摘要 | 第5-6页 |
ABSTRACT | 第6页 |
第1章 绪论 | 第9-20页 |
1.1 本课题研究背景和意义 | 第9-10页 |
1.2 数据挖掘在禽流感领域的研究现状 | 第10-17页 |
1.3 主要研究内容 | 第17-19页 |
1.4 论文的组织与结构 | 第19-20页 |
第2章 相关理论与方法 | 第20-24页 |
2.1 数据挖掘方法 | 第20-21页 |
2.2 分析工具 | 第21-23页 |
2.3 数据挖掘模型建立 | 第23-24页 |
第3章 对禽流感HA蛋白功能位点的分析 | 第24-33页 |
3.1 HA蛋白序列与空间结构的数据挖掘 | 第24-28页 |
3.2 禽流感HA蛋白糖基化位点信息的数据挖掘 | 第28-29页 |
3.3 禽流感HA蛋白糖基化位点信息的分析 | 第29-32页 |
3.3.1 人类以及禽类禽流感糖基化位点信息的对比分析 | 第29页 |
3.3.2 不同亚型HA蛋白糖基化位点信息的分析 | 第29-32页 |
3.4 本章小结 | 第32-33页 |
第4章 对禽流感HA蛋白序列的特异性分析 | 第33-41页 |
4.1 不同亚型的禽流感HA蛋白的对序列比对 | 第33-35页 |
4.1.1 H1型禽流感病毒HA蛋白的多序列比对 | 第33-34页 |
4.1.2 将人类H1禽流感病毒进HA蛋白行多序列比对 | 第34-35页 |
4.2 禽类与人类禽流感病毒的多序列比对结果进行对比分析 | 第35-36页 |
4.3 使用R建立禽流感毒株跨宿主能力的支持向量机分类模型 | 第36-41页 |
第5章 对禽流感病毒毒株的分类效果评估与预测 | 第41-53页 |
5.1 序列相似性分析 | 第41-44页 |
5.2 不同蛋白的氨基酸残基序列数据挖掘分析 | 第44-46页 |
5.3 不同毒力的氨基酸使用偏好性分析 | 第46-53页 |
第6章 构建的分类模型效果验证 | 第53-58页 |
6.1 支持向量机方法的跨宿主能力分类效果 | 第53-55页 |
6.2 支持向量机方法的毒力分类效果 | 第55-57页 |
6.3 使用交叉验证对模型预测能力的评估 | 第57-58页 |
第7章 总结和展望 | 第58-60页 |
7.1 论文总结 | 第58页 |
7.2 展望 | 第58-60页 |
参考文献 | 第60-64页 |
致谢 | 第64页 |