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野生和饲养动物骨骼肌基因的甲基化水平差异及其对来源鉴别的意义

摘要第4-5页
Abstract第5页
1 绪论第10-18页
    1.1 广泛利用的野生动物制品第10-11页
    1.2 开发利用对野外种群的影响第11-12页
    1.3 野生动物养殖业的利与弊第12-13页
        1.3.1 野生动物养殖业的保护作用第12页
        1.3.2 人工养殖业带来的新问题第12-13页
    1.4 野生动物制品来源鉴别的策略与方法第13-15页
        1.4.1 形态学分析第13-14页
        1.4.2 生理变化分析第14-15页
    1.5 新方法研究思路第15-18页
        1.5.1 理论推想第15页
        1.5.2 技术路线第15-18页
2 利用α-辅肌动蛋白-3 的启动子甲基化水平鉴别野生与人工饲养的北美水貂第18-25页
    2.1 引言第18页
    2.2 材料与方法第18-21页
        2.2.1 ACTN3启动子区域的克隆及其CpG岛的预测第18-19页
        2.2.2 水貂ACTN3启动子区域的甲基化分析第19-21页
        2.2.3 数据分析第21页
    2.3 结果第21-22页
        2.3.1 ACTN3启动子区域及检测位点第21-22页
        2.3.2 ACTN3启动子区域的甲基化程度第22页
        2.3.3 利用基因甲基化程度判别样品来源的有效性第22页
    2.4 讨论第22-24页
        2.4.1 利用ACTN3启动子甲基化程度鉴别动物骨骼肌来源的有效性第22-24页
        2.4.2 利用基因甲基化水平的组间差异鉴别动物骨骼肌来源的可行性第24页
    2.5 本章小结第24-25页
3 野生与饲养王锦蛇骨骼肌基因组甲基化水平差异的研究第25-40页
    3.1 引言第25页
    3.2 材料与方法第25-31页
        3.2.1 总DNA的酶切与测序第25-27页
        3.2.2 MethylRAD数据统计第27页
        3.2.3 王锦蛇基因组的重测序第27-30页
        3.2.4 重测序数据处理第30-31页
        3.2.5 数据评估与拼接第31页
    3.3 结果第31-37页
        3.3.1 MethylRAD检测结果分析第31-34页
        3.3.2 重测序结果分析第34-35页
        3.3.3 MethylRAD检测序列的定位与分析第35-37页
    3.4 讨论第37-39页
        3.4.1 重测序分析第37页
        3.4.2 具有极端组间甲基化水平差异但多拷贝的检测序列应用第37-38页
        3.4.3 MethylRAD技术筛选骨骼肌来源鉴别基因的优越性第38页
        3.4.4 MethylRAD技术的局限性第38-39页
        3.4.5 后续工作第39页
    3.5 本章小结第39-40页
结论第40-41页
参考文献第41-46页
附录第46-51页
攻读学位期间发表的学术论文第51-52页
致谢第52-53页

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