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转录组和蛋白质组关联分析‘无子瓯柑雄性不育分子机理

摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
1 文献综述第12-19页
    1.1 柑橘产业发展概况及‘无子瓯柑’简介第12页
    1.2 植物雄性不育研究进展第12-18页
        1.2.1 植物雄性不育的概述第12-14页
        1.2.2 植物雄性不育研究进展第14-18页
    1.3 柑橘雄性不育研究进展第18页
    1.4 研究的目的和内容第18-19页
2 ‘无子瓯柑’和普通瓯柑花器官特征比较第19-22页
    2.1 材料与方法第19页
    2.2 形态学的结果第19-22页
        2.2.1 成熟花粉观察第19-20页
        2.2.2 花药的观察第20-22页
3 转录组学分析第22-37页
    3.1 材料第22页
    3.2 方法第22-23页
        3.2.1 RNA的提取和样品检测第22页
        3.2.2 转录组文库的构建第22页
        3.2.3 转录组文库质量评估第22-23页
        3.2.4 测序数据及质量控制第23页
    3.3 转录组结果概述第23-30页
        3.3.1 测序数据统计第24页
        3.3.2 比对效率统计第24-25页
        3.3.3 SNP位点开发第25-29页
        3.3.4 可变剪接分析第29-30页
    3.4 差异表达基因的生物信息学分析第30-33页
        3.4.1 差异表达基因的聚类分析第30-31页
        3.4.2 差异表达基因的GO分析第31-32页
        3.4.3 差异表达基因的KEGG分析第32-33页
    3.5 qRT-PCR验证实验方法第33-37页
        3.5.1 差异表达基因的选择第33页
        3.5.2 特异性引物设计第33-35页
        3.5.3 实时荧光定量qRT—PCR第35-36页
        3.5.4 qRT-PCR中12个差异基因的表达情况第36-37页
4 蛋白质组学分析第37-62页
    4.1 材料第37页
    4.2 方法第37-39页
        4.2.1 蛋白的提取和定量第37页
        4.2.2 FASP酶解和iTRAQ标记第37-38页
        4.2.3 SCX分级第38页
        4.2.4 质谱分析第38-39页
        4.2.5 数据分析第39页
    4.3 蛋白质结果概述第39-42页
        4.3.1 肽段离子得分分布第39页
        4.3.2 肽段序列长度分布第39-40页
        4.3.3 蛋白序列覆盖度第40-41页
        4.3.4 蛋白质相对分子质量分布第41页
        4.3.5 蛋白质等电点分布第41-42页
    4.4 生物信息学分析第42-55页
        4.4.1 COG分析第44-46页
        4.4.2 GO分析第46-51页
        4.4.3 KEGG分析第51-55页
    4.5 qRT-PCR验证结果与分析第55-62页
        4.5.1 材料与方法第58-60页
        4.5.2 qRT—PCR结果分析第60-62页
5 转录组和蛋白质组关联分析第62-66页
    5.1 GO和KEGG关联分析第62-63页
    5.2 关联系数分析第63-66页
6 讨论第66-71页
    6.1 转录组和蛋白质组串联分析’无子瓯柑’雄性不育分子机理第66-68页
    6.2 ‘无子瓯柑’雄性不育的相关通路第68-71页
7 结论和展望第71-72页
参考文献第72-82页
个人简介第82-83页
致谢第83页

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