1.十八个中国地方猪品种遗传多样性分析 2.猪特定群体定位QTL的效率研究
| 第一部分 十八个中国地方猪品种遗传多样性分析 | 第1-75页 |
| 摘要 | 第9-11页 |
| ABSTRACT | 第11-13页 |
| 1 前言 | 第13-34页 |
| ·中国地方猪品种遗传多样性分析的由来 | 第13-14页 |
| ·猪品种遗传多样性 | 第14-17页 |
| ·世界猪品种资源状况 | 第14-16页 |
| ·中国地方猪品种资源 | 第16-17页 |
| ·中国地方猪品种遗传多样性研究和保护的紧迫性 | 第17页 |
| ·遗传多样性研究的方法 | 第17-21页 |
| ·形态、生理标记 | 第18页 |
| ·染色体标记 | 第18页 |
| ·血型和蛋白质标记 | 第18-19页 |
| ·DNA分子标记 | 第19-21页 |
| ·微卫星标记及其应用 | 第21-27页 |
| ·微卫星的发现 | 第21页 |
| ·微卫星的形成与消亡 | 第21-22页 |
| ·微卫星的类型与分布 | 第22-23页 |
| ·微卫星标记的应用 | 第23-27页 |
| ·中国地方猪品种遗传多样性研究进展 | 第27-33页 |
| ·表型多样性 | 第27页 |
| ·染色体多态性 | 第27-28页 |
| ·血型和蛋白质多样性 | 第28-29页 |
| ·RFLP、PCR-RFLP和AFLP遗传多样性 | 第29-30页 |
| ·RAPD遗传多样性 | 第30-31页 |
| ·DNA指纹图谱遗传多样性 | 第31页 |
| ·微卫星标记遗传多样性 | 第31-32页 |
| ·mtDNA遗传多样性 | 第32-33页 |
| ·研究的目的和意义 | 第33-34页 |
| 2 材料和方法 | 第34-48页 |
| ·实验材料 | 第34-39页 |
| ·样本采集 | 第34-35页 |
| ·微卫星标记 | 第35-37页 |
| ·主要仪器设备 | 第37页 |
| ·主要试剂与配制 | 第37-39页 |
| ·实验方法 | 第39-43页 |
| ·实验流程 | 第39页 |
| ·全血裂解法提取基因组DNA | 第39-40页 |
| ·微卫星标记PCR扩增 | 第40-41页 |
| ·PCR产物检测 | 第41-42页 |
| ·对照个体基因型检测 | 第42-43页 |
| ·统计分析方法 | 第43-48页 |
| ·品种内的遗传变异参数 | 第43-44页 |
| ·品种间的遗传变异参数 | 第44-47页 |
| ·品种分化时间估计方法 | 第47页 |
| ·对个体作品种鉴定的方法 | 第47-48页 |
| 3 结果 | 第48-63页 |
| ·微卫星DNA多态性检测结果 | 第48页 |
| ·微卫星DNA的遗传变异 | 第48-51页 |
| ·各品种内的遗传变异 | 第51-53页 |
| ·品种间的遗传变异 | 第53-60页 |
| ·品种分化时间估计 | 第60页 |
| ·品种鉴定 | 第60-63页 |
| ·个体聚类分析 | 第60页 |
| ·品种鉴定结果 | 第60-63页 |
| 4 讨论 | 第63-72页 |
| ·样本采集 | 第63-64页 |
| ·微卫星检测 | 第64-65页 |
| ·双重PCR扩增 | 第64页 |
| ·微卫星判型 | 第64-65页 |
| ·地方猪品种内遗传变异 | 第65-67页 |
| ·地方猪品种间遗传变异 | 第67-68页 |
| ·品种保护 | 第68-70页 |
| ·品种鉴定 | 第70-72页 |
| ·适合品种鉴定的标记 | 第70页 |
| ·个体聚类分析 | 第70-71页 |
| ·基准群体内个体含量及标记数 | 第71-72页 |
| 5 小结 | 第72-75页 |
| ·本研究的主要结论 | 第72-73页 |
| ·本研究的创新点 | 第73页 |
| ·值得进一步研究的问题 | 第73-75页 |
| 第二部分 猪特定群体定位QTL效率的研究 | 第75-134页 |
| 摘要 | 第75-76页 |
| ABSTRACT | 第76-78页 |
| 1 前言 | 第78-100页 |
| ·猪特定群体定位QTL效率的研究由来 | 第78-79页 |
| ·数量性状基因定位 | 第79-80页 |
| ·猪QTL定位群体 | 第80-81页 |
| ·QTL定位的统计方法 | 第81-85页 |
| ·(多元)线性回归 | 第81-83页 |
| ·最大似然法 | 第83页 |
| ·差异平方回归 | 第83-84页 |
| ·限制性(约化)最大似然法 | 第84-85页 |
| ·贝叶斯方法 | 第85页 |
| ·猪QTL定位的研究进展 | 第85-94页 |
| ·生长、饲料消耗和饲料效率 | 第87-88页 |
| ·胴体性状 | 第88-90页 |
| ·组织性状 | 第90-91页 |
| ·繁殖性状 | 第91-93页 |
| ·其它性状 | 第93-94页 |
| ·QTL精细定位方法 | 第94-97页 |
| ·传递不平衡检测 | 第95-96页 |
| ·传递一致性分析 | 第96页 |
| ·结合连锁分析和连锁不平衡 | 第96-97页 |
| ·猪新品种(系)培育 | 第97-99页 |
| ·研究的目的和意义 | 第99-100页 |
| 2 材料和方法 | 第100-112页 |
| ·群体模拟 | 第100-104页 |
| ·混合效应模型 | 第100-101页 |
| ·群体杂交过程 | 第101页 |
| ·模拟群体(一) | 第101-102页 |
| ·模拟群体(二) | 第102-103页 |
| ·模拟群体(三) | 第103-104页 |
| ·QTL检测方法 | 第104-112页 |
| ·回归分析 | 第104-105页 |
| ·限制性最大似然法定位QTL | 第105-108页 |
| ·个体间标记QTL方差矩阵及逆矩阵 | 第108-112页 |
| 3 结果 | 第112-125页 |
| ·混合效应模型模拟群体的有效性 | 第112-114页 |
| ·群体表型方差随世代的变化 | 第114-118页 |
| ·QTL精细定位 | 第118-125页 |
| 4 讨论 | 第125-132页 |
| ·群体模拟的有效性 | 第125-127页 |
| ·杂交与选择对表型方差变化的影响 | 第127-128页 |
| ·QTL检测方法 | 第128-130页 |
| ·回归分析 | 第128-129页 |
| ·REML求解 | 第129-130页 |
| ·特定群体定位QTL | 第130-131页 |
| ·关于QTL定位的几点思考 | 第131-132页 |
| 5 小结 | 第132-134页 |
| ·本研究的主要结论 | 第132页 |
| ·本研究的创新点 | 第132-133页 |
| ·本研究的不足之处 | 第133-134页 |
| 参考文献 | 第134-149页 |
| 致谢 | 第149-151页 |
| 在读期间发表论文题录 | 第151页 |
