英文缩略词表 | 第7-9页 |
摘要 | 第9-11页 |
Abstract | 第11-13页 |
前言 | 第14-18页 |
第一部分 不同侵袭转移潜能肝癌细胞定量蛋白质组学研究 | 第18-41页 |
1 实验材料与仪器设备 | 第18-21页 |
1.1 实验材料 | 第18页 |
1.2 实验试剂 | 第18-19页 |
1.3 主要仪器 | 第19-20页 |
1.4 溶液配制 | 第20-21页 |
2 实验方法 | 第21-26页 |
2.1 细胞复苏 | 第21页 |
2.2 细胞传代 | 第21页 |
2.3 细胞提取蛋白 | 第21-22页 |
2.4 蛋白还原烷基化 | 第22页 |
2.5 蛋白定量 | 第22页 |
2.6 FASP酶解 | 第22-23页 |
2.7 终止酶解 | 第23页 |
2.8 LC-MS/MS检测 | 第23-24页 |
2.9 数据库搜索 | 第24-25页 |
2.10 生物信息学数据分析 | 第25-26页 |
3 实验结果 | 第26-37页 |
3.1 BCA蛋白定量 | 第26-27页 |
3.2 定量蛋白质组的整体分析 | 第27-30页 |
3.3 差异表达蛋白质的筛选及聚类分析 | 第30-31页 |
3.4 差异表达蛋白的GO分析 | 第31-34页 |
3.5 差异表达蛋白的KEGG信号通路分析 | 第34-36页 |
3.6 差异表达蛋白质的相互作用分析 | 第36-37页 |
4 讨论 | 第37-39页 |
5 小结 | 第39-41页 |
第二部分 不同侵袭转移潜能肝癌细胞泛素化修饰组学研究 | 第41-76页 |
1 实验材料与仪器设备 | 第41-44页 |
1.1 实验材料 | 第41页 |
1.2 实验试剂 | 第41-42页 |
1.3 主要仪器 | 第42-43页 |
1.4 溶液配制 | 第43-44页 |
2 实验方法 | 第44-48页 |
2.1 细胞复苏 | 第44页 |
2.2 细胞传代 | 第44页 |
2.3 细胞提取蛋白 | 第44-45页 |
2.4 蛋白还原烷基化 | 第45页 |
2.5 蛋白定量 | 第45页 |
2.6 FASP酶解 | 第45页 |
2.7 终止酶解 | 第45-46页 |
2.8 泛素化修饰肽段富集 | 第46-47页 |
2.9 LC-MS/MS鉴定 | 第47页 |
2.10 数据库搜索 | 第47-48页 |
2.11 生物信息学数据分析 | 第48页 |
3 实验结果 | 第48-69页 |
3.1 BCA蛋白定量 | 第48-49页 |
3.2 鉴定泛素化蛋白质组分析 | 第49-51页 |
3.3 定量泛素化蛋白质组整体分析 | 第51-58页 |
3.4 定量泛素化蛋白质组差异分析 | 第58-67页 |
3.5 定量泛素化肽段及位点分析 | 第67-69页 |
4 讨论 | 第69-74页 |
5 小结 | 第74页 |
6 展望 | 第74-76页 |
参考文献 | 第76-80页 |
附录 | 第80-135页 |
附表一 四组肝癌细胞蛋白质组差异蛋白列表 | 第80-86页 |
附表二 四组肝癌细胞差异表达泛素化修饰蛋白质列表 | 第86-94页 |
附表三 四组肝癌细胞差异表达泛素化修饰肽段及修饰位点列表 | 第94-135页 |
致谢 | 第135页 |