约束满足问题研究及其在蛋白质结构预测中的应用
| 提要 | 第4-5页 |
| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第1章 绪论 | 第11-16页 |
| 1.1 研究背景 | 第11-12页 |
| 1.2 研究现状 | 第12-13页 |
| 1.3 本文主要内容 | 第13-16页 |
| 第2章 约束满足问题背景知识 | 第16-33页 |
| 2.1 约束满足问题 | 第16-17页 |
| 2.2 回溯搜索与分支策略 | 第17-19页 |
| 2.3 约束传播 | 第19-26页 |
| 2.3.1 弧相容 | 第20-23页 |
| 2.3.2 最大受限路径相容 | 第23-25页 |
| 2.3.3 Singleton弧相容 | 第25页 |
| 2.3.4 k-相容 | 第25-26页 |
| 2.4 启发式搜索 | 第26-30页 |
| 2.4.1 dom/wdeg启发式 | 第26-27页 |
| 2.4.2 基于影响的启发式 | 第27-28页 |
| 2.4.3 基于活跃度的启发式 | 第28-29页 |
| 2.4.4 基于计数的启发式 | 第29页 |
| 2.4.5 重新搜索 | 第29-30页 |
| 2.5 求解约束满足问题的算法框架 | 第30-33页 |
| 第3章 弧相容算法研究 | 第33-53页 |
| 3.1 避免粗粒度弧相容算法中冗余的修正检查 | 第33-40页 |
| 3.1.1 冗余检查 | 第33-36页 |
| 3.1.2 相关工作讨论 | 第36页 |
| 3.1.3 实验结果 | 第36-39页 |
| 3.1.4 本节小结 | 第39-40页 |
| 3.2 负表约束上的表缩减广泛弧相容算法 | 第40-53页 |
| 3.2.1 正表约束上的表缩减算法 | 第40-44页 |
| 3.2.2 负表约束上的表缩减算法 | 第44-46页 |
| 3.2.3 优化 STR-Negative 算法 | 第46-48页 |
| 3.2.4 实验结果 | 第48-52页 |
| 3.2.5 本节小结 | 第52-53页 |
| 第4章 概率最大受限路径相容研究 | 第53-62页 |
| 4.1 概率最大受限路径相容 | 第53-57页 |
| 4.2 相关工作讨论 | 第57-58页 |
| 4.3 实验结果 | 第58-61页 |
| 4.4 本章小结 | 第61-62页 |
| 第5章 约束松紧度在变量启发式中的应用 | 第62-76页 |
| 5.1 在度启发式中整合约束松紧度 | 第62-64页 |
| 5.2 计算约束松紧度 | 第64-67页 |
| 5.2.1 基于位操作计算二元约束动态松紧度 | 第64-66页 |
| 5.2.2 基于随机采样估计动态约束松紧度 | 第66-67页 |
| 5.2.3 其他方法 | 第67页 |
| 5.3 实验结果 | 第67-75页 |
| 5.4 本章小结 | 第75-76页 |
| 第6章 约束满足问题在蛋白质结构预测中的应用 | 第76-95页 |
| 6.1 蛋白质三级结构预测中模板组合问题 | 第77-80页 |
| 6.2 基于约束满足的模板组合问题 | 第80-89页 |
| 6.2.1 问题建模 | 第80-81页 |
| 6.2.2 问题求解 | 第81-86页 |
| 6.2.3 过约束问题 | 第86-89页 |
| 6.3 实验结果 | 第89-93页 |
| 6.3.1 求解约束满足问题测试 | 第89-91页 |
| 6.3.2 预测蛋白结构测试 | 第91-93页 |
| 6.4 本章小结 | 第93-95页 |
| 第7章 结论与展望 | 第95-97页 |
| 参考文献 | 第97-105页 |
| 作者简介及在学期间取得主要科研成果 | 第105-106页 |
| 致谢 | 第106页 |
