摘要 | 第1-9页 |
Abstract | 第9-12页 |
缩略语中英文对照表 | 第12-13页 |
第一章 前言 | 第13-26页 |
·课题的提出及研究的目的和意义 | 第13-14页 |
·表观遗传学与DNA甲基化 | 第14-15页 |
·CpG岛的定义 | 第15-16页 |
·DNA甲基化与植物发育 | 第16-19页 |
·DNA甲基化与植物开花过程中的基因表达调控 | 第17页 |
·植物胁迫生长调控中的DNA甲基化 | 第17-18页 |
·转座子活性与DNA甲基化 | 第18页 |
·转基因沉默中的DNA甲基化 | 第18-19页 |
·植物组织培养中的DNA甲基化 | 第19页 |
·植物物种的DNA甲基化差异 | 第19-20页 |
·组织器官的DNA甲基化差异 | 第20页 |
·DNA甲基化抑制剂 | 第20-21页 |
·DNA甲基化抑制剂的作用机理 | 第20-21页 |
·DNA甲基化抑制剂在植物上的应用 | 第21页 |
·研究DNA甲基化的主要方法 | 第21-26页 |
·高效液相色谱法 | 第21-22页 |
·亚硫酸盐测序法(Bisulfite Sequencing PCR,BSP) | 第22页 |
·甲基化敏感性限制性内切酶结合Southern杂交分析法 | 第22-23页 |
·甲基化敏感的扩增片段长度多态性 | 第23-24页 |
·亚硫酸氢钠联合限制性内切酶分析法 | 第24页 |
·焦磷酸测序(Pyrosequencing) | 第24-26页 |
第二章 去甲基化处理对早实枳生长和开花调控相关基因转录的影响 | 第26-36页 |
·引言 | 第26页 |
·材料方法 | 第26-29页 |
·实验主要试剂和引物 | 第26页 |
·主要试剂的配制 | 第26-27页 |
·试验材料 | 第27页 |
·早实枳种子的萌发率实验 | 第27页 |
·去甲基处理早实枳种子 | 第27页 |
·去甲基化处理后早实枳叶片RNA的提取 | 第27-28页 |
·RT-PCR合成cDNA | 第28页 |
·基因表达Real-time PCR分析 | 第28-29页 |
·结果与分析 | 第29-32页 |
·早实枳种子的萌发率实验 | 第29页 |
·去甲基化处理对早实枳种子萌发和苗期生长的影响 | 第29-31页 |
·去甲基化处理对成花相关基因表达的影响 | 第31-32页 |
·讨论 | 第32-36页 |
·不同浓度5-AzaC去甲基化处理对早实枳生长的影响 | 第32-33页 |
·不同浓度5-AzaC去甲基化处理后成花关键基因的表达分析 | 第33-36页 |
第三章 LFY基因甲基化相关生物信息学分析及甲基化研究实验方法建立 | 第36-56页 |
·引言 | 第36-37页 |
·材料方法 | 第37-44页 |
·实验主要试剂和引物 | 第37页 |
·常用试剂及其配制 | 第37-38页 |
·常用的生物信息学网站和分析软件 | 第38-39页 |
·试验材料 | 第39页 |
·LFY序列的生物信息学分析 | 第39页 |
·早实枳基因组DNA提取 | 第39-40页 |
·亚硫氢酸盐法处理DNA样品 | 第40-41页 |
·基因组DNA的酶切 | 第40页 |
·基因组DNA的亚硫氢酸盐修饰 | 第40-41页 |
·亚硫氢酸盐修饰DNA PCR(Bisulfite Sequencing PCR,BSP) | 第41-42页 |
·PCR条件优化 | 第41-42页 |
·PCR扩增产物的凝胶电泳检测 | 第42页 |
·扩增产物的克隆测序 | 第42-44页 |
·扩增产物的回收纯化 | 第42页 |
·感受态细胞的制备(CaCl_2法) | 第42-43页 |
·目的产物的克隆 | 第43页 |
·目标片段转化大肠杆菌 | 第43页 |
·阳性克隆的筛选 | 第43-44页 |
·测序 | 第44页 |
·测序结果分析 | 第44页 |
·结果与分析 | 第44-53页 |
·LFY序列甲基化相关生物信息学分析 | 第44-47页 |
·LFY基因甲基化研究实验方法建立 | 第47-53页 |
·高质量DNA提取和亚硫氢酸盐修饰 | 第47页 |
·甲基化预测区域DNA的PCR扩增和测序 | 第47-53页 |
·讨论 | 第53-56页 |
·DNA提取过程中应该注意的问题 | 第53页 |
·BSP过程中应注意的问题 | 第53-54页 |
·亚硫氢酸钠修饰过程中应该注意的问题 | 第53-54页 |
·在引物设计和PCR过程中应该注意的问题 | 第54页 |
·DNA序列的甲基化软件分析 | 第54-56页 |
第四章 童期和成年期早实枳LFY基因甲基化状态分析 | 第56-62页 |
·引言 | 第56页 |
·材料方法 | 第56-57页 |
·试验材料的采集 | 第56页 |
·试验方法 | 第56-57页 |
·结果与分析 | 第57-60页 |
·童期和成年期早实枳LFY CpG岛序列甲基化分布情况 | 第57页 |
·童期和成年期早实枳LFY5'-UTR序列(非CpG岛区域)甲基化分布 | 第57-60页 |
·讨论 | 第60-62页 |
参考文献 | 第62-75页 |
附图 | 第75-78页 |
致谢 | 第78页 |