基于转录组测序的石磺科贝类SSR和SNP两种分子标记的开发
| 摘要 | 第4-7页 |
| ABSTRACT | 第7-8页 |
| 引言 | 第12-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-20页 |
| 1 石磺科贝类研究进展 | 第14-15页 |
| 1.1 石磺科贝类简介 | 第14页 |
| 1.2 石磺科贝类的研究现状 | 第14-15页 |
| 2 微卫星分子标记开发与应用 | 第15-16页 |
| 2.1 微卫星标记简介 | 第15页 |
| 2.2 微卫星筛选方法 | 第15-16页 |
| 3 SNP标记的研究进展 | 第16-19页 |
| 3.1 SNP标记简介 | 第16-17页 |
| 3.2 SNP筛选分型方法 | 第17-18页 |
| 3.3 SNP分子标记在群体进化研究中的应用 | 第18-19页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第19-20页 |
| 第二章 里氏拟石磺SSR分子标记的开发 | 第20-30页 |
| 1 材料与方法 | 第20-24页 |
| 1.1 实验材料 | 第20-21页 |
| 1.2 实验仪器及试剂 | 第21-22页 |
| 1.2.1 实验仪器 | 第21页 |
| 1.2.2 实验试剂 | 第21-22页 |
| 1.3 实验方法 | 第22-24页 |
| 1.3.1 微卫星序列的来源及筛选 | 第22页 |
| 1.3.2 EST-SSR位点的引物设计 | 第22页 |
| 1.3.3 DNA的提取与检测 | 第22页 |
| 1.3.4 SSR引物的初步筛选 | 第22-23页 |
| 1.3.5 PCR扩增 | 第23页 |
| 1.3.6 产物检测 | 第23-24页 |
| 1.3.7 数据统计与分析 | 第24页 |
| 2 结果与分析 | 第24-29页 |
| 2.1 里氏拟石磺转录组测序结果 | 第24-25页 |
| 2.2 EST—SSR的类型和频率统计 | 第25-26页 |
| 2.3 引物筛选结果统计 | 第26-27页 |
| 2.4 里氏拟石磺湛江群体遗传多样性分析 | 第27-29页 |
| 3 讨论 | 第29-30页 |
| 第三章 平疣桑椹石磺SSR分子标记的开发 | 第30-40页 |
| 1 材料与方法 | 第30-31页 |
| 1.1 实验材料 | 第30-31页 |
| 1.2 实验仪器及试剂 | 第31页 |
| 1.3 实验方法 | 第31页 |
| 2 结果与分析 | 第31-39页 |
| 2.1 平疣桑椹石磺转录组测序结果 | 第31页 |
| 2.2 EST—SSR的类型和频率统计 | 第31-33页 |
| 2.3 引物筛选结果统计 | 第33-34页 |
| 2.4 平疣桑椹石磺湛江群体遗传多样性分析 | 第34-39页 |
| 3 讨论 | 第39-40页 |
| 第四章 瘤背石磺SNP分子标记的开发 | 第40-54页 |
| 1 材料及方法 | 第40-43页 |
| 1.1 样品采集 | 第40页 |
| 1.2 实验材料 | 第40-41页 |
| 1.3 实验方法 | 第41-43页 |
| 2 实验结果及分析 | 第43-52页 |
| 2.1 测序及分析结果 | 第43页 |
| 2.2 引物筛选结果 | 第43-47页 |
| 2.3 SNP位点多态性统计分析 | 第47-50页 |
| 2.4 SNP位点基因功能预测 | 第50-52页 |
| 3 讨论 | 第52-54页 |
| 小结 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-63页 |
| 附录 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |
