利用miRNA表达谱构建miRNA-基因调控网络
| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 符号对照表 | 第11-12页 |
| 缩略语对照表 | 第12-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-21页 |
| 1.1 研究背景 | 第15-16页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第16-19页 |
| 1.3 研究内容及意义 | 第19页 |
| 1.4 文章结构 | 第19-21页 |
| 第二章 背景知识综述 | 第21-33页 |
| 2.1 TCGA数据库及PanCancer项目 | 第21-24页 |
| 2.2 STRING数据库 | 第24-26页 |
| 2.3 Cytoscape软件 | 第26-27页 |
| 2.4 miRNA靶向技术 | 第27-28页 |
| 2.5 miRNA筛选方法 | 第28-31页 |
| 2.5.1 T检验 | 第29-30页 |
| 2.5.2 倍数变化 | 第30页 |
| 2.5.3 数据预处理 | 第30-31页 |
| 2.6 本章小结 | 第31-33页 |
| 第三章 PanCancer-miRNA网络 | 第33-39页 |
| 3.1 miRNA数据采集和处理 | 第33-34页 |
| 3.2 构建PanCancer-miRNA网络 | 第34-36页 |
| 3.3 皮尔森相关性网络 | 第36-37页 |
| 3.4 网络分析 | 第37-38页 |
| 3.5 本章小结 | 第38-39页 |
| 第四章 miRNA-基因调控网络 | 第39-59页 |
| 4.1 挖掘多种癌症共有的miRNA共调控模块 | 第39-43页 |
| 4.1.1 筛选强相关miRNA | 第39-40页 |
| 4.1.2 建立miRNA强相关模块 | 第40-42页 |
| 4.1.3 建立miRNA共调控网络 | 第42-43页 |
| 4.2 miRNA靶基因筛选及分析 | 第43-52页 |
| 4.2.1 筛选靶基因 | 第43-46页 |
| 4.2.2 靶基因富集分析 | 第46-52页 |
| 4.3 构建miRNA-基因调控网络 | 第52-57页 |
| 4.3.1 靶基因之间的联系 | 第52-54页 |
| 4.3.2 建立miRNA-基因调控网络 | 第54-55页 |
| 4.3.3 网络分析 | 第55-57页 |
| 4.4 本章小结 | 第57-59页 |
| 第五章 总结和展望 | 第59-61页 |
| 5.1 研究结论 | 第59页 |
| 5.2 研究展望 | 第59-61页 |
| 附录A miR-590 靶基因的GO富集结果 | 第61-62页 |
| 附录B miR-141 靶基因的GO富集结果 | 第62-64页 |
| 附录C miR-19a靶基因的GO富集结果 | 第64-65页 |
| 附录D miR-93 靶基因的GO富集结果 | 第65-66页 |
| 附录E miR-96 靶基因的GO富集结果 | 第66-68页 |
| 附录F miR-130b靶基因的GO富集结果 | 第68-71页 |
| 附录G miR-345 靶基因的GO富集结果 | 第71-73页 |
| 附录H miR-18a靶基因的GO富集结果 | 第73-75页 |
| 参考文献 | 第75-81页 |
| 致谢 | 第81-83页 |
| 作者简介 | 第83-84页 |
