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基于数据挖掘的禽流感病毒传播能力与毒性分析

摘要第5-6页
ABSTRACT第6页
第1章 绪论第9-20页
    1.1 本课题研究背景和意义第9-10页
    1.2 数据挖掘在禽流感领域的研究现状第10-17页
    1.3 主要研究内容第17-19页
    1.4 论文的组织与结构第19-20页
第2章 相关理论与方法第20-24页
    2.1 数据挖掘方法第20-21页
    2.2 分析工具第21-23页
    2.3 数据挖掘模型建立第23-24页
第3章 对禽流感HA蛋白功能位点的分析第24-33页
    3.1 HA蛋白序列与空间结构的数据挖掘第24-28页
    3.2 禽流感HA蛋白糖基化位点信息的数据挖掘第28-29页
    3.3 禽流感HA蛋白糖基化位点信息的分析第29-32页
        3.3.1 人类以及禽类禽流感糖基化位点信息的对比分析第29页
        3.3.2 不同亚型HA蛋白糖基化位点信息的分析第29-32页
    3.4 本章小结第32-33页
第4章 对禽流感HA蛋白序列的特异性分析第33-41页
    4.1 不同亚型的禽流感HA蛋白的对序列比对第33-35页
        4.1.1 H1型禽流感病毒HA蛋白的多序列比对第33-34页
        4.1.2 将人类H1禽流感病毒进HA蛋白行多序列比对第34-35页
    4.2 禽类与人类禽流感病毒的多序列比对结果进行对比分析第35-36页
    4.3 使用R建立禽流感毒株跨宿主能力的支持向量机分类模型第36-41页
第5章 对禽流感病毒毒株的分类效果评估与预测第41-53页
    5.1 序列相似性分析第41-44页
    5.2 不同蛋白的氨基酸残基序列数据挖掘分析第44-46页
    5.3 不同毒力的氨基酸使用偏好性分析第46-53页
第6章 构建的分类模型效果验证第53-58页
    6.1 支持向量机方法的跨宿主能力分类效果第53-55页
    6.2 支持向量机方法的毒力分类效果第55-57页
    6.3 使用交叉验证对模型预测能力的评估第57-58页
第7章 总结和展望第58-60页
    7.1 论文总结第58页
    7.2 展望第58-60页
参考文献第60-64页
致谢第64页

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