支持大规模基因数据的压缩索引与查询优化
| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 引言 | 第11-15页 |
| 1.1 研究背景 | 第11-12页 |
| 1.2 本文的研究内容及面临的挑战 | 第12-13页 |
| 1.3 本文的贡献 | 第13页 |
| 1.4 本文组织结构 | 第13-15页 |
| 第2章 背景知识与问题定义 | 第15-21页 |
| 2.1 基因序列压缩技术 | 第15页 |
| 2.2 压缩序列的表示 | 第15-17页 |
| 2.3 Q-Grarns倒排索引 | 第17-18页 |
| 2.4 编辑距离 | 第18-19页 |
| 2.5 问题定义 | 第19-20页 |
| 2.6 本章小节 | 第20-21页 |
| 第3章 相关工作 | 第21-31页 |
| 3.1 经典模式匹配算法 | 第21-23页 |
| 3.2 基于Head_tail位索引的查询算法 | 第23-30页 |
| 3.2.1 精确匹配查询结果的分类 | 第23页 |
| 3.2.2 Basic算法 | 第23-25页 |
| 3.2.3 Min_Verify算法 | 第25-28页 |
| 3.2.4 C_Verify算法 | 第28-30页 |
| 3.3 本章小节 | 第30-31页 |
| 第4章 索引结构和基本精确匹配算法 | 第31-39页 |
| 4.1 索引的构建 | 第31-35页 |
| 4.1.1 Q-Grams倒排索引 | 第32页 |
| 4.1.2 Delta索引 | 第32-33页 |
| 4.1.3 Head_Deta索引 | 第33-34页 |
| 4.1.4 Tail_Delta索引 | 第34-35页 |
| 4.2 基本精确匹配算法 | 第35-37页 |
| 4.3 本章小节 | 第37-39页 |
| 第5章 支持精确匹配算法的优化 | 第39-51页 |
| 5.1 重复验证过滤 | 第39-42页 |
| 5.2 多余验证过滤 | 第42-47页 |
| 5.3 优化的精确匹配算法 | 第47-50页 |
| 5.4 本章小节 | 第50-51页 |
| 第6章 支持近似匹配算法的优化 | 第51-61页 |
| 6.1 近似匹配查询 | 第51-54页 |
| 6.2 优化的近似匹配算法 | 第54-59页 |
| 6.3 本章小节 | 第59-61页 |
| 第7章 实验与分析 | 第61-71页 |
| 7.1 实验设置 | 第61-62页 |
| 7.2 索引结构对比 | 第62-65页 |
| 7.3 验证个数对比 | 第65-66页 |
| 7.4 查询性能对比及分析 | 第66-69页 |
| 7.4.1 精确匹配查询性能对比及分析 | 第66-67页 |
| 7.4.2 近似匹配查询性能对比及分析 | 第67-69页 |
| 7.5 本章小节 | 第69-71页 |
| 第8章 总结与展望 | 第71-73页 |
| 8.1 本文总结 | 第71-72页 |
| 8.2 工作展望 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-77页 |
| 致谢 | 第77-79页 |
| 攻硕期间参加的项目及获奖情况 | 第79页 |
