| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 第一章 前言 | 第14-32页 |
| 1.1 微生物与环境 | 第14-23页 |
| 1.1.1 环境与生境 | 第14页 |
| 1.1.2 生态位的定义 | 第14-15页 |
| 1.1.3 微生物生存的能量和物质环境 | 第15页 |
| 1.1.4 环境对微生物分布的影响 | 第15-18页 |
| 1.1.4.1 非生物因素的影响 | 第15-17页 |
| 1.1.4.2 生物因素的影响 | 第17-18页 |
| 1.1.5 生态对策 | 第18-20页 |
| 1.1.6 自然环境中的微生物 | 第20-22页 |
| 1.1.6.1 土壤中的微生物 | 第20页 |
| 1.1.6.2 森林中的微生物 | 第20-21页 |
| 1.1.6.3 水体中的微生物 | 第21页 |
| 1.1.6.4 空气中的微生物 | 第21页 |
| 1.1.6.5 极端环境下的微生物 | 第21-22页 |
| 1.1.7 微生物在环境保护中的作用 | 第22-23页 |
| 1.2 原核生物分类学和系统学 | 第23-26页 |
| 1.2.1 原核生物分类简史 | 第23-24页 |
| 1.2.2 原核生物"种"的概念 | 第24-26页 |
| 1.3 多相分类学技术 | 第26-30页 |
| 1.3.1 表型特征检测 | 第26-28页 |
| 1.3.1.1 API鉴定系统 | 第26-27页 |
| 1.3.1.2 Biolog微孔板鉴定系统 | 第27-28页 |
| 1.3.2 化学分类技术 | 第28-29页 |
| 1.3.2.1 全细胞脂肪酸组分分析 | 第28页 |
| 1.3.2.2 极性脂分析 | 第28页 |
| 1.3.2.3 醌分析 | 第28-29页 |
| 1.3.2.4 多胺分析 | 第29页 |
| 1.3.3 分子系统学技术 | 第29-30页 |
| 1.3.3.1 16S rRNA基因序列分析 | 第29-30页 |
| 1.3.3.2 G+Cmol%测定 | 第30页 |
| 1.3.3.3 DNA-DNA杂交 | 第30页 |
| 1.4 本研究的内容、目的和意义 | 第30-32页 |
| 第二章 长白山与新疆地区可培养细菌的研究 | 第32-64页 |
| 2.1 前言 | 第32-34页 |
| 2.1.1 长白山地区地理环境 | 第32-33页 |
| 2.1.2 新疆戈壁地区环境 | 第33-34页 |
| 2.2 材料与方法 | 第34-40页 |
| 2.2.1 材料 | 第34-36页 |
| 2.2.1.1 样品与菌株 | 第34页 |
| 2.2.1.2 培养基 | 第34-35页 |
| 2.2.1.3 试剂 | 第35-36页 |
| 2.2.1.4 仪器与设备 | 第36页 |
| 2.2.2 方法 | 第36-40页 |
| 2.2.2.1 细菌的分离与纯化 | 第36-37页 |
| 2.2.2.2 基因组DNA的小量提取 | 第37页 |
| 2.2.2.3 16S rRNA基因的PCR扩增及纯化 | 第37-38页 |
| 2.2.2.4 16S rRNA基因序列分析 | 第38页 |
| 2.2.2.5 系统发育树的构建 | 第38页 |
| 2.2.2.6 Biolog自动鉴定系统 | 第38-39页 |
| 2.2.2.7 脂肪酸组分的测定 | 第39-40页 |
| 2.3 结果 | 第40-54页 |
| 2.3.1 菌株的分离与初步鉴定 | 第40-54页 |
| 2.3.1.1 菌株的分离 | 第41页 |
| 2.3.1.2 菌株的形态特征 | 第41-42页 |
| 2.3.1.3 156rRNA基因序列分析 | 第42-44页 |
| 2.3.1.4 Biolog系统鉴定 | 第44-53页 |
| 2.3.1.5 全细胞脂肪酸组分分析 | 第53-54页 |
| 2.4 讨论 | 第54-56页 |
| 附录1 | 第56-64页 |
| 第三章 四个潜在新分类单元的多相分类学研究 | 第64-124页 |
| 3.1 前言 | 第64-67页 |
| 3.1.1 溶杆菌属 | 第64-65页 |
| 3.1.2 拟杆菌门 | 第65页 |
| 3.1.3 Chitinophagaceae科 | 第65页 |
| 3.1.4 [Effluviibacter]属 | 第65-66页 |
| 3.1.5 Pontibacter属 | 第66页 |
| 3.1.6 Pelagibacterium属 | 第66-67页 |
| 3.2 材料与方法 | 第67-76页 |
| 3.2.1 材料 | 第67-70页 |
| 3.2.1.1 菌株 | 第67-68页 |
| 3.2.1.2 培养基 | 第68-69页 |
| 3.2.1.3 试剂与药品 | 第69-70页 |
| 3.2.2 方法 | 第70-76页 |
| 3.2.2.1 细菌基因组分析 | 第70-72页 |
| 3.2.2.2 生理生化特性检测 | 第72-75页 |
| 3.2.2.3 化学组分分析 | 第75-76页 |
| 3.3 结果 | 第76-116页 |
| 3.3.1 菌株XM415~T | 第76-87页 |
| 3.3.1.1 表型分析 | 第77-80页 |
| 3.3.1.2 化学分类指标 | 第80-81页 |
| 3.3.1.3 分子分类指标 | 第81-87页 |
| 3.3.2 菌株311-10~T | 第87-96页 |
| 3.3.2.1 表型分析 | 第87-91页 |
| 3.3.2.2 化学分类指标 | 第91页 |
| 3.3.2.3 分子分类指标 | 第91-93页 |
| 3.3.2.4 菌株[Effluviibacter] roseus SRC-1~T | 第93-96页 |
| 3.3.3 菌株HY-50R~T | 第96-110页 |
| 3.3.3.1 表型分析 | 第96-100页 |
| 3.3.3.2 化学分类指标 | 第100-102页 |
| 3.3.3.3 分子分类指标 | 第102-110页 |
| 3.3.4 菌株HY-49M~T | 第110-116页 |
| 3.3.4.1 表型分析 | 第110-113页 |
| 3.3.4.2 化学分类指标 | 第113-114页 |
| 3.3.4.3 分子分类指标 | 第114-116页 |
| 3.4 讨论 | 第116-119页 |
| 3.5 本章小结 | 第119-120页 |
| 附录2 | 第120-124页 |
| 参考文献 | 第124-135页 |
| 攻读博士学位期间已发表论文目录 | 第135-137页 |
| 致谢 | 第137页 |