| 摘要 | 第14-16页 |
| ABSTRACT | 第16-18页 |
| 缩略词 | 第19-20页 |
| 第一章 绪论 | 第20-32页 |
| 1.1 拟杆菌门微生物的研究现状 | 第20-22页 |
| 1.1.1 拟杆菌门的命名 | 第20-21页 |
| 1.1.2 拟杆菌纲微生物的分类 | 第21-22页 |
| 1.2 基于不同方法的拟杆菌门多样性研究现状 | 第22-26页 |
| 1.2.1 基于传统方法的拟杆菌门多样性研究 | 第22-23页 |
| 1.2.2 基于分子生物学技术的拟杆菌门多样性研究 | 第23-26页 |
| 1.3 海洋拟杆菌的分布及丰度 | 第26-27页 |
| 1.3.1 海洋拟杆菌的分布 | 第26-27页 |
| 1.3.2 海洋拟杆菌的丰度 | 第27页 |
| 1.4 海洋拟杆菌的生态学意义 | 第27-30页 |
| 1.4.1 海洋拟杆菌对有机质的降解 | 第27-29页 |
| 1.4.2 海洋拟杆菌的生态学功能 | 第29-30页 |
| 1.5 本论文研究的立项依据 | 第30-32页 |
| 第二章 海洋细菌的富集培养及分离 | 第32-52页 |
| 引言 | 第32页 |
| 2.1 实验材料和方法 | 第32-33页 |
| 2.1.1 培养基及主要试剂 | 第32-33页 |
| 2.1.2 主要仪器 | 第33页 |
| 2.2 实验方法 | 第33-35页 |
| 2.2.1 样品采集 | 第33页 |
| 2.2.2 样品处理及菌株分离 | 第33-34页 |
| 2.2.3 菌株的分离纯化与保藏 | 第34页 |
| 2.2.4 细菌的培养特征观察 | 第34页 |
| 2.2.5 16S rDNA序列分析 | 第34-35页 |
| 2.3 结果与分析 | 第35-47页 |
| 2.3.1 细菌的分离及形态特征 | 第35页 |
| 2.3.2 威海小石岛沉积物可培养微生物类群的多样性 | 第35-37页 |
| 2.3.3 威海金海滩沉积物可培养微生物类群的多样性 | 第37-40页 |
| 2.3.4 福建近海二都蚶养殖区沉积物可培养微生物类群的多样性 | 第40-41页 |
| 2.3.5 福建漳州红树林沉积物可培养微生物类群的多样性 | 第41-47页 |
| 2.4 讨论 | 第47-52页 |
| 第三章 海洋拟杆菌深度分支—东方龙细菌(Draconibacterium Orientalis)FH5的鉴定 | 第52-68页 |
| 引言 | 第52页 |
| 3.1 实验材料 | 第52-53页 |
| 3.1.1 材料 | 第52-53页 |
| 3.1.2 实验菌株及来源 | 第53页 |
| 3.2 实验方法 | 第53-59页 |
| 3.2.1 菌株FH5的16S rDNA序列测定和分析 | 第53-56页 |
| 3.2.2 菌株表型特征鉴定 | 第56页 |
| 3.2.3 菌株生理生化鉴定 | 第56-58页 |
| 3.2.4 菌株API快速鉴定 | 第58页 |
| 3.2.5 脂肪酸含量分析 | 第58页 |
| 3.2.6 DNA(G+C)mol%含量测定 | 第58页 |
| 3.2.7 醌和极性脂分析 | 第58-59页 |
| 3.2.8 DNA-DNA杂交分析 | 第59页 |
| 3.3 结果与分析 | 第59-64页 |
| 3.3.1 菌株FH5形态特征 | 第59页 |
| 3.3.2 菌株FH5的生理生化特征 | 第59-61页 |
| 3.3.3 菌株FH5的脂肪酸含量 | 第61页 |
| 3.3.4 菌株FH5的DNA(G+C)mol%含量 | 第61-62页 |
| 3.3.5 菌株FH5的醌类型及极性脂分析 | 第62页 |
| 3.3.6 DNA-DNA杂交结果 | 第62页 |
| 3.3.7 菌株FH5 16S rdNA测序结果及分析 | 第62-63页 |
| 3.3.8 龙细菌科Draconibacteriaceae新科的描述 | 第63页 |
| 3.3.9 龙细菌属Draconibacterium新属的描述 | 第63-64页 |
| 3.3.10 东方龙细菌Draconibacterium orientalis新种描述 | 第64页 |
| 3.4 讨论 | 第64-68页 |
| 第四章 海洋拟杆菌新属新种——海洋黄色滑动菌Flavilabilia marina HY2的鉴定 | 第68-82页 |
| 引言 | 第68页 |
| 4.1 实验材料 | 第68页 |
| 4.1.1 培养基及主要试剂 | 第68页 |
| 4.1.2 实验菌株及来源 | 第68页 |
| 4.2 实验方法 | 第68-70页 |
| 4.2.1 菌株16S rDNA序列测定 | 第69页 |
| 4.2.2 菌株形态特征鉴定 | 第69页 |
| 4.2.3 菌株的基本生理生化鉴定 | 第69页 |
| 4.2.4 API鉴定系统 | 第69页 |
| 4.2.5 脂肪酸含量测定 | 第69页 |
| 4.2.6 DNA(G+C)mol%含量测定 | 第69页 |
| 4.2.7 菌株HY2的醌类型分析 | 第69-70页 |
| 4.2.8 极性脂分析 | 第70页 |
| 4.3 结果与分析 | 第70-77页 |
| 4.3.1 菌株HY2形态特征 | 第70-71页 |
| 4.3.2 菌株HY2的生理生化特征 | 第71-72页 |
| 4.3.3 菌株HY2的脂肪酸分析 | 第72页 |
| 4.3.4 菌株HY2的DNA(G+C)mol%含量 | 第72-73页 |
| 4.3.5 菌株HY2的酣类型分析 | 第73-74页 |
| 4.3.6 菌株HY2极性脂结果分析 | 第74-75页 |
| 4.3.7 菌株HY2 16S rDNA测序结果及分析 | 第75-76页 |
| 4.3.8 黄色滑动菌属Flavilabilia新属的描述 | 第76页 |
| 4.3.9 海洋黄色滑动菌Flavilabilia marina新种的描述 | 第76-77页 |
| 4.4 讨论 | 第77-82页 |
| 第五章 海洋细菌新种威海黄色滑动菌Flavilabilia weihaiensis HY3的鉴定以及发酵噬纤维菌Cytophaga fermentans分类地位修订 | 第82-94页 |
| 引言 | 第82页 |
| 5.1 实验材料 | 第82-83页 |
| 5.1.1 培养基及主要试剂 | 第82页 |
| 5.1.2 实验菌株及来源 | 第82-83页 |
| 5.2 实验方法 | 第83页 |
| 5.2.1 实验菌株16S rDNA鉴定 | 第83页 |
| 5.2.2 菌株形态特征鉴定 | 第83页 |
| 5.2.3 菌株经典生理生化鉴定 | 第83页 |
| 5.2.4 API鉴定系统 | 第83页 |
| 5.2.5 脂肪酸含量测定 | 第83页 |
| 5.2.6 菌株DNA(G+C)mol%含量测定 | 第83页 |
| 5.2.7 醌及极性脂类型分析 | 第83页 |
| 5.3 结果与分析 | 第83-91页 |
| 5.3.1 菌株HY3和DSM 9555的表型特征 | 第84页 |
| 5.3.2 菌株HY3和DSM 9555生理生化特征 | 第84-86页 |
| 5.3.3 菌株HY3和DSM 9555的脂肪酸含量分析 | 第86页 |
| 5.3.4 菌株HY3 DNA(G+C)mol%含量分析 | 第86-87页 |
| 5.3.5 菌株HY3的醌类型分析 | 第87-88页 |
| 5.3.6 菌株HY3和DSM 9555极性脂结果分析 | 第88-89页 |
| 5.3.7 HY3和DSM 9555 16S rDNA测序结果及分析 | 第89-90页 |
| 5.3.8 威海黄色滑动菌Flavilabilia weihaiensis新种的描述 | 第90-91页 |
| 5.4 讨论 | 第91-94页 |
| 结论与展望 | 第94-96页 |
| 参考文献 | 第96-108页 |
| 致谢 | 第108-110页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第110-111页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第111页 |
