| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 1 绪论 | 第7-9页 |
| 2 基本理论 | 第9-16页 |
| ·分子力学 | 第9页 |
| ·分子力场作用项的一般式 | 第9-16页 |
| 3 ABEEMσπ浮动电荷力场应用于蛋白质体系的研究 | 第16-26页 |
| ·ABEEMσπ浮动电荷力场模型 | 第16-17页 |
| ·ABEEMσπ/MM模型简介 | 第16页 |
| ·ABEEMσπ/MM模型的能量表达形式 | 第16-17页 |
| ·ABEEMσπ/MM-MD对蛋白质体系的分子动力学模拟研究 | 第17-25页 |
| ·模拟方法 | 第17-18页 |
| ·蛋白质DER F 2、Methianyl-TRNA、synthetase 和Plasminogen 的模拟结构与实验结构的对比 | 第18-25页 |
| ·小结 | 第25-26页 |
| 4 ABEEMσπ浮动电荷力场应用于药物分子对接的计算 | 第26-37页 |
| ·分子对接简介 | 第26-27页 |
| ·ABEEMσπ浮动电荷力场应用于人血纤溶酶原Kringle 1 结构域与其抑制剂的对接研究 | 第27-29页 |
| ·模型体系与计算方法 | 第27-29页 |
| ·K1pg与配体EACA和AMCHA的对接计算 | 第29-34页 |
| ·结合能的计算 | 第29-30页 |
| ·结构分析 | 第30-33页 |
| ·电荷分析 | 第33-34页 |
| ·五种配体与K1pg的结合能 | 第34-35页 |
| ·小结 | 第35-37页 |
| 结论 | 第37-38页 |
| 参考文献 | 第38-42页 |
| 致谢 | 第42页 |
