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青岛地区鸡源空肠弯曲菌流行病学、ERIC-PCR分型及毒力基因研究

符号说明第4-10页
中文摘要第10-12页
Abstract第12-14页
1 前言第15-32页
    1.1 来源第15-16页
        1.1.1 动物来源第15-16页
        1.1.2 环境来源第16页
    1.2 生物学特性第16-17页
        1.2.1 形态特性第16页
        1.2.2 培养特性第16-17页
        1.2.3 生化特点第17页
    1.3 空肠弯曲菌的分型方法第17-22页
        1.3.1 血清学分型方法第17-18页
        1.3.2 基因分型第18-22页
            1.3.2.1 多位点序列分型(MLST)第18页
            1.3.2.2 高脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术第18-19页
            1.3.2.3 随机扩增多态性分析(RAPD-PCR)技术第19-20页
            1.3.2.4 限制酶片段长度多态性(RFLP)分型第20页
            1.3.2.5 ERIC-PCR 指纹图谱技术第20-22页
    1.4 致病性第22-24页
        1.4.1 对人的致病性第22-23页
        1.4.2 对畜禽的致病性第23-24页
    1.5 与致病性有关的毒力因子第24-27页
        1.5.1 与粘附、定植有关的毒力因子第24-25页
            1.5.1.1 鞭毛蛋白(flagellin)第24页
            1.5.1.2 黏附蛋白(PEB1)第24-25页
            1.5.1.3 纤连结合蛋白(CadF)第25页
            1.5.1.4 黏附定植相关基因(racR)第25页
        1.5.2 趋化蛋白第25页
        1.5.3 磷脂酶活性蛋白基因(pldA)第25-26页
        1.5.4 pVir 质粒第26页
        1.5.5 空肠弯曲菌的外毒素第26页
        1.5.6 空肠弯曲菌的内毒素第26-27页
    1.6 耐药方法及耐药机制第27-29页
        1.6.1 氟喹诺酮类药物第27页
        1.6.2 大环内酯类第27-28页
        1.6.3 四环素第28页
        1.6.4 氨基糖苷类第28-29页
    1.7 预防和控制第29-31页
        1.7.1 生物防控第29-30页
        1.7.2 物理防控第30-31页
        1.7.3 化学防控第31页
    1.8 研究目的和意义第31-32页
2.材料和方法第32-44页
    2.1 材料第32-34页
        2.1.1 菌株第32页
        2.1.2 主要仪器第32页
        2.1.3 培养基和主要试剂第32-33页
        2.1.4 样品来源第33-34页
    2.2 方法第34-44页
        2.2.1 空肠弯曲菌的分离及鉴定第34-36页
            2.2.1.1 培养基的制备第34页
            2.2.1.2 样品的采集与运输第34-35页
            2.2.1.3 分离与纯化第35页
            2.2.1.4 菌种保存第35-36页
        2.2.2 双重 PCR 鉴定第36页
            2.2.2.1 分离株模板制备第36页
            2.2.2.2 引物设计第36页
            2.2.2.3 双重 PCR 条件的优化第36页
            2.2.2.4 特异性检测第36页
            2.2.2.5 双重 PCR 的应用第36页
        2.2.3 分离菌株的生化及 VADAS 鉴定第36-38页
            2.2.3.1 过氧化氢酶试验第36页
            2.2.3.2 氧化酶试验第36-37页
            2.2.3.3 马尿酸钠水解试验第37页
            2.2.3.4 API 生化鉴定第37页
            2.2.3.5 VIDAS 弯曲菌(CAM)试剂盒第37-38页
        2.2.4 药敏试验第38页
        2.2.5 血清学分型第38-39页
        2.2.6 ERIC-PCR 分型第39-40页
            2.2.6.1 ERIC-PCR 引物第39页
            2.2.6.2 ERIC-PCR 扩增第39-40页
            2.2.6.3 ERIC-PCR 产物检测第40页
            2.2.6.4 稳定性试验第40页
        2.2.7 毒力基因检测第40-44页
            2.2.7.1 细菌复苏第40页
            2.2.7.2 细菌模板的制备第40页
            2.2.7.3 毒力基因引物设计第40-42页
            2.2.7.4 毒力基因扩增第42页
            2.2.7.5 毒力基因 PCR 产物测序鉴定第42-43页
            2.2.7.6 多重 PCR 条件的优化第43-44页
                2.2.7.6.1 不同引物之间组合的优化第43页
                2.2.7.6.2 多重 PCR 退火温度的优化第43页
                2.2.7.6.3 多重 PCR 延伸时间的优化第43页
                2.2.7.6.4 多重 PCR Taq 酶量的优化第43-44页
            2.2.7.7 空肠弯曲菌分离株多重 PCR 的检测第44页
        2.2.8 动物实验第44页
            2.2.8.1 试验动物空肠弯曲菌分离第44页
            2.2.8.2 细菌的培养增值第44页
            2.2.8.3 动物攻毒第44页
3 结果与分析第44-65页
    3.1 细菌分离第44-45页
    3.2 双重 PCR 鉴定第45-47页
        3.2.1 双重 PCR 条件优化结果第45-46页
        3.2.3 双重 PCR 的特异性第46-47页
    3.3 双重 PCR 对空肠弯曲菌分离株的鉴定结果第47-49页
        3.3.1 农贸市场和养殖场鸡源空肠弯曲菌检测结果第47-48页
        3.3.2 肉鸡生产链中空肠弯曲菌的污染状况第48页
        3.3.3 肉鸡和蛋鸡场的检出结果第48-49页
        3.3.4 不同规模养殖场的检出结果第49页
    3.4 生化鉴定第49-52页
        3.4.1 马尿酸钠水解试验第49-50页
        3.4.2 氧化酶试验第50页
        3.4.3 过氧化氢酶试验第50页
        3.4.4 API 鉴定第50-51页
        3.4.5 VIDAS 系统鉴定系统第51-52页
    3.5 药敏试验结果第52-56页
        3.5.1 质控菌株药敏结果第52页
        3.5.2 不同来源空肠弯曲菌分离株的耐药性情况第52-54页
        3.5.3 肉鸡、蛋鸡空肠弯曲菌的耐药情况第54-55页
        3.5.4 多重耐药情况第55-56页
    3.6 血清学分型结果第56-57页
    3.7 ERIC-PCR 分型结果第57-61页
        3.7.1 各养殖场的 ERIC-PCR 分型结果第57-60页
            3.7.1.1 蛋鸡场分离株 ERIC-PCR 分型结果第57-59页
            3.7.1.2 肉鸡场分离株 ERIC-PCR 分型结果第59-60页
        3.7.2 肉鸡生产链空肠弯曲菌分离株的 ERIC-PCR 分型结果第60-61页
    3.8 毒力基因检测结果第61-64页
        3.8.1 毒力基因扩增结果第61页
        3.8.2 毒力基因扩增片段产物鉴定第61-62页
        3.8.3 多重 PCR 方法建立第62页
        3.8.4 空肠弯曲菌分离株毒力基因分析第62-64页
            3.8.4.1 空肠弯曲菌总体检出情况第62-63页
            3.8.4.2 蛋鸡、肉鸡毒力基因检测结果第63-64页
            3.8.4.3 不同规模养殖场空肠弯曲菌的毒力基因检测结果第64页
    3.9 动物实验结果第64-65页
4.讨论第65-71页
    4.1 鸡源空肠弯曲菌的分离情况第65-66页
    4.2 鸡源空肠弯曲菌的耐药情况第66-68页
    4.3 血清分型结果第68页
    4.4 ERIC-PCR 分型第68-69页
    4.5 鸡源空肠弯曲菌的毒力基因及其致病性第69-71页
5 结论第71-73页
参考文献第73-81页
致谢第81-82页
研究生期间发表论文第82页

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