第一章 文献综述 | 第1-28页 |
引言 | 第10页 |
·核心种质的研究概况 | 第10-13页 |
·核心种质概念的提出 | 第10-11页 |
·国内外核心种质研究的进展 | 第11-12页 |
·目前核心种质研究需要解决的问题 | 第12-13页 |
·遗传多样性的研究进展 | 第13-18页 |
·遗传多样性的遗传学基础 | 第14-15页 |
·遗传多样性研究中对数据信息的利用 | 第15-17页 |
·常用遗传多样性的测度指标 | 第17-18页 |
·遗传多样性研究中的问题 | 第18页 |
·专家系统的研究概况 | 第18-26页 |
·专家系统的研究概况 | 第19-24页 |
·专家系统研究的意义与前景 | 第24-25页 |
·专家系统在我国农业领域的发展 | 第25页 |
·专家系统预期可以为核心种质及其遗传多样性研究解决的问题 | 第25-26页 |
·本研究要解决的问题 | 第26-28页 |
第二章 水稻遗传多样性评价及其核心种质取样中SSR位点的选择 | 第28-38页 |
引言 | 第28页 |
·材料与方法 | 第28-30页 |
·实验材料 | 第28-29页 |
·位点组合及核心种质取样 | 第29-30页 |
·数据分析 | 第30页 |
·结果 | 第30-35页 |
·总群体中的遗传多样性与遗传结构 | 第30-31页 |
·不同位点组合所估计的总群体的遗传相似性 | 第31-32页 |
·此群体适宜的取样比例 | 第32-33页 |
·取样比例70%时所得核心种质的遗传相似性和遗传多样性 | 第33-35页 |
·讨论与结论 | 第35-38页 |
·标记的多态性由研究目标和研究对象决定 | 第35-36页 |
·遗传多样性研究和核心种质取样中应着重位点数的选择而不是等位基因数 | 第36-38页 |
第三章 制约核心种质取样中变异保留比例的因素研究 | 第38-56页 |
引言 | 第38页 |
·试验材料与方法 | 第38-42页 |
·模拟取样设计 | 第38-40页 |
·实际取样设计 | 第40-42页 |
·试验结果 | 第42-53页 |
·模拟取样中群体参数和取样参数与变异保留比例的通径分析 | 第42-45页 |
·实际取样中群体参数和取样参数与变异保留比例的相关及通径分析 | 第45-47页 |
·实际取样中原始群体中的变异性与变异保留比例的相关分析 | 第47-53页 |
·讨论与结论 | 第53-56页 |
第四章 核心种质的逐级取样体系研究 | 第56-66页 |
引言 | 第56-57页 |
·试验材料与方法 | 第57页 |
·试验材料及其组成 | 第57页 |
·取样设计 | 第57页 |
·取样结果的比较和分析方法 | 第57页 |
·试验结果 | 第57-64页 |
·逐级取样不同取样方法所得核心种质的多样性指数 | 第57-58页 |
·逐级取样不同取样方法所得核心种质的变异及变幅保留比例 | 第58-64页 |
·逐级取样不同取样方法所得核心种质的变异系数和方差 | 第64页 |
·讨论与结论 | 第64-66页 |
第五章 云南地方稻种资源核心种质的遗传结构、分化和地理系统发生学研究 | 第66-80页 |
引言 | 第66-67页 |
·材料与方法 | 第67-69页 |
·取样层次与DNA提取 | 第67-68页 |
·SSRs标记的扩增及扩增产物的检测 | 第68页 |
·数据分析 | 第68-69页 |
·结果 | 第69-76页 |
·不同同类群中的遗传多样性 | 第70-71页 |
·各同类群中的特异等位基因分布 | 第71-73页 |
·同类群间的遗传分化 | 第73-75页 |
·UPGMA聚类分析 | 第75-76页 |
·讨论 | 第76-80页 |
·SSRs的变异符合SMM(Stepwise Mutation Model)吗? | 第76-77页 |
·云南地方稻种资源的地理发生学 | 第77-78页 |
·云南稻种资源的遗传结构和分化 | 第78-80页 |
第六章 SSRs位点DNA序列与核心种质扩增产物的比较多态性 | 第80-92页 |
引言 | 第80页 |
·材料与方法 | 第80-82页 |
·用于SSRs扩增多态性分析的群体 | 第80-81页 |
·SSRs的检测和多态性分析方法 | 第81页 |
·获取在三个品种中各SSRs位点的DNA序列 | 第81页 |
·三个品种中各SSRs位点上的序列比较和分析 | 第81页 |
·相关分析 | 第81-82页 |
·结果 | 第82-89页 |
·93-11和Nipponbare两个品种内的SSRs序列特征 | 第82-83页 |
·亚种内及亚种间的序列变异 | 第83-84页 |
·亚种间序列变异与93-11及Nipponbare序列特征的相关 | 第84-85页 |
·SSRs扩增多态性和序列特征、序列变异的相关 | 第85-89页 |
·基于扩增多态性的遗传分化与各序列特征、序列变异的相关 | 第89页 |
·讨论 | 第89-92页 |
·我们能从籼稻和粳稻SSRs位点内的序列特征得到点什么信息? | 第89页 |
·栽培稻遗传变异的分子动力学 | 第89-90页 |
·亚种间遗传分化的分子动力学 | 第90页 |
·某些启示 | 第90-92页 |
第七章 核心种质信息处理系统的设计及其主要模块的建立 | 第92-114页 |
引言 | 第92页 |
·系统的总体设计 | 第92-94页 |
·对系统的基本要求 | 第92-93页 |
·系统的基本结构、界面及支持环境 | 第93页 |
·系统的主要功能 | 第93-94页 |
·系统核心功能模块及其用例模型 | 第94-98页 |
·几个功能模块分程序的实现 | 第98-109页 |
·数据的管理与规范化模块的实现 | 第98-100页 |
·统计分析模块的实现 | 第100-102页 |
·遗传多样性分析(Statistic)模块的实现 | 第102-104页 |
·核心种质的取样模块的实现 | 第104-109页 |
·尚未实现的功能模块 | 第109页 |
·系统运行举例 | 第109-114页 |
·模拟估算变异保留比例的运行实例 | 第109-110页 |
·利用聚类进行核心种质取样的运行实例 | 第110-114页 |
第八章 总结和结论 | 第114-118页 |
参考文献 | 第118-128页 |
致谢 | 第128-129页 |
附录3.1 引物序列表 | 第129-131页 |
附录3.2 包含1527份材料的原始群体中各性状或位点的变异量和多样性指数 | 第131-132页 |
附录4.1 逐级取样所得核心种质多样性指数差异显著性的t检验表 | 第132-133页 |
附录4.2 逐级取样所得核心种质变异保留比例差异显著性的t检验表 | 第133-134页 |
附录4.3 逐级取样所得核心种质变幅保留比例差异显著性的t检验表 | 第134-135页 |
附录4.4 逐级取样所得核心种质变异系数差异显著性的t检验表 | 第135-136页 |
附录4.5 逐级取样所得核心种质相对方差差异显著性的t检验表 | 第136-137页 |
附录7.1 核心种质信息处理系统的部分主操作界面 | 第137-140页 |
附录7.2 各功能模块的实体-联系图及其说明 | 第140-147页 |
附录7.3 IPS-CGRCC已完成主要程序的功能及其操作约定 | 第147-150页 |
作者简介 | 第150页 |