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利用分子信标探针熔解曲线技术快速筛查结核分枝杆菌临床分离株中耐乙胺丁醇突变

ABSTRACT第1页
摘要第8-18页
CHAPTER ONE:INTRODUCTION AND LITERATURE REVIEW第18-42页
   ·INTRODUCTION第18-21页
   ·LITERATURE REVIEW第21-42页
     ·Overview of tuberculosis worldwide第21-22页
     ·Treatment of tuberculosis第22页
       ·First line drugs第22页
       ·Second line drugs第22页
     ·Evolution of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis第22-24页
     ·Clinical circumstance for resistance development第24-25页
     ·Compartmentalization of tuberculosis infection第25-26页
     ·Occurrence of mutation in mycobacterium第26-28页
       ·Mutation rate第27页
       ·Mutant antagonism第27-28页
     ·Adaptation of mycobacterium第28-29页
     ·Human studies of resistance emergence第29-30页
     ·Multi-drug resistant tuberculosis and global response on TB surveillance第30-33页
     ·Molecular mechanism of EMB action第33-34页
     ·Molecular mechanisms for the emergence of drug resistance第34-36页
     ·Challenge of embB306 as a marker第36-37页
     ·Molecular methods to detect drug resistance第37-41页
       ·Current methods used worldwide for ethambutol drug-resistance detection第37-41页
     ·Main Objectives of the study第41-42页
CHAPTER TWO:MOLECULAR BEACON PROBE MELTING CURVE ANALYSIS FOR RAPID SCREENING OF ETHAMBUTOL DUG RESISTANCE IN MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS ISOLATES第42-64页
   ·Background第42页
   ·Material and method第42-47页
     ·Principle of methodology第42页
     ·Principle of the original molecular beacon probes第42-43页
     ·Principle of our modified molecular beacon probes melting curve analysis第43-44页
     ·Sample preparation第44-45页
       ·Boiling method第44页
       ·Bio-v DNA extraction Kit:protocol第44-45页
       ·Equipments used during the extraction第45页
     ·Primers and probes第45-46页
     ·Real-time PCR assay第46页
     ·Sensitivity第46页
     ·Specificity第46-47页
     ·Sequencing第47页
     ·Validation of the system第47页
   ·RESULTS第47-60页
     ·Primers and probe choice第47-48页
     ·Allele discrimination第48-50页
     ·Primer ratio optimization第50-52页
     ·Analytical Sensitivity test第52页
     ·Specificity test第52-53页
     ·Clinical samples tests第53-55页
     ·-Sequencing results第55-59页
     ·Drug information第59页
     ·Validation第59-60页
   ·Discussion第60-63页
   ·Conclusion第63-64页
References第64-69页
Acknowledgement第69页

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