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基于iTRAQ比较镉积累不同的大豆品种间籽粒蛋白质组的差异

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
缩写词及其英汉对照第7-10页
1 文献综述第10-16页
    1.1 大豆籽粒的营养价值第10页
    1.2 土壤镉污染与大豆生产第10-11页
    1.3 镉对大豆籽粒发育的影响第11页
    1.4 蛋白质组技术在大豆籽粒发育和镉胁迫研究中的应用第11-14页
        1.4.1 蛋白质组学简介第12页
        1.4.2 蛋白质组在大豆籽粒发育研究中的应用第12-13页
        1.4.3 蛋白质组在大豆镉胁迫研究中的进展第13-14页
    1.5 研究目的和意义第14-15页
    1.6 技术路线第15-16页
2 材料和方法第16-25页
    2.1 试验材料第16页
    2.2 材料处理方法第16页
    2.3 蛋白质的提取第16-17页
    2.4 蛋白质浓度测量——Bradford定量第17页
    2.5 SDS-PAGE电泳检测第17-19页
        2.5.1 凝胶的制备和电泳第17-18页
        2.5.2 考马斯亮兰染色法染色第18-19页
    2.6 蛋白质酶解第19页
    2.7 iTRAQ标记第19页
    2.8 SCX分离第19页
    2.9 基于Triple TOF 5600 的LC-ESI-MSMS分析第19-20页
    2.10 蛋白鉴定第20-21页
    2.11 蛋白功能注释、GO和KEGG分析第21-22页
    2.12 qPCR验证第22-23页
        2.12.1 RNA提取第22页
        2.12.2 去DNA与mRNA的反转第22页
        2.12.3 定量 PCR 分析第22-23页
    2.13 数据统计分析与作图第23-25页
3 结果第25-105页
    3.1 品种间差异蛋白的分析第25-54页
        3.1.1 品种间差异蛋白的分布第25-51页
        3.1.2 品种间差异蛋白的GO分析第51页
        3.1.3 品种间差异蛋白的表达模式分析第51-54页
    3.2 同一品种中镉响应蛋白的分析第54-89页
        3.2.1 同一品种中镉响应蛋白的分布第54-86页
        3.2.2 同一品种中镉响应蛋白的GO分析第86页
        3.2.3 同一品种中镉响应蛋白的表达模式分析第86-89页
    3.3 品种间差异和响应蛋白的整合分析第89-101页
        3.3.1 品种间差异和响应蛋白的分布第89-90页
        3.3.2 品种间共有的蛋白第90-93页
        3.3.3 品种特异的蛋白第93-98页
        3.3.4 镉胁迫下品种间差异蛋白的GO富集分析第98页
        3.3.5 镉胁迫下品种间差异蛋白的KEGG Pathway富集分析第98-99页
        3.3.6 过氧化物酶体代谢通路的分析第99-101页
    3.4 qPCR结果分析第101-105页
4 讨论与结论第105-118页
    4.1 讨论第105-116页
        4.1.1 镉胁迫下大豆籽粒发育中差异表达的蛋白第105-106页
        4.1.2 与主要的金属离子有关的差异蛋白表达模式第106-108页
        4.1.3 与镉积累分子机制有关的蛋白第108-115页
        4.1.4 蛋白质组与转录组间的关系第115-116页
    4.2 结论第116-118页
致谢第118-119页
参考文献第119-127页
附录第127-162页

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