| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-13页 |
| 第1章 绪论 | 第13-26页 |
| ·引言 | 第13-14页 |
| ·蛋白质 | 第14-17页 |
| ·蛋白质的组成 | 第14-15页 |
| ·蛋白质的结构 | 第15-17页 |
| ·蛋白质折叠 | 第17-21页 |
| ·蛋白质折叠的计算机模拟 | 第18-20页 |
| ·蛋白质折叠研究问题简述 | 第20-21页 |
| ·蛋白质结构域预测 | 第21-24页 |
| ·蛋白质结构域的定义 | 第21-23页 |
| ·蛋白质结构域数据库 | 第23-24页 |
| ·蛋白质结构域预测问题简述 | 第24页 |
| ·小结 | 第24-26页 |
| 第2章 蛋白质结构分析相关综述 | 第26-38页 |
| ·引言 | 第26页 |
| ·蛋白质折叠的自由能图谱分析 | 第26-30页 |
| ·反应坐标 | 第26-28页 |
| ·自由能图谱分析 | 第28-30页 |
| ·蛋白质结构域预测方法 | 第30-37页 |
| ·基于三维空间结构的预测方法 | 第31-33页 |
| ·基于序列本身的预测方法 | 第33-37页 |
| ·小结 | 第37-38页 |
| 第3章 基于小波分析的Trp-cage蛋白质折叠模拟轨迹分析 | 第38-58页 |
| ·引言 | 第38页 |
| ·蛋白质模拟系统设定 | 第38-40页 |
| ·蛋白质的选取 | 第38-39页 |
| ·计算机模拟系统设置 | 第39-40页 |
| ·正交小波分析方法 | 第40-43页 |
| ·折叠模拟轨迹分析 | 第43-57页 |
| ·反应坐标提取 | 第44-45页 |
| ·小波滤波处理 | 第45-48页 |
| ·中间状态提取 | 第48-50页 |
| ·折叠事件分析 | 第50-55页 |
| ·非完美的色氨酸结构原因分析 | 第55-57页 |
| ·小结 | 第57-58页 |
| 第4章 基于小波分析的lysozyme蛋白质去折叠模拟轨迹分析 | 第58-69页 |
| ·引言 | 第58页 |
| ·蛋白质模拟系统设定 | 第58-60页 |
| ·蛋白质系统设置 | 第58-59页 |
| ·计算机模拟系统设置 | 第59-60页 |
| ·去折叠模拟轨迹分析 | 第60-68页 |
| ·去折叠中的蛋白质结构变化 | 第60-62页 |
| ·基于小波的local contact分析 | 第62-65页 |
| ·ARG-TRP-ARG结构的作用 | 第65-68页 |
| ·小结 | 第68-69页 |
| 第5章 基于BP神经网络的双结构域蛋白质预测方法 | 第69-92页 |
| ·引言 | 第69页 |
| ·数据集准备 | 第69-71页 |
| ·特征属性提取 | 第71-79页 |
| ·二级结构和溶剂可及面积 | 第72页 |
| ·Domain Linker Index | 第72-73页 |
| ·Entropy Index | 第73-74页 |
| ·Flexibility Index | 第74-75页 |
| ·Hydrophobicity Index | 第75页 |
| ·AHNC | 第75-76页 |
| ·RPPI | 第76-78页 |
| ·HSNC | 第78-79页 |
| ·神经网络架构 | 第79-83页 |
| ·BP神经网络结构 | 第79-81页 |
| ·LM学习训练算法 | 第81-82页 |
| ·网络输出后期处理 | 第82-83页 |
| ·预测模型结果分析 | 第83-91页 |
| ·在共同数据集上的结果分析 | 第83-85页 |
| ·与其他方法的比较 | 第85-88页 |
| ·在PPRODO数据集上的结果分析 | 第88页 |
| ·特征属性相对作用分析 | 第88-91页 |
| ·小结 | 第91-92页 |
| 第6章 基于BP神经网络的多结构域蛋白质预测方法 | 第92-109页 |
| ·引言 | 第92页 |
| ·数据集准备 | 第92-95页 |
| ·特征属性提取 | 第95-100页 |
| ·二级结构和溶剂可及面积 | 第95页 |
| ·HSNC | 第95-96页 |
| ·PBWLI | 第96-100页 |
| ·网络架构和后期处理 | 第100-101页 |
| ·预测模型结果分析 | 第101-108页 |
| ·PBWLI结果分析 | 第101-103页 |
| ·BP神经网络结果分析 | 第103-105页 |
| ·与其它方法的比较 | 第105-108页 |
| ·小结 | 第108-109页 |
| 第7章 总结和展望 | 第109-113页 |
| ·本文总结 | 第109-111页 |
| ·未来工作方向 | 第111-113页 |
| 参考文献 | 第113-123页 |
| 作者简历及在学期间所取得的科研成果 | 第123-124页 |
| 致谢 | 第124页 |