| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-24页 |
| 1.1 菜蓟族概况 | 第11-14页 |
| 1.1.1 菜蓟族简介 | 第11页 |
| 1.1.2 菜蓟族研究概况 | 第11-12页 |
| 1.1.3 牛蒡简介 | 第12-13页 |
| 1.1.4 红花简介 | 第13-14页 |
| 1.2 内标基因的开发 | 第14-17页 |
| 1.2.1 内标基因的概念 | 第14-15页 |
| 1.2.2 内标基因的应用 | 第15-16页 |
| 1.2.2.1 成分源检测 | 第15页 |
| 1.2.2.2 DNA质量的判定 | 第15页 |
| 1.2.2.3 转基因油料作物定量PCR检测 | 第15-16页 |
| 1.2.3 油料作物内标基因开发现状 | 第16-17页 |
| 1.3 核基因组ITS序列在系统发育中的应用 | 第17-23页 |
| 1.3.1 ITS序列简介 | 第17-19页 |
| 1.3.2 ITS序列在被子植物中的应用 | 第19-21页 |
| 1.3.2.1 在科、亚科、族水平的应用 | 第19-20页 |
| 1.3.2.2 在属及属下水平中的应用 | 第20页 |
| 1.3.2.3 在种及种下水平中的应用 | 第20-21页 |
| 1.3.3 ITS序列在裸子植物中的应用 | 第21页 |
| 1.3.4 ITS序列二级结构预测 | 第21-23页 |
| 1.4 本研究的目的及意义 | 第23-24页 |
| 第二章 红花内标准基因的开发 | 第24-35页 |
| 2.1 材料与方法 | 第24-27页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第24页 |
| 2.1.2 红花总DNA的提取 | 第24-25页 |
| 2.1.3 候选基因的筛选以及PCR体系 | 第25-26页 |
| 2.1.4 扩增产物的回收测序与比对 | 第26-27页 |
| 2.2 结果与分析 | 第27-33页 |
| 2.2.1 红花候选内标基因的筛选 | 第27-28页 |
| 2.2.2 引物筛选 | 第28页 |
| 2.2.3 物种特异性鉴定 | 第28-30页 |
| 2.2.4 扩增片段同源性比对分析 | 第30页 |
| 2.2.5 定性PCR灵敏度检测 | 第30-31页 |
| 2.2.6 定量PCR检测体系 | 第31-33页 |
| 2.2.7 红花源成分检测 | 第33页 |
| 2.3 讨论 | 第33-35页 |
| 第三章 ITS序列在牛蒡中的应用 | 第35-42页 |
| 3.1 材料与方法 | 第35-36页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第35页 |
| 3.1.2 牛蒡基因组DNA的提取 | 第35页 |
| 3.1.3 核糖体DNA ITS片段的扩增 | 第35-36页 |
| 3.1.4 克隆测序 | 第36页 |
| 3.2 结果与分析 | 第36-40页 |
| 3.2.1 ITS序列长度及GC含量分析 | 第36-37页 |
| 3.2.2 ITS序列碱基变异分析 | 第37-38页 |
| 3.2.3 遗传距离分析 | 第38-40页 |
| 3.3 讨论 | 第40-42页 |
| 第四章 ITS序列在菜蓟族中的应用 | 第42-57页 |
| 4.1 材料与方法 | 第42-44页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第42页 |
| 4.1.2 实验方法 | 第42-44页 |
| 4.2 结果与分析 | 第44-56页 |
| 4.2.1 ITS序列长度多态性及GC含量分析 | 第44-47页 |
| 4.2.2 遗传多样性及系统发育分析 | 第47-49页 |
| 4.2.3 ITS序列二级结构预测比对 | 第49-56页 |
| 4.2.3.1 ITS序列二级结构预测 | 第49-52页 |
| 4.2.3.2 ITS2序列二级结构在各属间的比较 | 第52-54页 |
| 4.2.3.3 ITS2序列二级结构在各种间的比较 | 第54-56页 |
| 4.3 讨论 | 第56-57页 |
| 第五章 总结 | 第57-59页 |
| 附录A 牛蒡ITS序列比对结果 | 第59-60页 |
| 附录B 菜蓟族及紫菀族部分样品ITS2序列二级结构预测结果 | 第60-67页 |
| 参考文献 | 第67-73页 |
| 致谢 | 第73-75页 |
| 攻读硕士期间发表的论文 | 第75页 |
