型方法的建立 | 第31-48页 |
| 一、材料和方法 | 第31-36页 |
| 1. 主要仪器和设备、试剂、DNA 的提取方法 | 第31页 |
| 2. 样品来源 | 第31-32页 |
| 3.H IV-1 亚型特异性引物的设计 | 第32页 |
| 4.H IV-1env、gag 区基因扩增 | 第32-35页 |
| 5. 扩增片断的检测 | 第35-36页 |
| 6. 基因测序和系统进化树分析 | 第36页 |
| 7. 重复性实验 | 第36页 |
| 二、实验结果 | 第36-45页 |
| 1. 样品基因测序和序列分析结 | 第36-41页 |
| 2. 亚型特异性引物检出结果分析 | 第41-43页 |
| 3. 特异性引物检测其它亚型样品的结果 | 第43页 |
| 4. 特异性引物 PCR 法的重复性 | 第43-44页 |
| 5. 基因测序法与特异性引物 PCR 法比较 | 第44-45页 |
| 三、讨论 | 第45-48页 |
| 1. 亚型特征性位点分析 | 第45页 |
| 2. 结果分析 | 第45-48页 |
| 小结 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-54页 |
| 综述 HIV 基因变异及基因分型方法的研究进展 | 第54-67页 |
| 附录 研究生期间发表的文章 | 第67-68页 |
| 致谢 | 第68页 |
