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罗汉松科、山茶科和红豆杉科植物内生拟盘多毛孢的多样性及拟盘多毛孢属分子系统学研究

致谢第5-12页
中文摘要第12-17页
Abstract第17页
第一章 文献综述第23-53页
    第一节 植物内生真菌的多样性第23-34页
        1 内生菌的定义第23-26页
        2 内生真菌的分离与培养第26-28页
        3 植物内生真菌的类群第28-29页
            3.1 禾本科植物的内生真菌类群第28页
            3.2 非禾本科植物的内生真菌类群第28-29页
            3.3 木本植物的内生真菌第29页
        4 内生真菌的生态多样性第29-30页
        5 内生真菌的生态作用第30-31页
        6 内生真菌的代谢产物第31-32页
        7 我国内生真菌的研究简况第32-34页
    第二节 植物内生拟盘多毛孢的研究进展第34-41页
        1 内生拟盘多毛孢的种类和生态多样性第35-38页
            1.1 种类及其宿主植物第35-36页
            1.2 内生拟盘多毛孢的生态多样性第36-38页
        2 植物内生拟盘多毛孢代谢产物的多样性第38-41页
            2.1 抗癌物质第38-39页
                2.1.1 紫杉醇(taxol)第38页
                2.1.2 粗榧酸(torreyanic acid)第38-39页
            2.2 抗菌物质第39页
                2.2.1 环己烷类物质(cyclohexenone)第39页
                2.2.2 pestaloside(一种糖苷类物质)第39页
                2.2.3 粗榧酸第39页
            2.3 其他代谢产物第39-41页
    第三节 拟盘多毛孢属的分类学及分子系统学研究概况第41-52页
        1 拟盘多毛孢属的分类第41-46页
            1.1 拟盘多毛孢属(Pestalotiopsis)及相关属的划分第41-42页
            1.2 拟盘多毛孢属的分类第42-44页
                1.2.1 Steyaert的分类系统第42-43页
                1.2.2 Guba的分类系统第43页
                1.2.3 Nag Raj的分类系统第43-44页
            1.3 拟盘多毛孢属真菌无性态与有性态之间的联系第44页
            1.4 中国拟盘多毛孢菌的研究概况第44-45页
            1.5 存在的问题第45-46页
        2 拟盘多毛孢属的分子系统学研究第46-52页
            2.1 分子系统学的定义第46页
            2.2 分子系统学的基本方法第46-47页
            2.3 分子系统学方法在真菌分类上的应用第47-50页
                2.3.1 传统真菌形态分类遇到的问题第47-48页
                2.3.2 分子系统学方法在真菌分类上应用的成果第48页
                2.3.3 我国在真菌分子系统学的进展第48-50页
            2.4 分子系统学方法在拟盘多毛孢属上的运用第50-51页
                2.4.1 可溶性蛋白电泳在拟盘多毛孢鉴定上的应用第50页
                2.4.2 rDNA序列在拟盘多毛孢及相关属分类上的应用第50-51页
                2.4.3 DNA序列在拟盘多毛孢属分类上的应用第51页
            2.5 存在的问题第51-52页
    第四节 本研究的目的第52-53页
第二章 内生拟盘多毛孢的资源调查第53-77页
    第一节 内生拟盘多毛孢的种类鉴定第53-64页
        1 材料与方法第53-54页
            1.1 采集标本的地点第53页
            1.2 采集的植物第53页
            1.3 内生拟盘多毛孢的分离与鉴定第53-54页
        2 结果第54-62页
        3 讨论第62-63页
            3.1 现有拟盘多毛孢属的分类系统尚不够完善第62-63页
            3.2 拟盘多毛孢顶端附属丝长度与种的关系第63页
        4 小结第63-64页
    第二节 内生拟盘多毛孢的新种和新纪录种第64-77页
        1 杭州拟盘多毛孢(新种)第64-67页
        2 昆明拟盘多毛孢(新种)第67-71页
        3 云南拟盘多毛孢(新种)第71-74页
        4 卡斯特尼拟盘多毛孢(中国新记录)第74-77页
第三章 植物内生拟盘多毛孢的多样性第77-93页
    1 材料与方法第77-78页
        1.1 调查地点及其生态环境第77页
        1.2 取样及分离方法第77-78页
        1.3 多样性分析方法第78页
    2 结果与分析第78-91页
        2.1 不同寄主植物的内生拟盘多毛孢物种多样性比较第78-79页
        2.2 三科植物常见种的内生拟盘多毛孢定殖率的比较第79-81页
        2.3 植物内生拟盘多毛孢定殖率与年龄的关系第81-84页
            2.3.1 三种山茶科植物枝条内生拟盘多毛孢定殖率与年龄的关系第81-82页
            2.3.2 山茶内生拟盘多毛孢定殖率与年龄的关系第82-83页
            2.3.3 罗汉松内生拟盘多毛孢定殖率与年龄的关系第83-84页
        2.4 不同采样点内生拟盘多毛孢定殖率的比较第84-86页
            2.4.1 不同采样点山茶内生拟盘多毛孢定殖率的比较第84-85页
            2.4.2 不同采样点山茶罗汉松拟盘多毛孢定殖率的比较第85-86页
        2.5 三科植物内生拟盘多毛孢的多样性分析第86-88页
            2.5.1 三科植物内生拟盘多毛孢的物种组成第86-88页
            2.5.2 三科植物内生拟盘多毛孢的多样性分析第88页
            2.5.3 三科植物内生拟盘多毛孢的物种相似性分析第88页
        2.6 三个城市植物内生拟盘多毛孢的多样性分析第88-91页
            2.6.1 三个城市植物内生拟盘多毛孢的物种组成第88-90页
            2.6.2 三个城市植物内生拟盘多毛孢的物种多样性分析第90页
            2.6.3 三个城市植物内生拟盘多毛孢的物种相似性分析第90-91页
    3 讨论第91-92页
        3.1 内生拟盘多毛孢的物种多样性第91页
        3.2 内生拟盘多毛孢的专化性第91页
        3.3 内生拟盘多毛孢的定殖率因植物种类、器官及调查点而异第91-92页
        3.4 内生拟盘多毛孢的多样性指数第92页
    4 小结第92-93页
第四章 拟盘多毛孢属形态学分类性状研究第93-126页
    1 材料与方法第93-97页
        1.1 不同基物对拟盘多毛孢分生孢子形态特征的影响第93-94页
        1.2 同一种拟盘多毛孢不同菌株在三种不同基物上的形态指标变化规律第94-95页
        1.3 康乃馨组织上不同无性世代分生孢子的形态指标变化第95-96页
        1.4 分生孢子果(conidiomata)的结构第96页
        1.5 培养性状观察第96-97页
    2 结果与分析第97-120页
        2.1 三种基物对拟盘多毛孢形态特征的影响第97-104页
            2.1.1 三种基物对拟盘多毛孢分生孢子有色胞颜色的影响第98页
            2.1.2 三种基物对拟盘多毛孢分生孢子长度的影响第98-99页
            2.1.3 三种基物对拟盘多毛孢分生孢子宽度的影响第99页
            2.1.4 三种基物对拟盘多毛孢分生孢子顶端附属丝长度的影响第99-100页
            2.1.5 三种基物对拟盘多毛孢分生孢子基部附属丝长度的影响第100页
            2.1.6 三种基物对拟盘多毛孢分生孢子有色胞长度的影响第100-101页
            2.1.7 三种基物对拟盘多毛孢分生孢子长宽比值的影响第101页
            2.1.8 三种基物对拟盘多毛孢分生孢子顶生附属丝数量的影响第101-104页
        2.2 同种拟盘多毛孢不同菌株在三种不同基质上形成的分生孢子的形态指标变化观察结果第104-109页
            2.2.1 茶拟盘多毛孢不同菌株分生孢子长度的比较第104-105页
            2.2.2 茶拟盘多毛孢不同菌株分生孢子宽度的比较第105页
            2.2.3 茶拟盘多毛孢不同菌株分生孢子有色胞长度的比较第105-107页
            2.2.4 茶拟盘多毛孢不同菌株分生孢子顶端附属丝长度的比较第107-108页
            2.2.5 茶拟盘多毛孢不同菌株分生孢子基部附属丝长度的比较第108页
            2.2.6 茶拟盘多毛孢不同菌株分生孢子长宽比值的比较第108-109页
        2.3 不同无性世代的分生孢子的形态指标变化观察结果第109-116页
            2.3.1 四个无性世代间拟盘多毛孢分生孢子长度的变化第112页
            2.3.2 四个无性世代间拟盘多毛孢分生孢子宽度的变化第112页
            2.3.3 四个无性世代间拟盘多毛孢分生孢子色胞颜色的变化第112页
            2.3.4 四个无性世代间拟盘多毛孢分生孢子顶生附属丝长度的变化第112-116页
            2.3.5 四个无性世代间拟盘多毛孢分生孢子长宽比值的变化第116页
        2.4 拟盘多毛孢分生孢子果(conidiomata)类型第116-120页
        2.5 培养性状的观察结果第120页
    3 讨论第120-124页
        3.1 培养基物和培养条件标准化是拟盘多毛孢属分类的基础第120-122页
        3.2 拟盘多毛孢菌的鉴定应采用单孢纯培养物第122页
        3.3 拟盘多毛孢属真菌的分生孢子果的结构第122-123页
        3.4 拟盘多毛孢的稳定特征第123页
        3.5 拟盘多毛孢属的不稳定特征第123-124页
    4 小结第124-126页
第五章 拟盘多毛孢属的分子系统学研究第126-173页
    第一节 拟盘多毛孢属种间的分子系统关系第126-156页
        1 材料与方法第127-134页
            1.1 材料第127-131页
                1.1.1 供试菌种第127-131页
                1.1.2 仪器第131页
                1.1.3 试剂第131页
            1.2 方法第131-134页
                1.2.1 菌体培养第131-132页
                1.2.2 基因组DNA提取第132-133页
                1.2.3 ITS区和5.8S基因的PCR扩增第133页
                1.2.4 PCR产物测序第133页
                1.2.5 DNA序列数据分析第133-134页
        2 结果与分析第134-145页
            2.1 拟盘多毛孢属系统发育树的结构第138页
            2.2 拟盘多毛孢属系统发育树的代表序列的同源性比较第138-140页
            2.3 拟盘多毛孢属分子系统树的分支与形态特征的关系第140-145页
            2.4 从分子系统发育树看拟盘多毛孢属形态学分类性状的重要性第145页
        3 讨论第145-154页
            3.1 分子系统发育树反映拟盘多毛孢属的自然分类框架第145-146页
            3.2 分生孢子的性状特征在拟盘多毛孢属分类中的作用第146-148页
            3.3 以形态特征和分子系统树相结合衡量拟盘多毛孢属的种第148-150页
            3.4 以系统发育树为基础建立拟盘多毛孢属的分类检索表第150-154页
        4 小结第154-156页
    第二节 内生拟盘多毛孢与病原拟盘多毛孢的关系第156-164页
        1 材料与方法第156-158页
            1.1 内生与病原拟盘多毛孢的资源调查第156页
            1.2 供试菌株第156页
            1.3 仪器和试剂第156页
            1.4 方法第156-158页
        2 结果与分析第158-162页
            2.1 内生与病原拟盘多毛孢资源第158-160页
            2.2 内生与病原拟盘多毛孢的分子系统学关系第160-162页
                2.2.1 拟盘多毛孢属分子系统树的基本框架第160页
                2.2.2 罗汉松科植物的内生拟盘多毛孢和病原拟盘多毛孢的关系第160-161页
                2.2.3 山茶科内生与病原拟盘多毛孢的关系第161页
                2.2.4 马尾松内生与病原拟盘多毛孢的关系第161-162页
                2.2.5 内生茶拟盘多毛孢和病原茶拟盘多毛孢的关系第162页
                2.2.6 山茶科、罗汉松科和松科拟盘多毛孢菌株之间的关系第162页
        3 讨论第162-163页
            3.1 内生和病原拟盘多毛孢之间的关系第162-163页
            3.2 木本植物内生拟盘多毛孢的物种多样性比病原拟盘多毛孢更丰富第163页
        4 小结第163-164页
    第三节 拟盘多毛孢属与近缘属分子系统学关系第164-173页
        1 材料与方法第164-167页
            1.1 供试菌种第164-167页
            1.2 使用的仪器和方法第167页
            1.3 DNA序列数据分析第167页
        2 结果与分析第167-170页
            2.1 系统树的组成与形态特征的关系第167-168页
            2.2 有性阶段与无性阶段的联系第168页
            2.3 油松内生真菌1009菌株的归属第168-170页
        3 讨论第170-172页
            3.1 以rDNA的ITS1+5.8SrDNA+ITS2序列建立的分子系统树对拟盘多毛孢属及近缘属具有鉴别意义第170页
            3.2 拟盘多毛孢属及近缘属之间的区分特征第170-171页
            3.3 从系统树找出无性阶段与有性阶段的联系第171-172页
            3.4 从分子系统树看拟盘多毛孢属及近缘属的相互关系第172页
        4 小结第172-173页
参考文献第173-190页
附件1 博士研究生学习期间发表的论文第190-191页
附件2 分子系统树的序列第191-227页

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