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冬小麦低温下基因表达谱分析及海藻糖基因家族研究

摘要第8-11页
Abstract第11-14页
1 前言第15-28页
    1.1 低温对植物的伤害第15页
    1.2 植物抗寒生理生化特性的研究进展第15-21页
        1.2.1 生物膜系统与抗寒性的关系第15-16页
        1.2.2 抗氧化酶及非酶物质与抗寒性的关系第16-17页
        1.2.3 渗透调节物质与抗寒性的关系第17-19页
        1.2.4 外源施加海藻糖与抗逆性的关系第19-21页
    1.3 植物抗寒基因的研究进展第21-24页
        1.3.1 膜稳定性相关基因第21-22页
        1.3.2 抗氧化酶基因第22页
        1.3.3 抗冻相关蛋白基因第22-23页
        1.3.4 渗透调节基因第23页
        1.3.5 低温信号转录因子第23-24页
    1.4 冬小麦抗寒性研究进展第24-26页
        1.4.1 冬小麦抗寒性的生理特性研究状况第24-25页
        1.4.2 冬小麦抗寒基因的研究状况第25页
        1.4.3 冬小麦抗冻/寒蛋白的研究状况第25-26页
    1.5 研究的目的和意义第26-28页
2 材料与方法第28-39页
    2.1 试验材料第28页
    2.2 试验方法第28-39页
        2.2.1 Solexa基因表达谱测序第28-34页
        2.2.2 室外自然降温和人工降温处理、取样及测定方法第34-36页
        2.2.3 外源施加海藻糖处理、取样及测定方法第36-37页
        2.2.4 海藻糖-6-磷酸合成酶基因冷冻条件下定量分析第37-39页
3 结果与分析第39-98页
    3.1 冬小麦低温下基因数字表达谱分析第39-76页
        3.1.1 测序组装结果及质量评估第39-40页
        3.1.2 数字表达谱测序质量的评估第40-41页
        3.1.3 表达谱测序饱和度的分析第41-42页
        3.1.4 高通量测序结果与定量PCR的比较第42-43页
        3.1.5 基因功能注释第43-47页
        3.1.6 不同处理中基因表达模式的变化第47-48页
        3.1.7 差异表达基因的聚类分析第48-51页
        3.1.8 差异表达基因分类及功能分析第51-65页
        3.1.9 Pathway显著性富集分析第65-69页
        3.1.10 海藻糖代谢途径第69-70页
        3.1.11 TPS基因家族生物信息学分析第70-76页
    3.2 自然低温下两个冬小麦品种抗寒性的比较第76-82页
        3.2.1 自然低温生理指标的测定第76-78页
        3.2.2 自然降温和人工模拟低温下膜脂脂肪酸的测定第78-82页
    3.3 外源施加海藻糖对冬小麦抗寒性的影响第82-98页
        3.3.1 外源海藻糖浓度对冬小麦芽长的影响第82-83页
        3.3.2 外源海藻糖浓度对冷冻条件下冬小麦相对含水量的影响第83-85页
        3.3.3 外源海藻糖浓度对冷冻条件下冬小麦脯氨酸含量的影响第85-86页
        3.3.4 外源海藻糖浓度对冷冻条件下冬小麦丙二醛含量的影响第86-87页
        3.3.5 外源海藻糖浓度对冷冻条件下冬小麦海藻糖含量的影响第87-88页
        3.3.6 外源海藻糖浓度对冷冻条件冬小麦可溶性糖含量的影响第88-90页
        3.3.7 外源海藻糖浓度对冷冻条件冬小麦返青率的影响第90-91页
        3.3.8 TPS在不同低温条件下的表达模式分析第91-98页
4 讨论第98-108页
    4.1 低温对冬小麦表达谱及基因表达模式的影响第98-103页
        4.1.1 数字表达谱的优点及RNA质量要求第98页
        4.1.2 数字表达谱测序结果及质量评价第98-99页
        4.1.3 基因功能注释及与抗寒相关生理指标的关系第99-100页
        4.1.4 低温下冬小麦差异表达基因表达模式聚类第100-101页
        4.1.5 低温下冬小麦差异表达基因的分类及相应功能第101-103页
        4.1.6 Pathway基因显著性富集分析及与抗寒相关生理指标的关系第103页
    4.2 外源海藻糖及海藻糖合成酶基因对冬小麦幼苗抗寒性的影响第103-108页
        4.2.1 外源海藻糖对低温下冬小麦种子萌发及芽长的影响第103-104页
        4.2.2 外源海藻糖对低温下冬小麦幼苗抗寒性的影响第104-106页
        4.2.3 海藻糖-6-磷酸合成酶(TPS)基因家族的研究第106-108页
5 结论第108-109页
致谢第109-110页
参考文献第110-127页
攻读学位期间发表的学位论文第127-128页

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