基于CPU-GPU异构并行系统的SmithWaterman及HEVC加速技术研究
摘要 | 第4-5页 |
ABSTRACT | 第5页 |
第一章 绪论 | 第8-14页 |
1.1 研究背景 | 第8-11页 |
1.1.1 研究目的与意义 | 第8-9页 |
1.1.2 国内外研究现状 | 第9-11页 |
1.2 本文的研究内容及主要成果 | 第11-13页 |
1.3 论文的结构安排 | 第13-14页 |
第二章 GPU架构与CUDA模型 | 第14-28页 |
2.1 GPU架构 | 第14-17页 |
2.1.1 GPU简介 | 第14页 |
2.1.2 GPU的组成 | 第14-15页 |
2.1.3 CPU与GPU的区别与协作 | 第15-17页 |
2.2 CUDA编程模型 | 第17-21页 |
2.2.1 CUDA简介 | 第17-18页 |
2.2.2 线程管理 | 第18-19页 |
2.2.3 核函数 | 第19-20页 |
2.2.4 内存管理 | 第20-21页 |
2.3 程序移植过程 | 第21-27页 |
2.3.1 程序移植方法简介 | 第21页 |
2.3.2 第一代程序移植方法RPA | 第21-23页 |
2.3.3 第二代程序移植方法MOL | 第23-24页 |
2.3.4 第三代程序移植方法ISC | 第24-27页 |
2.4 本章小结 | 第27-28页 |
第三章 生物序列比对软件 | 第28-33页 |
3.1 生物序列比对软件简介 | 第28-29页 |
3.2 SmithWaterman | 第29-31页 |
3.3 BLAST | 第31-33页 |
第四章 GPU加速生物序列比对工具 | 第33-45页 |
4.1 GPU加速SmithWaterman算法 | 第33-39页 |
4.1.1 频率距离 | 第33-34页 |
4.1.2 CUDA-SWfr算法介绍 | 第34-36页 |
4.1.3 实验平台及测试序列 | 第36-37页 |
4.1.4 实验结果与分析 | 第37-39页 |
4.2 GPU加速BLAST算法 | 第39-45页 |
4.2.1 CUDA-BLASTN算法介绍 | 第39-43页 |
4.2.2 实验平台及测试序列 | 第43页 |
4.2.3 实验结果及分析 | 第43-45页 |
第五章 基于GPU的HEVC视频编码技术 | 第45-53页 |
5.1 HEVC简介 | 第45-46页 |
5.2 HEVC关键技术介绍 | 第46-49页 |
5.2.1 四叉树编码结构 | 第46-47页 |
5.2.2 帧内编码 | 第47页 |
5.2.3 帧间编码 | 第47-48页 |
5.2.4 环路滤波 | 第48页 |
5.2.5 熵编码 | 第48-49页 |
5.3 热点函数分析结果 | 第49-51页 |
5.4 基于GPU加速帧内编码技术 | 第51-52页 |
5.5 本章小结 | 第52-53页 |
第六章 总结与展望 | 第53-55页 |
6.1 主要工作总结 | 第53-54页 |
6.2 展望 | 第54-55页 |
参考文献 | 第55-59页 |
发表论文和参加科研情况说明 | 第59-60页 |
致谢 | 第60-61页 |