| 中文摘要 | 第1-5页 |
| 英文摘要 | 第5-8页 |
| 第1章 文献综述 | 第8-23页 |
| ·分子标记及连锁分析在基因克隆中的应用 | 第8-11页 |
| ·定位克隆 | 第8-9页 |
| ·候选定位克隆 | 第9-11页 |
| ·表型克隆 | 第11页 |
| ·遗传标记简介 | 第11-18页 |
| ·RFLP | 第12-13页 |
| ·RAPD | 第13页 |
| ·AFLP | 第13-14页 |
| ·SSR | 第14页 |
| ·STS | 第14页 |
| ·染色体原位杂交 | 第14-15页 |
| ·单核苷酸多态(SNP) | 第15-18页 |
| ·SNP作为遗传标记的优势 | 第15-16页 |
| ·基于SNP的关联研究 | 第16-18页 |
| ·单倍型 | 第18页 |
| ·连锁不平衡简介 | 第18-20页 |
| ·推断单倍型算法介绍 | 第20-23页 |
| ·Clark算法 | 第20-21页 |
| ·EM算法 | 第21页 |
| ·phase算法 | 第21-23页 |
| 第2章 实验及结果分析 | 第23-30页 |
| ·前言 | 第23页 |
| ·方法 | 第23-26页 |
| ·算法准确性评价指标 | 第23-24页 |
| ·计算机模拟方法 | 第24-25页 |
| ·在连锁不平衡基础上EM及phase方法推断个体单倍型准确性的估计 | 第25-26页 |
| ·利用LD对两个位点杂合个体推断准确性的估计 | 第25-26页 |
| ·利用LD对多个位点杂合个体推断准确性的估计 | 第26页 |
| ·结果分析 | 第26-30页 |
| ·LD对三种算法准确性的影响 | 第26-28页 |
| ·公式(7)与EM及phase方法推断单倍型准确性的符合度 | 第28-30页 |
| 第3章 结论与讨论 | 第30-32页 |
| 参考文献 | 第32-38页 |
| 附件1 | 第38-39页 |
| 附件2 | 第39-40页 |
| 附件3 | 第40-44页 |
| 致谢 | 第44页 |