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特定基因甲基化研究方法建立及LEAFY基因甲基化与早实枳阶段发育关系研究

摘要第1-9页
Abstract第9-12页
缩略语中英文对照表第12-13页
第一章 前言第13-26页
   ·课题的提出及研究的目的和意义第13-14页
   ·表观遗传学与DNA甲基化第14-15页
   ·CpG岛的定义第15-16页
   ·DNA甲基化与植物发育第16-19页
     ·DNA甲基化与植物开花过程中的基因表达调控第17页
     ·植物胁迫生长调控中的DNA甲基化第17-18页
     ·转座子活性与DNA甲基化第18页
     ·转基因沉默中的DNA甲基化第18-19页
     ·植物组织培养中的DNA甲基化第19页
   ·植物物种的DNA甲基化差异第19-20页
   ·组织器官的DNA甲基化差异第20页
   ·DNA甲基化抑制剂第20-21页
     ·DNA甲基化抑制剂的作用机理第20-21页
     ·DNA甲基化抑制剂在植物上的应用第21页
   ·研究DNA甲基化的主要方法第21-26页
     ·高效液相色谱法第21-22页
     ·亚硫酸盐测序法(Bisulfite Sequencing PCR,BSP)第22页
     ·甲基化敏感性限制性内切酶结合Southern杂交分析法第22-23页
     ·甲基化敏感的扩增片段长度多态性第23-24页
     ·亚硫酸氢钠联合限制性内切酶分析法第24页
     ·焦磷酸测序(Pyrosequencing)第24-26页
第二章 去甲基化处理对早实枳生长和开花调控相关基因转录的影响第26-36页
   ·引言第26页
   ·材料方法第26-29页
     ·实验主要试剂和引物第26页
     ·主要试剂的配制第26-27页
     ·试验材料第27页
     ·早实枳种子的萌发率实验第27页
     ·去甲基处理早实枳种子第27页
     ·去甲基化处理后早实枳叶片RNA的提取第27-28页
     ·RT-PCR合成cDNA第28页
     ·基因表达Real-time PCR分析第28-29页
   ·结果与分析第29-32页
     ·早实枳种子的萌发率实验第29页
     ·去甲基化处理对早实枳种子萌发和苗期生长的影响第29-31页
     ·去甲基化处理对成花相关基因表达的影响第31-32页
   ·讨论第32-36页
     ·不同浓度5-AzaC去甲基化处理对早实枳生长的影响第32-33页
     ·不同浓度5-AzaC去甲基化处理后成花关键基因的表达分析第33-36页
第三章 LFY基因甲基化相关生物信息学分析及甲基化研究实验方法建立第36-56页
   ·引言第36-37页
   ·材料方法第37-44页
     ·实验主要试剂和引物第37页
     ·常用试剂及其配制第37-38页
     ·常用的生物信息学网站和分析软件第38-39页
     ·试验材料第39页
     ·LFY序列的生物信息学分析第39页
     ·早实枳基因组DNA提取第39-40页
     ·亚硫氢酸盐法处理DNA样品第40-41页
       ·基因组DNA的酶切第40页
       ·基因组DNA的亚硫氢酸盐修饰第40-41页
     ·亚硫氢酸盐修饰DNA PCR(Bisulfite Sequencing PCR,BSP)第41-42页
       ·PCR条件优化第41-42页
       ·PCR扩增产物的凝胶电泳检测第42页
     ·扩增产物的克隆测序第42-44页
       ·扩增产物的回收纯化第42页
         ·感受态细胞的制备(CaCl_2法)第42-43页
       ·目的产物的克隆第43页
       ·目标片段转化大肠杆菌第43页
       ·阳性克隆的筛选第43-44页
       ·测序第44页
       ·测序结果分析第44页
   ·结果与分析第44-53页
     ·LFY序列甲基化相关生物信息学分析第44-47页
     ·LFY基因甲基化研究实验方法建立第47-53页
       ·高质量DNA提取和亚硫氢酸盐修饰第47页
       ·甲基化预测区域DNA的PCR扩增和测序第47-53页
   ·讨论第53-56页
     ·DNA提取过程中应该注意的问题第53页
     ·BSP过程中应注意的问题第53-54页
       ·亚硫氢酸钠修饰过程中应该注意的问题第53-54页
       ·在引物设计和PCR过程中应该注意的问题第54页
     ·DNA序列的甲基化软件分析第54-56页
第四章 童期和成年期早实枳LFY基因甲基化状态分析第56-62页
   ·引言第56页
   ·材料方法第56-57页
     ·试验材料的采集第56页
     ·试验方法第56-57页
   ·结果与分析第57-60页
     ·童期和成年期早实枳LFY CpG岛序列甲基化分布情况第57页
     ·童期和成年期早实枳LFY5'-UTR序列(非CpG岛区域)甲基化分布第57-60页
   ·讨论第60-62页
参考文献第62-75页
附图第75-78页
致谢第78页

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