| 内容摘要 | 第5-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 1 引言 | 第13-27页 |
| 1.1 药物基因组学简介 | 第13-15页 |
| 1.1.1 药物代谢的种族差异 | 第14页 |
| 1.1.2 单核苷酸多态性在药效方面的影响 | 第14-15页 |
| 1.2 药物基因组学在临床实践中的应用 | 第15-21页 |
| 1.2.1 个性化医疗 | 第16-18页 |
| 1.2.2 靶向用药 | 第18-21页 |
| 1.3 药物副作用简介 | 第21-22页 |
| 1.4 组合用药简介 | 第22-26页 |
| 1.4.1 组合用药在癌症治疗中的应用 | 第22-23页 |
| 1.4.2 组合用药的方法学探究 | 第23-26页 |
| 1.5 本文研究内容及意义 | 第26-27页 |
| 2 探究SNP对个性化用药的影响 | 第27-37页 |
| 2.1 数据整理 | 第27-29页 |
| 2.1.1 测序数据整合 | 第27-28页 |
| 2.1.2 药物副作用与SNP的数据整合 | 第28-29页 |
| 2.2 分析SNP与药物副作用的关系 | 第29-36页 |
| 2.2.1 通路富集分析 | 第31-32页 |
| 2.2.2 低频SNPs在人种间的相关性分析 | 第32-33页 |
| 2.2.3 生物标志物中引起副作用的SNPs | 第33-34页 |
| 2.2.4 药物在不同人种中的副作用发生率 | 第34-35页 |
| 2.2.5 低频SNPs的普遍性与特异性分析 | 第35-36页 |
| 2.3 本章小结 | 第36-37页 |
| 3 构建组合用药模型提高个性化用药效果 | 第37-53页 |
| 3.1 药物相关的属性特征处理 | 第37-45页 |
| 3.1.1 药物ATC编码语义相似度 | 第37-39页 |
| 3.1.2 药物化学结构Jaccard相似性 | 第39-40页 |
| 3.1.3 药物不利反应相似性 | 第40-41页 |
| 3.1.4 药物涉及的GO功能聚类相似度 | 第41-42页 |
| 3.1.5 药物不相关通路分析 | 第42-43页 |
| 3.1.6 用药靶点参与的相互作用网络 | 第43-45页 |
| 3.2 基于XGBoost构建预测模型 | 第45-47页 |
| 3.3 组合用药模型评价 | 第47-52页 |
| 3.3.1 模型中所选特征的重要性 | 第47-49页 |
| 3.3.2 模型的性能比较 | 第49-50页 |
| 3.3.3 利用TCGA数据验证模型 | 第50-52页 |
| 3.4 本章小结 | 第52-53页 |
| 4 个性化组合用药网站的开发 | 第53-66页 |
| 4.1 网站开发环境 | 第53-58页 |
| 4.1.1 基于LAMP模式的开发 | 第53-55页 |
| 4.1.2 前端页面开发 | 第55-57页 |
| 4.1.3 后端计算工具 | 第57-58页 |
| 4.2 系统需求分析 | 第58-62页 |
| 4.2.1 用例说明 | 第58-59页 |
| 4.2.2 数据库设计 | 第59-60页 |
| 4.2.3 数据源 | 第60-61页 |
| 4.2.4 网站系统设计 | 第61-62页 |
| 4.3 网站展示 | 第62-65页 |
| 4.3.1 数据输入 | 第62-63页 |
| 4.3.2 用药靶点分析 | 第63-64页 |
| 4.3.3 组合用药结果 | 第64页 |
| 4.3.4 网络可视化 | 第64-65页 |
| 4.4 本章小结 | 第65-66页 |
| 5 总结与展望 | 第66-68页 |
| 5.1 总结 | 第66页 |
| 5.2 展望 | 第66-68页 |
| 参考文献 | 第68-75页 |
| 附录 | 第75-81页 |
| 附录1：肿瘤缩写对照表 | 第75-76页 |
| 附录2：严重药物副作用相关的“特异性”SNPs及其所在基因列表 | 第76-77页 |
| 附录3：严重药物副作用相关的“普遍性”SNPs及其所在基因列表 | 第77-80页 |
| 附录4：数据库表字段 | 第80-81页 |
| 后记 | 第81-82页 |
| 在学期间所取得的科研成果 | 第82页 |