| 中文摘要 | 第10-12页 |
| 英文摘要 | 第12-14页 |
| 1 前言 | 第15-28页 |
| 1.1 大豆杂种优势 | 第15-16页 |
| 1.1.1 大豆细胞质雄性不育的研究 | 第15-16页 |
| 1.1.2 大豆杂交育种的研究 | 第16页 |
| 1.2 细胞器和植物CMS之间关系的研究 | 第16-18页 |
| 1.2.1 叶绿体细胞器和植物CMS之间关系的研究 | 第16-17页 |
| 1.2.2 线粒体细胞器和植物CMS之间关系的研究 | 第17-18页 |
| 1.3 高等植物叶绿体基因组的研究 | 第18-22页 |
| 1.3.1 高等植物叶绿体基因组的起源与发现 | 第18页 |
| 1.3.2 高等植物叶绿体基因组的结构和基因图谱 | 第18-19页 |
| 1.3.3 高等植物叶绿体基因组的全测序 | 第19-20页 |
| 1.3.4 高等植物叶绿体基因的表达调控 | 第20页 |
| 1.3.5 高等植物叶绿体的RNA编辑 | 第20-21页 |
| 1.3.6 高等植物叶绿体的遗传转化 | 第21-22页 |
| 1.4 分子标记在鉴定种子纯度鉴定中的应用 | 第22-26页 |
| 1.4.1 RAPD技术 | 第22页 |
| 1.4.2 SSR技术 | 第22-24页 |
| 1.4.3 AFLP技术 | 第24页 |
| 1.4.4 SCAR技术 | 第24-25页 |
| 1.4.5 SNP/InDcl技术 | 第25-26页 |
| 1.4.6 其他技术 | 第26页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第26-28页 |
| 2 材料和方法 | 第28-43页 |
| 2.1 植物材料 | 第28-31页 |
| 2.1.1 大豆雄性不育系和保持系材料 | 第28-31页 |
| 2.1.2 提取RNA的大豆材料 | 第31页 |
| 2.2 主要试剂和仪器 | 第31-33页 |
| 2.2.1 主要试剂 | 第31-32页 |
| 2.2.2 主要仪器 | 第32-33页 |
| 2.3 技术路线 | 第33页 |
| 2.4 试验方法 | 第33-43页 |
| 2.4.1 DNA的提取 | 第33-35页 |
| 2.4.2 大豆叶绿体基因组的de novo测序 | 第35-38页 |
| 2.4.3 大豆叶绿体基因组的多态性分析 | 第38-39页 |
| 2.4.4 大豆叶绿体基因组的多态性验证 | 第39-41页 |
| 2.4.5 荧光定量PCR(qPCR)的操作流程 | 第41-43页 |
| 3 结果与分析 | 第43-73页 |
| 3.1 大豆叶绿体基因组的de novo测序 | 第43-51页 |
| 3.1.1 大豆叶绿体基因组的DNA提取 | 第43-44页 |
| 3.1.2 大豆叶绿体基因组的测序原始数据量统计 | 第44页 |
| 3.1.3 大豆叶绿体基因组的测序原始数据量过滤 | 第44-45页 |
| 3.1.4 大豆叶绿体基因组的组装 | 第45-48页 |
| 3.1.5 大豆叶绿体基因组的组装后基因组分析 | 第48-49页 |
| 3.1.6 大豆叶绿体基因组注释 | 第49-51页 |
| 3.2 大豆叶绿体基因组的多态性 | 第51-56页 |
| 3.2.1 大豆叶绿体基因组差异分析 | 第51-52页 |
| 3.2.2 SNP与InDcl的检测和注释 | 第52-56页 |
| 3.3 大豆叶绿体基因组的SNP标记开发与应用 | 第56-62页 |
| 3.3.1 大豆总DNA的提取结果 | 第56-57页 |
| 3.3.2 PCR扩增 | 第57-59页 |
| 3.3.3 限制性内切酶分析结果 | 第59-61页 |
| 3.3.4 限制性内切酶分析大豆其他类型不育细胞质的结果 | 第61页 |
| 3.3.5 限制性内切酶分析大豆杂交种的结果 | 第61-62页 |
| 3.4 筛选大豆叶绿体基因组中不育相关基因 | 第62-66页 |
| 3.4.1 位于基因编码区的SNP | 第62-65页 |
| 3.4.2 非编码区的SNP和InDel | 第65页 |
| 3.4.3 编码区InDel | 第65-66页 |
| 3.5 发生SNP的候选基因的转录表达分析 | 第66-73页 |
| 3.5.1 大豆总RNA提取结果 | 第66页 |
| 3.5.2 qPCR扩增图谱 | 第66-70页 |
| 3.5.3 qPCR扩增数据分析 | 第70-73页 |
| 4 讨论 | 第73-77页 |
| 4.1 大豆雄性不育系和保持系的叶绿体基因组测序 | 第73-74页 |
| 4.2 大豆不育系和可育的保持系的多态性分析 | 第74页 |
| 4.3 大豆不育系和可育的保持系的分子标记的开发与应用 | 第74-75页 |
| 4.4 大豆不育细胞系和可育的保持系的间SNP/InDel差异对不育的影响 | 第75-77页 |
| 5 结论 | 第77-79页 |
| 6 创新点 | 第79-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-94页 |
| 附录 | 第94-95页 |
| 攻读博士学位期间发表的学术论文 | 第95页 |
