| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一节 选题背景 | 第10-20页 |
| 1.1 酶的概述 | 第10-13页 |
| 1.1.1 酶促反应特点 | 第10-12页 |
| 1.1.2 酶促反应的机制 | 第12-13页 |
| 1.2 酶促反应的理论研究 | 第13-16页 |
| 1.3 论文的研究目与内容 | 第16-18页 |
| 参考文献 | 第18-20页 |
| 第二节 理论基础与计算方法 | 第20-28页 |
| 2.1 密度泛函理论(DFT) | 第20-23页 |
| 2.1.1 霍恩伯格-科恩定理 | 第20-21页 |
| 2.1.2 Kohn-Sham方法 | 第21-23页 |
| 2.2 B3LYP的准确性 | 第23页 |
| 2.3 酶催化反应的模拟研究 | 第23-26页 |
| 2.3.1 酶的活性中心构造 | 第24页 |
| 2.3.2 蛋白质环境的影响 | 第24-26页 |
| 参考文献 | 第26-28页 |
| 第三节 幽门螺旋杆菌甲酰胺酶催化羟胺的脱酰反应机理的理论研究 | 第28-38页 |
| 3.1 引言 | 第28-29页 |
| 3.2 计算方法 | 第29-30页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第30-34页 |
| 3.3.1 C-N键的形成 | 第30-31页 |
| 3.3.2 氢转移 | 第31页 |
| 3.3.3 S-C键的断裂 | 第31-34页 |
| 3.4 结论 | 第34-35页 |
| 参考文献 | 第35-38页 |
| 第四节 幽门螺旋杆菌甲酰胺酶反应机理的理论研究 | 第38-54页 |
| 4.1 引言 | 第38-40页 |
| 4.2 计算方法 | 第40页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第40-48页 |
| 4.3.1 酰化反应 | 第41-44页 |
| 4.3.2 脱酰反应 | 第44-48页 |
| 4.4 结论 | 第48-50页 |
| 参考文献 | 第50-54页 |
| 附录 硕士期间已完成的论文 | 第54-56页 |
| 致谢 | 第56页 |