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Mutator转座子介导的玉米叶色突变体侧翼序列的克隆及遗传分析

摘要第1-5页
Abstract第5-10页
1 引言第10-23页
   ·玉米基因组的研究第10-15页
     ·基因组学概念及其研究特点第10页
     ·基于突变体的反向遗传学的功能基因组学研究第10-12页
     ·植物转座子与突变体第12-13页
     ·Mu 因子插入位点侧翼序列的分离方法第13-15页
   ·叶色突变体的创制及基因的克隆第15-22页
     ·叶色突变体遗传及其分子机制第15-18页
     ·PPR 基因家族与叶色突变第18-21页
     ·PB1 结构域与叶色突变第21-22页
   ·本研究的目的及意义第22-23页
2 材料与方法第23-29页
   ·材料第23页
   ·玉米基因组DNA 的提取和纯化第23页
   ·MuDR 序列的扩增第23-24页
   ·突变体表型的测定第24页
   ·MuTAIL-PCR 方法分离插入位点侧翼序列.第24-25页
     ·MuTAIL-PCR 方法扩增侧翼序列第24页
     ·DNA 的回收、连接和测序第24-25页
   ·MuAFLP 方法分离插入位点侧翼序列第25-27页
     ·MuAFLP 方法扩增侧翼序列第25-26页
     ·6%聚丙烯酰胺凝胶电泳检测选择性扩增产物第26页
     ·差异片段的回收第26页
     ·扩增产物的挖胶、回收、连接和测序第26-27页
   ·生物信息学分析第27页
   ·插入位点的真实性验证第27页
   ·候选位点的功能分析第27-28页
   ·Illumina 测序方法分离Mu 因子插入位点侧翼序列第28-29页
3 结果与分析第29-41页
   ·MuDR 检测结果第29页
   ·叶色突变家系的鉴定第29-31页
     ·叶色突变家系表型观察第29-30页
     ·叶色突变家系叶绿素的测定第30-31页
     ·白化分离群体的卡方检验第31页
   ·MuTail-PCR 结果分析第31-35页
     ·MuTail-PCR 扩增结果第31页
     ·侧翼序列的比对、定位第31-32页
     ·Mu 因子插入位点正向重复序列(direct repeat, DR)第32-33页
     ·Mu 因子插入基因位置偏好性第33页
     ·Blast2go 分析插入位点的基因功能第33-35页
   ·MuAFLP 结果分析第35-40页
     ·MuAFLP 扩增结果第35-36页
     ·插入位点的共分离验证第36页
     ·Mu 因子插入位点的分析及功能预测第36-40页
   ·Illumina 测序结果第40-41页
4 讨论第41-45页
   ·利用Mu 突变体库有利于玉米叶色机理的研究第41页
   ·Mu 因子插入位点侧翼序列的分离第41-42页
   ·Mu 因子插入热点的分析第42页
   ·突变位点影响玉米表型的影响第42-44页
     ·PPR 位点突变对玉米表型的影响.第42-43页
     ·P81 结构域突变对玉米表型的影响第43-44页
   ·下一步的研究计划第44-45页
5 结论第45-46页
参考文献第46-52页
附录第52-62页
 附录A 玉米小样DNA 的提取第52页
 附录B 玉米大样DNA 的提取和纯化.第52-53页
 附录C MuTAIL-PCR 反应体系及PCR 程序第53-55页
 附录D DNA 回收第55-56页
 附录E 回收DNA 连接、测序第56-57页
 附录F MuAFLP 反应体系及PCR 程序第57-59页
 附录G 6%聚丙烯酰胺凝胶电泳操作步骤第59-62页
在读期间发表的学术论文第62-63页
作者简历第63-64页
致谢第64-65页

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