| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7页 |
| 英文缩略表 | 第11-12页 |
| 第一章 文献与综述 | 第12-21页 |
| 1.1 引言 | 第12页 |
| 1.2 连锁不平衡概述 | 第12-14页 |
| 1.2.1 连锁不平衡的定义 | 第12页 |
| 1.2.2 连锁不平衡的度量方法 | 第12-13页 |
| 1.2.2.1 连锁不平衡系数D’ | 第13页 |
| 1.2.2.2 连锁不平衡系数r~2 | 第13页 |
| 1.2.3 连锁不平衡的影响因素 | 第13页 |
| 1.2.4 连锁不平衡研究进展 | 第13-14页 |
| 1.3 有效群体大小概述 | 第14-16页 |
| 1.3.1 有效群体大小概念 | 第14页 |
| 1.3.2 有效群体大小的估计方法 | 第14-15页 |
| 1.3.2.1 利用系谱信息估计有效群体大小 | 第15页 |
| 1.3.2.2 利用连锁不平衡信息估计有效群体大小 | 第15页 |
| 1.3.3 有效群体大小研究进展 | 第15-16页 |
| 1.4 选择信号检测概述 | 第16-19页 |
| 1.4.1 选择信号的概念 | 第16页 |
| 1.4.2 选择信号的检测方法 | 第16-18页 |
| 1.4.2.1 基于位点频谱的检测方法 | 第16-17页 |
| 1.4.2.2 基于群体分化的检测方法 | 第17页 |
| 1.4.2.3 基于LD和单倍型的检测方法 | 第17-18页 |
| 1.4.3 选择信号研究进展 | 第18-19页 |
| 1.5 研究的目的和意义 | 第19-21页 |
| 第二章 材料与方法 | 第21-27页 |
| 2.1 试验材料 | 第21-23页 |
| 2.1.1 试验动物 | 第21页 |
| 2.1.2 血样采集 | 第21页 |
| 2.1.3 试剂、溶液与仪器 | 第21-22页 |
| 2.1.4 软件与在线资源 | 第22-23页 |
| 2.2 试验方法 | 第23-27页 |
| 2.2.1 技术路线 | 第23页 |
| 2.2.2 基因组DNA提取 | 第23-24页 |
| 2.2.3 基因组DNA浓度和纯度检测 | 第24页 |
| 2.2.4 SNP基因型检测 | 第24页 |
| 2.2.5 基因型数据处理 | 第24-25页 |
| 2.2.6 统计分析 | 第25-27页 |
| 第三章 结果与分析 | 第27-65页 |
| 3.1 基因组DNA检测结果 | 第27页 |
| 3.2 基因型质量控制 | 第27-30页 |
| 3.3 连锁不平衡分析结果 | 第30-35页 |
| 3.3.1 品种内连锁不平衡分析结果 | 第30-34页 |
| 3.3.2 品种间连锁相分析结果 | 第34-35页 |
| 3.4 有效群体大小估计 | 第35-45页 |
| 3.5 选择信号分析结果 | 第45-65页 |
| 3.5.1 选择信号检测 | 第45-50页 |
| 3.5.2 基因注释结果 | 第50-59页 |
| 3.5.3 基因富集分析结果 | 第59-65页 |
| 第四章 讨论 | 第65-69页 |
| 4.1 连锁不平衡程度 | 第65页 |
| 4.2 有效群体大小 | 第65-66页 |
| 4.3 连锁相的持续性 | 第66-67页 |
| 4.4 选择信号分析 | 第67-69页 |
| 4.4.1 iHS检测方法的特点 | 第67-68页 |
| 4.4.2 关于候选基因的讨论 | 第68-69页 |
| 第五章 全文结论 | 第69-70页 |
| 参考文献 | 第70-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
| 作者简历 | 第78页 |