摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4-5页 |
中文部分 | 第9-42页 |
1 绪论 | 第9-17页 |
1.1 结直肠腺瘤概述 | 第9-11页 |
1.2 影响结直肠腺瘤再发相关因素 | 第11-13页 |
1.3 肠道菌群对结直肠肿瘤发生与发展的影响 | 第13-15页 |
1.4 小结 | 第15-17页 |
2 实验对象及方法 | 第17-25页 |
2.1 志愿者的招募及采样 | 第17-18页 |
2.2 实验试剂与器材 | 第18-19页 |
2.2.1 实验试剂 | 第18页 |
2.2.2 实验器材 | 第18-19页 |
2.3 粪便样本中DNA提取 | 第19-20页 |
2.4 16 S rRNA基因V4-V5 可变区片段扩增 | 第20页 |
2.5 Illumina Miseq测序 | 第20-21页 |
2.6 数据处理,生物信息学和统计分析 | 第21-24页 |
2.7 实时定量PCR | 第24-25页 |
3 实验结果 | 第25-38页 |
3.1 样本信息统计 | 第25页 |
3.2 .物种的注释和评估 | 第25-28页 |
3.2.1 Rank-Abundance曲线 | 第25-26页 |
3.2.2 Pan&Core物种分析 | 第26页 |
3.2.3 稀释曲线 | 第26-28页 |
3.2.4 单样本多样性分析 | 第28页 |
3.3 结直肠腺瘤再发和非再发患者肠道菌群在门水平上的差异 | 第28-32页 |
3.3.1 门水平上患者的肠道菌群结构 | 第28-31页 |
3.3.2 再发组和未再发组患者在门水平上组间菌群的比较 | 第31-32页 |
3.4 结直肠腺瘤再发和非再发患者肠道菌群在属水平上的差异 | 第32-34页 |
3.4.1 属水平上患者的肠道菌群结构 | 第32-33页 |
3.4.2 再发组和未再发组患者在属水平上组间菌群的比较 | 第33-34页 |
3.5 结直肠腺瘤再发组和未再发组在多级物种水平上的差异 | 第34-36页 |
3.6 结直肠腺瘤患者再发组和未再发组肠道菌群整体的差异 | 第36-37页 |
3.7 实时定量 PCR 验证结果 | 第37-38页 |
4 讨论 | 第38-41页 |
5 结论 | 第41-42页 |
英文部分 | 第42-81页 |
6 Introduction | 第42-53页 |
6.1 Summary of colorectal adenoma | 第42-45页 |
6.2 Factors affecting recurrence of colorectal adenoma | 第45-48页 |
6.3 The effects of intestinal flora on the occurrence and development of colorectal neoplasms | 第48-52页 |
6.4 Summary | 第52-53页 |
7 Experimental objects and methods | 第53-62页 |
7.1 Recruitment and sampling of volunteers | 第53-54页 |
7.2 Experimental reagents and equipment | 第54-55页 |
7.3 DNA extraction from fecal samples | 第55-56页 |
7.4 16S rRna gene V4-V5 variable region fragment amplification | 第56-57页 |
7.5 Illumina miseq sequencing | 第57页 |
7.6 Processing of sequencing data | 第57-60页 |
7.7 Real-time quantitative PCR | 第60-62页 |
8 Results | 第62-76页 |
8.1 sample information statistics | 第62页 |
8.2 Comments and assessments of species | 第62-66页 |
8.3 Differences about intestinal flora on Phylum level in colorectal adenoma patients between recurrence and recurrence-free | 第66-69页 |
8.4 Differences about intestinal flora on Genus level in colorectal adenoma patients between recurrence and recurrence-free | 第69-71页 |
8.5 Differences in multi-level species between colorectal adenoma ecurrence and recurrence-free group | 第71-73页 |
8.6 The over all different between colorectal adenoma recurrence and recurrence-free of intestinal flora | 第73-74页 |
8.7 Real-time quantitative PCR results | 第74-76页 |
9 Discussion | 第76-80页 |
10 Conclusion | 第80-81页 |
Reference | 第81-90页 |
附录 | 第90-97页 |
致谢 | 第97-98页 |
攻读博士学位期间已发表的论文 | 第98-100页 |